Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 RP11-475I24.2 Gene 0 0.59 0.48 4.48 0.96 0.79 0.87 0.24 0.92 0.66 2.53 0.23 0.00 0.00 0.63 0.08 0.12 0.00 2.03 1.70 1.05 0.09 0.25 0.12 2 435586 Transcript 0 2.06 1.06 5.09 0.23 0.17 0.16 1.43 0.28 0.77 2.02 0.53 0.00 0.00 0.73 0.06 0.09 0.00 3.46 2.89 0.40 0.33 0.22 0.49 3 428895 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 425309 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 ER1a ExonRegion 0 6.35 1.94 3.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.16 2.89 0.70 0.00 0.00 2.18 0.00 0.00 0.00 4.28 13.39 1.06 2.00 0.00 2.94 6 E1_Ab KnownBoundary 0 3.41 0.00 7.63 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.56 5.02 7.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.06 13.93 3.26 0.00 0.00 3.84 7 ER1b ExonRegion 0 1.31 1.17 3.35 0.00 0.49 0.67 0.23 0.00 1.00 2.80 0.61 0.00 0.00 0.63 0.00 0.00 0.00 2.43 4.84 0.61 0.49 0.00 0.61 8 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 5.50 0.00 0.00 0.00 4.46 0.00 0.00 1.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.91 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9 E1a_E2b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 E2_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 26.23 5.33 7.56 34.47 2.12 17.37 13.77 13.08 40.64 0.00 0.00 7.06 8.78 7.43 9.07 73.70 27.20 44.29 11.00 12.49 0.00 11 ER2a ExonRegion 0 3.12 3.10 8.51 0.00 0.00 0.00 3.55 0.00 0.00 3.20 1.93 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 ER2b ExonRegion 0 2.05 1.95 8.87 0.00 3.17 1.45 0.55 0.00 0.56 2.53 1.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.88 0.17 0.00 0.00 0.00 0.00 13 E2_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 E2a_E2d KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 ER2c ExonRegion 0 2.57 1.13 8.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.54 0.73 0.20 0.00 0.00 0.54 0.00 0.00 0.00 4.38 1.11 0.00 0.00 0.84 0.00 16 E2_Ac KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 ER2d ExonRegion 0 0.00 1.18 0.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.88 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.74 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 E2_Db KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 E2b_E2d KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 ER2e ExonRegion 0 0.00 0.16 5.07 1.41 1.00 0.34 0.54 1.69 0.92 3.55 0.34 0.00 0.00 1.65 0.35 0.56 0.00 3.31 2.34 1.36 0.00 0.46 0.00 21 E2_Ad KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 ER2f ExonRegion 0 0.00 0.59 9.48 3.41 0.00 0.47 0.21 4.59 0.61 8.18 0.06 0.00 0.00 1.88 0.09 0.00 0.00 1.73 0.13 3.34 0.00 0.34 0.00 23 E2_Dc KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 ER2g ExonRegion 0 0.12 0.12 3.97 1.20 1.10 1.62 0.08 0.61 0.43 1.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.71 0.94 1.25 0.00 0.25 0.00 25 E2_Dd KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 ER2h ExonRegion 0 0.34 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.52 0.00 0.00 0.00 0.00