Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 TNFSF8 Gene 0 41.56 0.35 0.63 4.23 24.99 4.90 4.97 9.18 8.80 0.78 0.00 6.16 1.38 3.45 4.95 0.32 4.66 0.00 0.00 0.00 0.00 0.18 0.06 2 223795 Transcript 0 52.60 0.73 0.13 3.94 25.44 6.77 3.22 9.10 9.40 0.92 0.00 1.20 0.21 5.61 4.96 1.46 4.95 0.00 0.00 0.00 0.00 0.30 0.06 3 474301 Transcript 0 47.71 0.00 0.11 1.64 18.71 0.53 2.84 3.71 5.19 0.00 0.00 0.82 0.63 0.08 0.66 0.00 0.38 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 IG35_AR10 ActiveIntergenicRegion 0 20.35 5.43 1.95 0.54 17.15 8.32 5.66 17.17 7.86 1.83 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.96 0.00 0.57 12.96 222.53 286.22 5 IG35_AR1 ActiveIntergenicRegion 0 17.48 0.49 0.00 0.49 13.00 4.02 3.22 1.88 1.34 0.00 0.00 0.00 0.00 1.30 0.99 0.72 1.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 ER1a ExonRegion 0 20.81 0.00 0.00 2.95 14.92 3.32 2.61 3.61 5.45 0.75 0.00 0.00 0.00 3.43 2.32 1.14 1.63 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.48 7 E1a_E2a KnownJunction 0 82.61 0.00 0.00 2.93 24.28 15.67 1.99 9.61 7.49 1.56 0.00 0.00 0.00 4.41 4.45 8.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 ER2a ExonRegion 0 59.02 1.37 0.00 2.28 15.99 8.53 1.11 8.20 8.65 1.76 0.00 0.00 0.00 5.63 1.42 2.35 0.23 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9 E2a_E3a KnownJunction 0 62.23 3.35 0.00 1.70 11.54 0.00 2.21 4.64 10.19 1.67 0.00 0.00 0.00 7.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 ER3a ExonRegion 0 52.80 0.62 0.00 3.63 25.83 3.95 1.32 7.35 11.25 0.59 0.00 0.00 0.00 7.67 5.80 0.00 5.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.06 0.00 11 E3a_E4a KnownJunction 0 57.57 0.00 0.00 7.46 40.41 10.16 5.70 12.57 12.38 0.00 0.00 0.00 0.00 7.59 10.14 0.00 12.81 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 E4_Ab NovelBoundary 0 44.23 0.00 0.00 3.03 49.32 0.00 3.84 12.94 5.70 0.00 0.00 0.00 0.00 2.24 8.90 0.00 8.23 0.00 0.00 0.00 0.00 3.06 0.00 13 ER4a ExonRegion 0 41.74 0.00 0.00 5.75 42.37 6.52 3.90 15.46 9.74 0.00 0.00 0.00 0.00 4.69 8.86 0.00 13.57 0.00 0.00 0.00 0.00 2.08 0.00 14 ER4b ExonRegion 0 47.24 0.00 0.00 5.42 49.68 10.93 3.37 15.02 16.67 0.00 0.00 5.18 4.86 1.76 5.55 1.69 9.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 15 E4_Da KnownBoundary 0 27.49 0.00 0.00 7.59 12.39 5.34 6.23 11.75 10.30 0.00 0.00 6.30 6.82 4.77 4.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 E4a_E5a KnownJunction 0 51.79 0.00 0.00 0.00 19.78 0.00 3.84 2.01 4.98 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 ER4c ExonRegion 0 44.07 0.52 1.01 4.83 28.16 6.04 6.92 11.32 10.03 1.07 0.00 9.62 1.65 4.31 6.68 0.12 6.33 0.00 0.00 0.00 0.00 0.23 0.00 18 E4_Db NovelBoundary 0 110.83 2.70 6.62 8.79 88.37 2.44 12.94 18.28 9.49 0.00 0.00 12.60 0.00 10.30 4.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 I4 Intron 0 33.73 0.11 0.26 1.58 12.76 1.47 2.97 3.25 3.66 0.21 0.02 1.29 0.33 1.02 1.25 0.06 1.73 0.00 0.00 0.04 0.04 0.31 0.25 20 I4_AR1 ActiveIntronRegion 0 74.36 0.45 1.76 6.32 38.88 6.52 8.34 7.26 8.05 0.89 0.00 4.83 1.49 7.29 7.29 0.44 7.59 0.00 0.00 0.32 0.33 0.77 0.00 21 I4_AR2 ActiveIntronRegion 0 27.00 0.00 0.32 1.17 9.98 1.11 3.82 3.45 5.61 0.15 0.00 1.24 0.00 0.00 1.21 0.00 1.72 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.25 22 I4_SR2 SilentIntronRegion 0 27.39 0.00 0.00 0.18 8.05 0.00 3.17 0.94 2.13 0.00 0.00 0.87 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.72 23 I4_AR3 ActiveIntronRegion 0 24.32 0.00 0.00 1.13 7.82 0.38 1.03 2.46 2.80 0.00 0.00 0.40 0.00 0.15 0.91 0.00 1.44 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 I4_SR3 SilentIntronRegion 0 40.97 0.00 0.00 0.08 11.86 1.62 0.96 1.82 3.93 0.08 0.00 1.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 I4_AR4 ActiveIntronRegion 0 68.18 0.48 0.00 1.87 14.77 1.21 2.71 3.31 6.85 0.36 0.00 1.48 0.00 0.00 0.73 0.00 1.56 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 0.69 26 I4_SR4 SilentIntronRegion 0 21.31 0.04 0.00 0.77 7.90 0.63 2.01 2.66 1.93 0.09 0.04 0.61 0.28 0.18 0.13 0.00 0.66 0.00 0.00 0.00 0.00 0.26 0.27 27 E5_Aa NovelBoundary 0 69.12 0.00 0.00 3.06 25.98 0.00 4.28 3.61 1.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 28 ER5a ExonRegion 0 43.64 0.00 0.21 3.28 17.63 1.05 1.84 5.40 5.41 0.00 0.00 1.65 1.26 0.15 1.31 0.00 0.76 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00