Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 C9orf173 Gene 0 0.54 0.34 1.47 0.52 0.91 0.85 0.84 0.98 1.56 1.08 1.63 2.29 0.99 3.44 3.41 1.89 3.91 3.11 5.26 2.34 2.14 0.62 1.37 2 388931 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 416962 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 412566 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 1.57 0.08 0.00 0.00 0.51 0.00 0.96 0.89 0.11 6.73 0.26 0.99 0.00 1.98 2.57 1.13 0.00 1.42 1.96 0.00 0.00 6 ER1b ExonRegion 0 0.00 0.00 5.29 0.87 2.31 0.79 1.64 0.00 3.04 2.85 1.65 2.05 1.99 4.47 1.77 0.98 3.89 0.63 4.13 4.38 2.56 0.00 0.00 7 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 E2_Aa NovelBoundary 0 3.63 0.00 3.37 0.00 0.00 0.00 0.00 4.56 1.56 1.58 4.84 6.90 6.01 0.00 0.00 3.16 4.02 22.59 13.93 0.00 2.78 0.00 3.93 9 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.59 0.00 0.00 0.59 0.00 0.83 1.19 2.18 3.72 1.15 2.32 4.63 1.32 3.84 6.39 4.44 7.20 1.37 3.56 2.69 1.90 10 E2_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 2.84 0.00 0.00 0.00 4.37 4.11 1.79 1.40 2.68 6.30 6.82 0.00 18.54 13.07 7.76 23.63 12.52 2.62 0.00 3.06 4.01 11 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 E3_Aa NovelBoundary 0 3.78 0.00 3.58 1.80 0.00 5.11 0.00 2.30 0.00 2.69 4.95 0.00 0.00 9.65 0.00 0.00 0.00 11.03 0.00 0.00 9.39 0.00 3.59 13 ER3a ExonRegion 0 2.40 0.00 0.69 0.00 0.00 0.00 0.00 1.95 0.70 0.65 2.22 0.00 0.00 3.65 4.77 1.12 1.25 2.08 2.41 1.61 0.83 0.00 2.22 14 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 1.05 0.00 1.53 0.00 0.03 0.00 0.00 0.00 0.00 4.09 0.00 0.77 2.35 3.41 5.60 0.00 3.69 2.44 1.26 0.00 0.00 16 E4_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 4.41 1.43 0.00 2.10 2.25 4.97 1.79 1.26 2.05 0.00 0.00 7.42 10.75 0.00 4.77 6.92 0.00 2.68 6.30 0.00 0.00 17 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 E4a_E5b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.21 1.25 0.00 0.85 0.66 0.09 0.31 0.71 1.69 0.16 1.19 2.31 4.67 1.15 3.18 2.95 3.90 3.76 3.12 0.64 0.00 20 E5_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 1.71 0.00 0.00 2.90 6.76 1.60 1.79 1.53 2.11 0.00 0.00 4.94 4.45 3.67 0.00 4.02 0.00 9.65 3.15 0.00 0.00 21 ER5b ExonRegion 0 0.78 0.75 0.43 0.75 0.99 2.37 1.64 0.84 1.67 1.66 1.54 2.45 1.43 3.61 4.73 3.02 4.76 4.59 2.35 4.13 1.13 0.77 1.09 22 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 E5a_E6b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 I5_AR2 ActiveIntronRegion 0 4.23 0.00 2.45 1.36 0.00 3.23 1.32 0.00 1.24 1.15 3.56 2.42 0.00 14.42 4.29 3.33 1.98 7.39 10.58 1.11 6.43 2.08 0.00 25 E6_Aa NovelBoundary 0 3.78 0.00 0.00 0.00 0.00 2.90 0.00 0.00 4.89 0.00 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 8.03 9.35 4.23 0.00 2.36 2.29 2.69 11.87 26 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.00 1.15 0.00 0.00 0.00 1.32 0.00 0.00 0.07 0.00 0.00 0.00 0.57 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.69 0.00 0.00 27 ER6b ExonRegion 0 0.59 0.85 1.98 0.56 1.49 1.02 1.22 1.79 2.56 0.48 1.07 4.07 0.54 3.86 3.87 1.24 3.67 4.21 8.42 1.18 2.07 0.29 2.45 28 IG23_AR2 ActiveIntergenicRegion 0 0.00 0.00 0.00 1.36 0.00 1.22 1.32 1.73 0.00 3.44 0.00 0.00 0.00 7.58 8.70 5.94 3.30 7.60 13.10 2.84 2.45 0.00 0.98 29 IG23_AR3 ActiveIntergenicRegion 0 0.00 0.00 0.00 1.36 0.00 0.00 0.88 1.73 0.00 3.44 0.00 0.00 0.00 4.60 8.70 3.47 3.30 6.16 15.93 2.13 4.41 0.00 5.87