Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 IL1RAPL1 Gene 0 0.32 20.08 0.46 0.76 0.26 0.82 0.22 0.82 1.66 0.17 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.75 0.00 2.81 1.59 1.33 0.45 2 378993 Transcript 0 0.25 27.70 0.28 1.29 0.35 0.42 0.15 2.97 2.27 0.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.91 0.00 2.92 2.50 2.11 0.16 3 302196 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4 ER1a ExonRegion 0 0.17 25.24 0.72 0.75 1.26 0.86 0.00 1.43 2.01 0.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.87 0.00 6.70 1.15 2.43 0.46 5 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 29.07 0.00 1.80 0.00 0.00 0.00 4.60 3.59 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.88 2.45 0.00 6 E2_Ab NovelBoundary 0 0.00 35.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.60 1.33 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.03 0.00 5.82 3.03 2.94 0.00 7 ER2a ExonRegion 0 0.00 29.69 0.00 1.25 0.00 0.00 0.00 5.19 2.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.77 0.00 2.98 3.17 2.25 0.00 8 ER2b ExonRegion 0 0.34 22.39 0.00 0.84 0.00 0.00 0.00 1.90 1.54 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.19 0.00 3.89 3.07 0.85 0.00 9 E2a_E3a KnownJunction 0 3.26 6.38 0.00 1.90 0.00 0.00 0.00 1.97 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.26 5.13 0.00 0.00 10 I2_SR2 SilentIntronRegion 0 0.53 19.94 1.37 1.42 0.21 0.18 0.36 1.14 2.85 0.39 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.69 0.00 1.31 0.25 0.16 0.17 11 ER3a ExonRegion 0 0.29 9.96 0.00 1.10 0.00 0.67 0.00 1.10 0.69 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.34 0.00 3.15 2.17 1.94 0.00 12 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 5.00 0.00 1.93 0.00 2.90 0.00 2.55 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.94 0.00 0.00 0.00 13 ER4a ExonRegion 0 0.58 4.98 0.00 0.20 0.00 0.00 0.00 0.30 1.51 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.90 0.60 2.37 0.00 14 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 12.70 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.82 0.00 15 ER5a ExonRegion 0 0.00 11.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.85 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.41 0.00 1.92 0.97 16 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 14.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.65 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 ER6a ExonRegion 0 0.00 8.38 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.04 1.33 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.07 0.00 1.31 0.00 18 E6a_E7a KnownJunction 0 0.00 21.71 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.55 1.53 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.26 0.00 0.00 0.00 19 I6_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.00 16.92 1.24 3.01 0.74 0.00 0.00 1.39 1.51 0.19 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.47 0.00 0.00 0.00 20 I6_AR2 ActiveIntronRegion 0 1.52 16.52 0.53 1.84 0.22 0.26 0.19 0.82 0.15 0.46 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.31 0.00 0.00 0.00 21 ER7a ExonRegion 0 0.00 15.34 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.40 1.42 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.42 1.69 0.00 1.13 22 E7a_E8a KnownJunction 0 0.00 11.84 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.26 0.00 0.00 0.00 23 ER8a ExonRegion 0 0.00 10.15 0.00 0.00 0.00 1.92 0.00 0.00 1.85 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.34 1.81 0.00 0.00 24 E8a_E9a KnownJunction 0 0.00 14.54 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.95 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.49 3.03 0.00 0.00 25 ER9a ExonRegion 0 0.00 15.92 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.62 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.98 0.00 3.61 2.07 0.00 0.00 26 E9a_E10a KnownJunction 0 0.00 18.81 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.95 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.88 2.35 0.00 0.00 27 ER10a ExonRegion 0 0.00 17.79 0.00 0.00 0.00 2.73 0.00 0.77 4.62 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.34 2.05 0.62 0.00 28 E10a_E11a KnownJunction 0 0.00 18.42 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.69 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.62 0.00 0.00 0.00 29 ER11a ExonRegion 0 0.15 21.66 1.17 0.88 0.00 1.04 0.38 0.63 2.06 0.59 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.26 0.00 1.08 3.04 0.74 1.25 30 E11_Da KnownBoundary 0 0.00 64.86 0.00 1.27 0.00 0.00 0.00 2.55 1.48 1.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.06 0.00 3.20 3.15 0.00 0.00 31 ER11b ExonRegion 0 0.84 26.80 0.41 1.36 0.15 0.83 0.60 0.66 1.01 0.11 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.01 0.00 2.00 0.80 1.29 0.17