Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 CXorf58 Gene 0 0.84 0.32 0.05 0.59 2.27 0.24 0.91 0.68 0.63 0.27 0.67 0.27 1.20 0.79 1.00 0.63 0.96 0.15 0.59 0.34 0.23 0.17 0.16 2 379211 Transcript 0 0.56 0.17 0.00 0.42 3.21 0.04 0.40 0.55 0.89 0.12 0.83 0.75 0.79 1.34 0.71 0.91 0.58 0.05 0.40 0.11 0.39 0.02 0.03 3 435707 Transcript 0 0.48 0.00 0.54 0.54 0.57 0.00 0.00 0.00 1.09 0.97 0.00 0.00 0.00 0.39 0.77 0.00 0.97 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.20 0.00 0.00 0.52 0.00 1.02 0.00 0.23 0.49 0.56 0.00 0.00 0.45 0.86 1.36 0.96 0.53 0.92 0.41 0.46 0.20 0.28 5 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.92 0.00 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 3.76 0.00 0.00 0.00 0.00 2.41 0.00 0.00 6 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.85 0.00 0.16 6.54 0.00 0.24 2.60 3.34 0.86 0.40 0.00 0.00 0.26 1.21 4.88 1.63 0.00 1.61 0.00 1.40 0.00 0.00 7 E2_Ab KnownBoundary 0 0.00 2.70 0.00 1.37 0.00 0.00 2.12 0.00 1.22 0.00 2.68 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.15 0.00 0.00 8 ER2b ExonRegion 0 0.12 0.52 0.00 1.36 0.61 0.00 1.25 0.35 0.35 0.00 1.66 0.00 0.00 0.84 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.97 1.83 0.00 0.00 9 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 2.00 0.00 0.00 0.00 1.56 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.00 0.00 0.00 0.00 10 ER3a ExonRegion 0 1.04 0.00 0.00 0.46 0.00 0.00 2.70 3.28 2.67 0.00 0.00 0.00 0.00 3.12 0.00 0.00 1.68 0.00 0.00 0.74 0.00 0.44 0.00 11 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.55 1.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.12 0.00 12 ER4a ExonRegion 0 2.27 2.18 0.00 1.02 4.31 0.00 2.84 0.56 1.14 0.00 0.71 0.00 0.00 0.44 0.00 0.00 0.00 0.00 1.11 1.14 0.00 0.66 1.58 13 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.26 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 0.00 0.00 4.61 0.00 0.00 0.00 0.00 14 ER5a ExonRegion 0 0.23 0.93 0.00 0.10 2.75 3.34 0.00 0.00 0.00 0.05 0.71 0.27 4.27 0.78 1.61 0.00 0.00 0.00 0.51 0.97 0.00 0.95 0.00 15 E5_Da KnownBoundary 0 3.19 0.00 0.00 0.00 3.74 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.63 5.70 0.00 4.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 ER5b ExonRegion 0 0.48 0.00 0.54 0.54 0.57 0.00 0.00 0.00 1.09 0.97 0.00 0.00 0.00 0.39 0.77 0.00 0.97 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.79 0.00 0.78 2.09 0.00 1.02 1.00 0.71 0.00 0.38 1.15 0.00 1.54 2.37 0.00 0.00 0.00 1.23 0.76 0.00 0.00 0.00 19 E6a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 ER7a ExonRegion 0 1.41 0.00 0.00 0.90 4.16 0.41 0.88 0.57 0.00 0.00 1.26 0.79 0.00 0.04 2.27 0.00 1.46 0.00 0.00 0.03 0.00 0.00 0.00 21 E7a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 ER8a ExonRegion 0 3.50 0.00 0.00 2.02 4.53 0.00 0.44 0.85 0.61 0.00 0.56 0.00 4.11 1.60 0.68 0.00 1.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 E8_Da NovelBoundary 0 3.41 0.00 0.00 3.93 21.05 0.00 4.50 1.73 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.45 4.36 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 E8a_E9a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 14.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.11 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 ER9a ExonRegion 0 1.23 0.00 0.00 0.78 2.52 0.00 0.77 1.00 0.00 0.00 1.19 0.59 4.53 0.98 0.40 0.00 1.28 0.00 0.62 0.00 0.00 0.00 0.00