Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 RP11-490D19.1 Gene 0 0.00 0.60 0.32 0.84 0.95 0.87 0.71 1.99 1.53 1.22 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.53 0.76 2.02 0.00 0.00 0.00 2 424154 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.23 0.76 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.19 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3 450109 Transcript 0 0.00 0.20 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 0.00 0.00 4 431507 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.18 0.00 0.00 0.00 0.00 0.26 0.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.54 0.00 3.45 0.00 0.00 0.00 5 425734 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.46 1.53 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.38 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 ER1b ExonRegion 0 0.00 2.13 0.00 0.71 0.00 0.00 1.39 4.50 4.42 1.54 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.86 3.34 3.66 0.00 0.00 0.00 8 E1a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9 E1a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.51 0.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.08 0.00 6.90 0.00 0.00 0.00 11 E2_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 1.50 0.00 0.00 0.00 1.77 1.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.57 0.00 7.86 0.00 0.00 0.00 12 ER2b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.39 1.23 3.40 3.10 1.43 3.27 2.22 2.86 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.63 0.67 3.29 0.00 0.00 0.00 13 E2a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 E2a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 I2_SR2 SilentIntronRegion 0 3.70 19.74 12.46 8.40 8.82 13.45 5.05 10.20 8.37 14.75 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14.32 3.48 15.45 2.41 1.17 1.65 16 I2_AR2 ActiveIntronRegion 0 0.00 6.97 20.66 14.02 21.41 10.74 3.59 17.28 13.59 17.20 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26.66 0.00 14.59 0.00 4.17 2.94 17 I2_SR3 SilentIntronRegion 0 2.14 22.35 11.93 7.79 7.91 11.59 7.56 10.90 6.62 12.31 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15.25 3.22 15.34 0.56 0.85 1.26 18 E3_Aa NovelBoundary 0 46.38 234.56 91.45 116.57 158.49 225.84 207.08 158.83 243.63 192.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 66.41 50.92 158.13 8.53 25.23 15.19 19 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.61 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.05 0.00 0.00 0.00 20 E3_Da NovelBoundary 0 52.08 277.85 62.36 73.28 133.79 206.24 142.73 123.67 220.98 236.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 50.32 82.64 192.14 21.25 19.41 29.71 21 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 ER4a ExonRegion 0 0.00 1.23 0.00 2.39 0.00 0.00 0.73 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.00 1.33 0.74 0.00 0.00 0.00 1.88 0.65 0.62 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00