Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 RP11-318K12.2 Gene 0 1.92 23.51 6.80 8.38 3.23 1.11 0.53 1.81 2.78 0.17 0.00 0.00 1.55 0.13 0.62 0.30 0.00 6.20 1.60 11.77 0.00 0.00 0.59 2 446288 Transcript 0 0.18 6.56 0.98 1.00 0.78 0.96 0.11 0.21 0.32 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.34 1.11 2.67 0.00 0.00 0.26 3 439342 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 E2_Aa NovelBoundary 0 0.00 18.48 4.32 15.48 4.24 0.00 0.00 2.55 5.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.63 0.00 0.00 0.00 6 E2_Da NovelBoundary 0 3.78 25.98 10.32 19.34 4.33 0.00 0.00 0.00 5.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.94 0.00 0.00 0.00 7 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.39 0.16 0.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.07 0.00 0.00 0.00 9 I2 Intron 0 0.93 42.70 10.40 24.82 2.21 1.20 0.18 1.60 2.12 0.28 0.15 0.04 0.12 0.03 0.09 0.03 0.11 1.99 1.61 9.83 0.17 0.16 0.19 10 I2_SR1 SilentIntronRegion 0 0.93 42.72 10.40 24.83 2.21 1.20 0.18 1.60 2.12 0.28 0.15 0.04 0.12 0.03 0.09 0.03 0.11 1.99 1.61 9.83 0.17 0.16 0.19 11 E3_Aa NovelBoundary 0 0.00 26.71 12.92 22.47 4.07 0.00 0.00 3.82 4.40 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17.19 0.00 0.00 0.00 12 E3_Ab NovelBoundary 0 0.00 29.27 20.70 34.93 19.44 0.00 1.72 2.38 8.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14.13 0.00 0.00 0.00 13 ER3a ExonRegion 0 0.00 19.83 2.45 3.41 0.00 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.13 0.00 0.00 0.00 14 ER3b ExonRegion 0 3.08 39.42 2.49 5.39 5.85 0.00 0.04 0.12 2.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.18 0.00 15.62 0.00 0.00 2.14 15 E3_Da NovelBoundary 0 0.00 98.80 23.42 46.21 7.64 12.66 13.07 0.00 16.46 0.00 0.00 6.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.43 0.00 16.75 0.00 0.00 0.00 16 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 E3a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 I3 Intron 0 1.17 44.24 12.41 33.95 3.12 0.71 0.95 4.63 4.77 0.84 0.07 0.20 0.07 0.06 0.09 0.08 0.09 4.78 1.71 14.18 0.19 0.11 0.18 19 I3_SR1 SilentIntronRegion 0 2.30 51.89 10.23 25.08 0.79 1.18 0.51 2.47 5.03 0.51 0.38 0.00 0.00 0.00 0.20 0.15 0.16 4.99 3.51 14.17 0.22 0.21 0.44 20 I3_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.00 47.59 13.64 33.78 2.64 1.39 0.13 4.39 5.65 0.40 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.51 0.83 13.79 0.00 0.79 0.00 21 I3_AR2 ActiveIntronRegion 0 0.58 50.68 3.89 22.71 2.45 1.01 0.00 2.15 3.29 0.64 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.15 2.62 11.04 0.00 0.57 0.00 22 I3_SR2 SilentIntronRegion 0 0.43 39.68 14.89 31.49 6.00 0.62 1.89 4.55 7.26 1.05 0.00 0.29 0.00 0.29 0.00 0.00 0.45 8.68 1.52 16.50 0.30 0.00 0.20 23 I3_AR3 ActiveIntronRegion 0 1.15 45.65 19.06 53.42 4.87 0.00 1.08 7.20 5.30 0.97 0.00 0.97 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.97 1.30 18.84 0.00 0.00 0.00 24 I3_SR3 SilentIntronRegion 0 1.07 42.31 12.21 35.65 3.05 0.63 0.95 5.15 4.13 0.91 0.00 0.18 0.11 0.03 0.09 0.09 0.00 4.43 1.23 13.36 0.20 0.06 0.13 25 E4_Aa NovelBoundary 0 0.00 85.31 69.04 83.74 4.33 13.12 4.15 9.24 28.21 1.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 53.64 18.35 60.53 0.00 0.00 8.71 26 ER4a ExonRegion 0 1.48 28.36 1.23 1.55 3.74 7.69 0.89 1.68 0.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10.71 8.90 17.78 0.00 0.00 2.05 27 E4_Da NovelBoundary 0 3.41 101.50 61.44 86.70 11.04 10.79 9.94 6.82 12.44 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 62.68 31.34 56.57 2.35 0.00 7.85 28 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29 I4 Intron 0 1.39 48.79 20.03 41.64 3.87 1.04 0.51 5.32 7.78 1.06 0.00 0.29 0.14 0.08 0.11 0.16 0.12 4.32 2.27 18.52 0.08 0.34 0.11 30 I4_SR1 SilentIntronRegion 0 1.39 48.79 20.03 41.64 3.87 1.04 0.51 5.32 7.78 1.06 0.00 0.29 0.14 0.08 0.11 0.16 0.12 4.32 2.27 18.52 0.08 0.34 0.11 31 E5_Aa NovelBoundary 0 3.63 82.49 10.56 25.74 0.00 2.90 0.00 7.02 4.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.24 0.00 25.57 0.00 0.00 0.00 32 ER5a ExonRegion 0 2.77 29.65 13.28 15.77 3.92 0.00 0.87 3.36 5.21 0.37 0.00 0.00 3.37 0.29 1.34 0.65 0.00 10.04 0.69 15.14 0.00 0.00 0.00 33 ER5b ExonRegion 0 0.00 3.93 4.00 2.73 2.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.42 0.00 0.00 0.00