Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 PCA3 Gene 0 0.49 0.24 0.64 0.40 3.55 0.50 5.23 6.40 8.81 9.07 0.13 0.29 0.20 0.14 0.11 0.12 0.30 3.49 1.33 2.16 1.49 0.38 0.50 2 412654 Transcript 0 0.08 0.04 0.47 0.18 2.36 0.24 1.78 3.72 5.31 4.25 0.02 0.05 0.03 0.02 0.02 0.02 0.05 2.89 0.47 0.73 1.03 0.26 0.08 3 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.86 3.41 0.00 0.56 4.38 9.39 7.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.37 0.00 0.96 3.75 0.89 0.00 4 E1_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.21 19.10 6.22 17.92 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.33 3.07 0.00 0.00 0.00 5 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 Ix_AR2 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 1.11 3.18 11.10 0.00 4.07 29.54 24.38 42.65 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.62 3.01 2.48 1.59 0.00 0.00 7 Ix_AR3 ActiveIntronRegion 0 1.05 0.34 2.93 1.72 8.85 0.61 4.29 32.89 35.63 39.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.93 1.40 1.83 1.32 1.04 0.00 8 Ix_SR3 SilentIntronRegion 0 0.56 0.92 3.99 1.00 7.19 0.35 6.85 27.15 24.25 32.66 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.65 1.85 1.21 1.20 0.39 0.00 9 Ix_AR4 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.21 1.18 0.08 5.03 0.00 2.89 25.79 26.18 40.75 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12.42 3.15 1.11 1.56 0.22 0.00 10 Ix_SR4 SilentIntronRegion 0 0.70 0.00 3.51 0.42 1.77 0.61 6.18 23.20 29.81 27.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17.51 4.78 0.70 0.89 0.00 0.00 11 Ix_AR5 ActiveIntronRegion 0 1.06 1.02 1.83 2.37 5.35 0.00 8.39 23.19 26.07 33.61 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11.02 2.65 3.55 2.94 1.39 0.98 12 Ix_AR6 ActiveIntronRegion 0 0.99 0.38 2.38 1.18 8.36 0.44 9.68 23.95 27.64 45.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.19 2.59 1.90 1.49 1.16 0.23 13 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 1.69 0.00 0.83 1.13 3.68 8.75 5.13 3.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.46 0.98 0.62 1.36 0.00 0.00 14 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 1.02 0.00 8.90 0.00 2.58 6.54 12.05 10.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.20 0.89 1.19 0.61 0.58 0.00 16 E3_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16.08 13.06 9.37 10.93 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.73 0.00 3.26 11.61 0.00 0.00 17 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 ER4a ExonRegion 0 0.56 0.27 0.59 0.42 3.40 0.52 5.61 6.35 8.79 9.36 0.14 0.33 0.23 0.16 0.13 0.13 0.34 3.18 1.41 2.33 1.46 0.37 0.56