Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 C9orf47 Gene 0 2.09 0.21 0.77 0.70 2.00 0.33 3.96 1.72 3.57 1.38 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.10 0.40 2.77 1.46 4.43 3.87 6.35 2 375851 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.53 1.44 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.32 0.00 0.00 0.00 0.00 3 375850 Transcript 0 3.44 0.00 0.00 0.76 1.74 0.00 1.12 0.00 0.61 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.53 1.14 0.18 4.32 1.07 2.13 4 334490 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.53 1.44 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.32 0.00 0.00 0.00 0.00 6 E1_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.44 1.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 E1_Ac KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.25 4.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.05 0.00 0.00 0.00 0.00 8 ER1b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.51 3.46 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.19 0.00 0.00 0.00 0.00 9 ER1c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.40 2.14 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.19 0.85 0.00 0.42 0.00 10 E1_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.05 0.00 0.00 0.00 0.00 12 ER1d ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 E1b_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 E2_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.68 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.57 0.00 0.00 8.65 8.57 17.33 15 ER2a ExonRegion 0 0.48 0.00 0.41 0.00 0.00 0.00 1.28 0.00 1.14 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.87 3.41 1.32 0.52 1.13 1.81 16 E2_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 E2a_E2b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.80 0.00 0.00 0.00 0.00 18 ER2b ExonRegion 0 3.44 0.00 0.00 0.76 1.74 0.00 1.12 0.00 0.61 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.53 1.14 0.18 4.32 1.07 2.13 19 E2_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 1.37 0.00 0.00 2.25 0.00 1.39 1.26 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.45 20 ER2c ExonRegion 0 2.58 0.49 0.00 0.91 1.19 0.00 1.20 0.74 1.47 0.97 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.42 2.13 5.18 2.63 4.85 21 E2_Db KnownBoundary 0 7.41 0.00 0.00 0.00 8.15 0.00 3.58 1.89 1.79 1.18 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.26 6.05 5.88 16.48 22 ER2d ExonRegion 0 2.30 0.23 0.94 0.79 2.35 0.41 4.65 1.93 4.26 1.62 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.12 0.43 3.03 1.57 5.02 4.53 7.43