Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 RP11-88G17.1 Gene 0 3.81 0.00 1.04 0.60 0.30 0.84 0.93 1.88 10.69 3.39 0.00 0.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.15 1.34 0.44 1.79 0.10 2.85 1.61 2 413018 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 415566 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 ER1a ExonRegion 0 1.46 0.00 0.00 0.70 0.89 0.00 0.04 0.50 5.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.77 0.00 1.44 2.02 5 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.48 13.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.62 0.00 0.00 0.00 6 ER2a ExonRegion 0 0.03 0.00 0.93 0.10 1.36 0.00 1.10 3.09 9.05 0.97 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.25 0.00 1.80 0.00 1.70 4.18 7 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 1.57 0.00 4.07 0.00 3.84 3.78 8.28 3.28 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.45 0.00 2.49 0.00 5.82 8.71 8 ER3a ExonRegion 0 7.00 0.00 0.81 0.61 0.29 0.59 0.34 1.83 9.83 2.32 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.56 0.00 3.35 0.00 1.94 0.96 9 E3a_E4a KnownJunction 0 12.67 0.00 1.12 0.00 0.00 0.00 0.00 4.27 7.61 8.49 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.11 0.00 2.43 0.00 2.51 0.00 10 ER4a ExonRegion 0 5.37 0.00 2.20 0.82 0.00 0.76 1.07 1.77 12.80 2.22 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.84 0.00 1.70 0.91 1.15 2.44 11 E4a_E5a KnownJunction 0 3.78 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13.14 4.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.68 0.00 3.06 0.00 12 ER5a ExonRegion 0 2.23 0.00 0.54 0.02 0.00 0.54 1.93 2.88 11.63 2.91 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.58 0.94 2.94 0.65 1.09 2.20 13 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.76 17.10 3.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.26 0.00 2.33 4.10 14 ER6a ExonRegion 0 2.25 0.00 0.79 0.00 1.28 0.00 0.05 1.68 10.16 2.95 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.93 0.00 1.57 0.00 3.27 0.66 15 E6a_E7a KnownJunction 0 17.63 0.00 2.93 0.00 0.00 0.00 0.00 1.97 6.11 7.49 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.53 0.00 0.00 0.00 5.14 0.00 16 ER7a ExonRegion 0 5.82 0.00 1.67 0.86 0.00 1.55 0.42 1.90 14.34 5.26 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.15 1.34 1.79 0.00 4.32 1.24 17 E7a_E8a KnownJunction 0 6.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.42 1.77 7.52 6.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.11 0.00 0.00 0.00 3.00 0.00 18 ER8a ExonRegion 0 6.64 0.00 1.03 0.00 0.52 1.82 0.79 3.87 9.73 5.34 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.04 0.68 0.41 0.00 3.47 1.13 19 E8a_E9a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.16 1.72 4.35 8.85 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.07 0.00 0.00 0.00 5.08 0.00 20 E9_Aa NovelBoundary 0 11.34 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 ER9a ExonRegion 0 1.52 0.00 0.00 0.71 0.00 1.44 1.28 1.82 8.12 1.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.59 1.01 0.48 0.00 2.67 0.18 22 E9a_E10a KnownJunction 0 6.96 0.00 0.00 0.00 0.00 11.19 2.25 1.93 8.68 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.53 0.00 3.13 0.00 5.76 3.41 23 ER10a ExonRegion 0 5.05 0.00 0.00 0.80 0.00 1.25 0.78 0.34 9.71 3.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.80 2.66 0.65 0.00 4.65 3.47 24 E10a_E11a KnownJunction 0 3.11 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.60 11.31 2.77 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.20 0.00 0.00 0.00 25 ER11a ExonRegion 0 2.26 0.00 1.36 0.36 0.00 1.03 0.74 2.36 8.85 3.76 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 2.14 0.00 1.63 2.68 26 E11a_E12a KnownJunction 0 10.59 0.00 0.00 1.96 0.00 0.00 0.00 0.00 16.98 5.61 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.75 0.00 0.00 3.16 27 ER12a ExonRegion 0 3.14 0.00 2.21 0.50 0.00 0.00 1.09 0.52 16.76 5.48 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.42 0.00 2.47 0.00 3.89 0.29 28 E12a_E13a KnownJunction 0 7.19 0.00 3.93 2.06 0.00 0.00 1.72 2.55 18.40 6.39 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.90 0.00 0.00 0.00 2.82 3.33 29 ER13a ExonRegion 0 4.55 0.00 2.38 2.76 1.07 1.46 1.03 1.47 14.97 5.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.65 0.00 3.08 0.00 4.77 2.16 30 E13a_E14a KnownJunction 0 0.00 0.00 2.63 0.00 0.00 0.00 1.99 0.00 13.80 5.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.11 0.00 3.20 0.00 11.45 0.00 31 ER14a ExonRegion 0 1.88 0.00 1.60 1.11 0.00 0.82 2.93 0.00 12.46 3.75 0.00 1.60 0.00 0.00 0.00 0.00 1.48 2.38 0.00 1.31 0.00 4.59 1.31 32 E14a_E15a KnownJunction 0 0.00 0.00 1.80 1.60 0.00 0.00 5.92 0.00 14.29 4.49 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 33 ER15a ExonRegion 0 5.09 0.00 0.25 0.54 0.00 0.00 0.82 1.76 10.15 3.86 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.13 1.23 0.00 0.73 0.00 3.57 0.00 34 ER15b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00