Order	SeqName	SeqType	IsAE	NBL01_MYCN	NBL05_MYCN	NBL09_MYCN	NBL10_MYCN	NBL02	NBL03	NBL04	NBL06	NBL07	NBL08	NBL11_Rel2	NBL11_Rem1	NBL11_Rel1	NBL12_Rel_Left	NBL12_Rel_Right	NBL13_Rel_Left	NBL13_Rel_Right	NBL14_MYCN_Met	NBL14_MYCN_Pri	NBL15_MYCN_Rel1	SKP01	SKP02	SKP03
1	NHS	Gene	0	4.71	4.96	20.00	10.61	2.51	18.57	14.96	3.04	7.57	6.01	0.00	1.72	0.25	0.36	0.41	0.08	0.07	27.31	10.25	13.09	34.16	62.68	41.02
2	380060	Transcript	0	0.00	0.72	0.62	0.06	0.00	0.08	3.08	0.11	1.53	0.64	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	10.01	1.03	3.70	11.57	5.17	10.40
3	398097	Transcript	0	0.18	0.00	1.12	0.17	0.22	0.46	0.77	0.00	0.97	0.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.37	0.53	0.87	0.55	0.34	1.46
4	380057	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.76	0.43	0.19	1.50	0.47	1.60
5	485305	Transcript	0	6.76	3.17	7.92	5.65	2.45	1.86	6.41	0.00	0.00	0.80	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.68	2.91	4.15	2.07	0.33	2.36
6	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	1.03	0.23	0.00	0.31	0.22	0.44	0.72	0.76	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.25	0.54	2.03	18.62	7.41	15.98
7	E1a_E4b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.74	1.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	11.36	3.58	2.43	27.68	9.00	23.65
8	I1_AR2	ActiveIntronRegion	0	1.40	0.00	0.47	0.77	0.25	0.52	1.51	0.00	0.67	0.81	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.80	0.00	1.36	3.36	0.59	10.88
9	I1_AR3	ActiveIntronRegion	0	1.18	2.29	1.97	4.93	1.25	2.51	3.76	1.20	0.86	1.73	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.95	0.77	1.19	2.60	1.92	10.77
10	I1_AR4	ActiveIntronRegion	0	2.42	1.24	5.32	5.75	1.32	1.39	3.74	0.54	1.28	3.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.36	0.18	0.66	4.29	1.70	14.87
11	I1_AR6	ActiveIntronRegion	0	0.63	2.03	6.00	8.18	2.68	0.00	5.03	1.73	0.00	2.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.37	0.00	0.64	6.17	2.08	10.28
12	I1_SR6	SilentIntronRegion	0	5.07	2.46	10.22	13.17	0.75	2.39	4.53	2.63	1.02	4.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.85	1.97	0.77	1.74	4.48	14.67
13	I1_AR7	ActiveIntronRegion	0	6.57	4.46	18.39	20.89	2.60	5.23	5.19	1.80	3.72	4.50	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.45	2.78	1.90	5.03	6.34	27.09
14	I1_SR7	SilentIntronRegion	0	3.89	2.97	7.03	9.09	1.51	3.72	3.84	2.97	0.95	2.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.25	0.70	2.42	3.76	3.28	19.11
15	I1_AR8	ActiveIntronRegion	0	1.45	3.14	3.21	4.96	0.66	2.65	3.53	1.26	1.72	3.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.87	2.60	2.56	5.10	3.23	17.80
16	I1_SR8	SilentIntronRegion	0	1.21	1.55	2.06	4.12	0.72	0.68	3.09	0.97	2.01	1.99	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.90	1.30	1.39	2.92	1.65	14.82
17	I1_AR9	ActiveIntronRegion	0	3.68	4.18	3.17	4.20	1.11	0.15	3.98	1.73	0.96	3.70	0.00	0.59	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.12	0.26	1.23	3.10	3.82	14.47
18	I1_SR9	SilentIntronRegion	0	1.88	1.99	2.82	3.24	0.83	1.47	3.50	1.26	2.62	1.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.68	1.45	0.85	2.92	1.13	13.23
19	I1_AR10	ActiveIntronRegion	0	2.70	0.65	4.44	5.59	1.49	1.80	5.45	1.11	4.23	2.51	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.49	3.99	3.06	3.31	2.15	17.79
20	I1_SR10	SilentIntronRegion	0	1.69	1.04	2.20	3.74	0.90	0.86	2.95	0.81	1.89	1.95	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.94	0.96	1.74	3.42	2.69	11.15
21	I1_AR13	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.26	0.00	2.37	0.00	0.71	4.11	0.33	0.48	0.67	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.07	0.00	0.83	3.71	1.08	12.54
22	ER2a	ExonRegion	0	0.35	0.00	0.60	0.34	0.44	0.91	1.53	0.00	0.14	0.85	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.22	1.05	1.74	1.09	0.69	2.92
23	E2a_E4b	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.63	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.79	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.52	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
24	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
25	ER4a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.22	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.51	0.87	0.39	3.01	0.95	3.20
26	ER4b	ExonRegion	0	0.71	0.00	0.57	0.68	0.00	2.80	0.89	1.73	1.59	3.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.27	2.05	8.34	33.17	15.16	37.38
27	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	3.49	0.00	0.00	4.77	0.00	0.00	3.39	5.91	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	9.66	0.00	14.57	35.89	18.98	22.62
28	ER5a	ExonRegion	0	0.25	0.59	1.99	0.00	0.00	1.01	4.03	0.00	1.02	6.39	0.00	0.00	0.00	0.00	0.78	0.00	0.00	13.65	1.21	14.13	25.75	24.47	29.74
29	E5a_E6b	KnownJunction	0	3.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.15	0.00	0.00	7.71	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.78	0.00	3.26	43.61	42.01	57.96
30	E5a_E7a	KnownJunction	0	0.00	2.89	1.45	0.00	0.00	0.00	12.10	0.00	2.84	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	21.18	0.00	10.35	0.00	2.88	0.00
31	E6_Aa	NovelBoundary	0	16.30	3.35	20.49	18.68	7.89	2.90	0.00	2.34	0.00	1.67	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	9.12	8.66	0.00	0.00	8.39	7.51
32	ER6a	ExonRegion	0	6.76	3.17	7.92	5.65	2.45	1.86	6.41	0.00	0.00	0.80	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.68	2.91	4.15	2.07	0.33	2.36
33	E6_Ab	KnownBoundary	0	23.78	3.35	18.60	13.78	7.72	4.71	17.89	0.00	0.00	2.90	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.19	8.75	11.12	0.00	3.06	0.00
34	ER6b	ExonRegion	0	18.37	4.13	10.26	5.89	1.17	0.56	6.98	0.00	0.76	6.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.75	9.45	5.49	36.11	26.58	19.89
35	E6_Da	NovelBoundary	0	6.08	3.35	21.20	11.49	0.00	5.00	4.50	2.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.01	0.00	6.39	6.05	17.45	25.52
36	E6a_E7a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.18	0.00	0.00	0.00	2.08	0.00	1.79	1.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	9.24	0.00	2.68	23.78	17.02	20.23
37	I6	Intron	0	1.44	2.03	7.67	3.20	0.70	2.50	5.94	0.95	1.21	1.26	0.05	0.09	0.41	0.32	0.22	0.00	0.00	3.67	3.60	4.30	5.78	17.28	12.10
38	I6_SR1	SilentIntronRegion	0	1.45	2.03	7.68	3.20	0.70	2.51	5.95	0.95	1.21	1.26	0.05	0.09	0.41	0.32	0.22	0.00	0.00	3.67	3.60	4.30	5.79	17.30	12.11
39	E7_Aa	NovelBoundary	0	0.00	3.35	2.93	3.20	0.00	0.00	9.01	0.00	4.60	1.21	2.68	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	9.53	8.56	0.00	11.86	20.45	30.99
40	ER7a	ExonRegion	0	1.12	1.75	6.50	1.98	0.00	8.26	4.97	0.68	2.62	8.33	0.00	0.94	1.02	0.71	0.54	0.00	0.00	39.25	5.60	18.30	41.71	46.81	38.94
41	E7_Da	NovelBoundary	0	0.00	3.22	8.01	4.86	0.00	2.90	3.84	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.06	4.80	5.82	8.59	20.88	23.05
42	E7a_E8a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	1.83	0.00	7.78	3.62	0.00	1.68	7.39	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	44.85	11.95	14.25	50.78	19.29	25.69
43	I7	Intron	0	0.80	1.26	2.37	1.83	0.16	3.59	4.61	1.03	1.66	1.16	0.04	0.92	0.15	0.27	0.00	0.00	0.26	4.34	2.80	3.96	5.77	20.83	14.68
44	I7_SR1	SilentIntronRegion	0	0.84	1.31	2.46	1.86	0.17	3.50	4.72	1.03	1.65	1.04	0.04	0.92	0.16	0.28	0.00	0.00	0.28	4.31	2.85	3.99	5.66	21.02	15.06
45	I7_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.20	0.25	1.02	0.00	5.91	1.99	0.93	1.84	4.14	0.00	0.89	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.02	1.59	3.15	8.40	16.55	5.67
46	E8_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	1.23	0.00	11.07	5.61	2.26	5.18	2.77	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.65	4.61	0.00	3.09	19.72	24.67
47	ER8a	ExonRegion	0	0.00	1.19	4.46	0.62	1.71	12.23	11.57	0.00	2.35	6.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	28.74	9.64	14.72	38.99	60.77	36.59
48	E8_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	6.77	1.33	0.00	33.73	9.54	0.00	3.39	6.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	38.18	0.00	13.81	44.48	40.84	45.07
49	ER8b	ExonRegion	0	0.00	5.36	4.92	2.07	0.22	10.94	14.39	1.41	4.30	4.26	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	42.99	4.46	13.30	32.58	48.62	38.52
50	E8b_E9a	KnownJunction	0	0.00	12.96	3.13	4.36	0.00	19.25	20.76	4.56	4.66	3.98	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	54.26	4.14	14.83	22.36	93.81	35.68
51	ER9a	ExonRegion	0	1.30	2.56	13.53	7.11	1.88	20.40	12.00	3.79	10.83	7.33	0.00	3.38	0.23	0.21	0.04	0.15	0.11	48.91	16.88	21.48	61.11	92.93	65.84
52	E9a_E10a	KnownJunction	0	0.00	5.66	4.61	18.48	0.00	17.49	4.02	9.28	7.18	5.88	0.00	6.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	60.15	12.33	8.56	67.77	84.07	90.40
53	ER10a	ExonRegion	0	0.68	6.55	16.70	11.83	1.07	24.00	12.99	3.62	10.26	5.72	0.00	3.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	76.75	32.31	18.61	88.20	94.76	94.27
54	E10a_E11a	KnownJunction	0	2.96	3.35	16.65	11.32	0.00	33.39	34.58	7.23	7.15	5.83	0.00	5.85	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	89.21	12.05	14.06	118.24	80.64	73.58
55	ER11a	ExonRegion	0	1.57	4.87	20.40	9.22	2.31	24.22	12.25	2.18	8.23	5.81	0.00	2.45	0.65	0.58	1.18	0.00	0.00	57.90	13.67	14.84	71.59	68.97	65.74
56	E11_Da	KnownBoundary	0	7.04	0.00	17.06	3.33	3.90	19.76	18.15	1.97	8.56	4.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	30.43	25.51	11.89	36.82	53.15	48.91
57	ER11b	ExonRegion	0	10.33	9.38	35.55	19.28	4.40	25.12	25.05	4.01	8.30	6.90	0.00	1.06	0.30	0.62	0.77	0.09	0.10	11.05	7.88	9.63	10.74	61.73	26.07
58	ER11c	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.82	0.76	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.23	0.00	0.00	0.00	1.39	1.96