Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 RP11-341A22.1 Gene 0 2.29 2.42 5.86 5.55 2.44 1.69 3.27 7.38 5.88 6.28 0.82 1.25 1.85 1.61 3.41 2.43 2.62 7.25 2.40 3.12 1.19 0.96 2.48 2 411575 Transcript 0 0.31 0.40 0.55 0.52 0.35 0.33 1.05 0.69 0.55 0.59 0.16 0.19 0.16 0.14 0.41 0.36 0.70 0.77 0.97 0.76 0.32 0.09 0.49 3 455051 Transcript 0 0.00 0.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 E1a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 E2a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.62 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 ER6a ExonRegion 0 1.83 3.52 0.00 0.00 1.16 0.79 0.57 0.00 0.00 0.00 2.51 5.28 4.77 4.95 15.19 2.57 2.85 0.00 0.00 1.84 0.95 1.80 5.08 15 E6_Da NovelBoundary 0 0.00 9.08 15.61 13.32 15.87 2.67 12.59 5.79 26.33 12.20 0.00 6.30 18.51 0.00 0.00 4.27 4.49 8.37 11.48 2.56 2.53 4.65 0.00 16 E6a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 E6a_E7b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 ER7a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 ER7b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.64 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 E7_Da KnownBoundary 0 7.33 22.82 55.65 92.20 0.00 5.34 19.78 38.28 66.35 62.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.27 0.00 11.32 0.00 3.26 0.00 3.06 0.00 21 ER7c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.39 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 E7b_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 ER8a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.11 0.00 0.00 0.00 24 E8a_E9a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 I8_AR4 ActiveIntronRegion 0 4.18 65.45 0.39 0.00 0.00 8.54 0.00 3.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 36.40 26 I8_AR8 ActiveIntronRegion 0 0.00 15.46 7.05 6.34 9.10 8.34 4.50 3.98 2.10 6.77 5.90 0.00 0.00 4.71 5.37 1.63 1.65 0.74 93.01 24.68 5.51 9.69 4.99 27 ER9a ExonRegion 0 1.52 2.92 0.00 0.00 1.92 2.61 11.41 0.00 0.00 0.00 1.44 0.00 0.00 0.00 2.08 2.13 7.11 1.33 11.44 6.11 3.17 0.00 4.22 28 E9_Da NovelBoundary 0 32.38 47.75 102.07 91.46 65.45 31.52 97.33 116.40 146.87 82.92 25.64 5.85 59.90 10.65 16.69 45.20 90.60 155.95 46.87 130.90 49.98 8.94 53.18 29 E9a_E10a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 30 ER10a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 31 E10a_E11a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 32 ER11a ExonRegion 0 3.11 3.14 8.26 7.82 3.33 2.28 4.28 10.40 8.28 8.84 1.01 1.46 2.39 2.06 4.10 3.26 3.38 10.18 3.08 4.12 1.56 1.28 3.17