Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 ANKRD20A1 Gene 0 0.53 1.91 2.99 1.93 0.93 1.52 2.06 2.84 1.85 1.81 0.34 1.56 0.32 2.52 0.67 0.23 1.19 0.63 0.38 2.95 0.02 0.07 0.06 2 254835 Transcript 0 0.06 0.24 0.18 0.10 0.03 0.08 0.11 0.27 0.20 0.17 0.00 0.03 0.00 0.03 0.02 0.02 0.02 0.13 0.03 0.18 0.00 0.00 0.01 3 485255 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 459943 Transcript 0 0.96 4.38 9.25 1.80 1.66 3.79 2.24 1.16 3.33 2.81 0.72 6.79 0.32 10.43 0.92 0.12 1.36 0.78 0.39 2.85 1.03 0.26 0.00 5 492311 Transcript 0 0.50 4.96 0.99 1.20 0.95 0.43 2.04 2.98 1.67 0.40 1.36 1.75 3.88 17.44 2.37 0.00 11.26 0.44 0.00 1.98 0.00 0.00 0.00 6 473324 Transcript 0 3.66 7.82 7.52 19.19 4.50 6.25 17.86 17.25 2.81 2.99 0.00 10.71 0.04 2.20 0.03 0.00 0.09 1.71 0.00 16.23 0.00 0.00 0.00 7 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 1.02 0.00 0.00 0.00 0.00 1.44 0.51 0.00 0.00 0.00 0.00 0.37 0.00 0.00 0.00 1.54 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 E1_Ab KnownBoundary 0 6.82 6.64 32.61 27.04 0.00 9.94 6.40 24.44 31.89 32.37 5.26 0.00 0.00 4.94 4.57 4.36 64.80 75.74 13.74 51.58 0.00 0.00 0.00 9 ER1b ExonRegion 0 0.00 0.00 1.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.10 0.85 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 E1_Ac KnownBoundary 0 0.00 15.19 54.61 52.77 8.06 5.56 10.33 22.18 37.73 39.81 7.74 0.00 0.00 12.36 9.27 12.90 45.63 151.43 26.54 111.28 0.00 0.00 3.84 11 ER1c ExonRegion 0 0.00 2.12 2.03 2.06 0.00 0.00 2.03 2.65 2.53 0.00 0.99 0.00 0.00 5.42 1.30 0.00 0.00 3.83 0.00 4.26 0.00 0.00 0.00 12 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 E1a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 E1a_E10a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.82 0.39 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 E2a_E4a NovelJunction 0 13.56 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 ER3a ExonRegion 0 0.00 1.53 4.28 0.25 0.00 0.52 0.02 0.80 1.85 1.32 0.01 1.89 0.00 6.85 2.02 0.00 0.00 0.58 0.00 1.35 0.32 0.00 0.00 19 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 9.01 14.37 1.96 0.00 5.22 0.00 0.00 6.19 5.08 0.00 12.60 0.00 19.01 0.00 0.00 0.00 2.24 0.00 2.75 2.97 0.00 0.00 20 E3a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 E4_Aa NovelBoundary 0 10.89 5.92 10.11 3.60 3.23 16.75 2.12 7.11 6.63 11.04 0.00 6.30 0.00 6.89 0.00 0.00 8.23 0.00 0.00 9.52 0.00 0.00 0.00 22 ER4a ExonRegion 0 2.88 4.13 13.39 3.43 4.97 6.14 6.72 3.49 3.79 3.35 2.15 7.78 0.96 12.29 2.77 0.37 4.08 0.10 1.18 5.79 0.14 0.77 0.00 23 E4_Da NovelBoundary 0 0.00 3.35 20.76 3.86 11.71 17.83 6.09 2.46 3.36 9.62 4.74 12.60 0.00 0.00 0.00 0.00 3.65 3.56 0.00 10.61 0.00 2.88 0.00 24 ER5a ExonRegion 0 0.00 1.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.75 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27 E6a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 28 ER7a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29 E7a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 30 E8a_E9a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 31 ER8a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 32 ER9a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 33 E9a_E10a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 34 ER10a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 35 ER10b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.63 0.00 0.00 0.00 0.00 1.26 0.00 0.00 1.38 0.00 0.00 0.51 0.00 0.00 0.00 36 E10a_E11a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 37 E11a_E12a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 38 ER11a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.24 0.00 0.00 0.00 0.00 3.64 0.00 0.00 6.60 0.00 0.00 2.13 0.00 0.00 0.00 39 ER12a ExonRegion 0 0.00 0.39 0.44 0.00 0.00 0.00 0.00 2.70 0.39 0.00 0.87 0.00 0.00 4.38 0.00 0.00 4.25 0.00 0.00 1.34 0.00 0.00 0.00 40 E12a_E13a KnownJunction 0 0.00 2.89 1.69 0.00 0.00 0.00 0.00 6.45 0.00 0.00 2.37 0.00 0.00 12.18 0.00 0.00 13.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41 E12a_E14b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 42 E13_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 20.34 1.27 3.99 0.00 6.40 7.64 2.98 0.00 0.00 6.00 6.82 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 43 ER13a ExonRegion 0 2.00 10.24 2.29 4.80 3.79 1.73 4.07 5.47 4.09 1.61 3.08 7.02 7.73 24.68 5.02 0.00 18.22 1.75 0.00 4.96 0.00 0.00 0.00 44 E13_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 22.06 0.00 0.00 0.00 0.00 6.70 5.15 4.78 0.00 18.91 0.00 0.00 5.69 0.00 0.00 0.00 4.80 3.26 0.00 0.00 0.00 45 E13a_E14b KnownJunction 0 0.00 6.71 0.00 0.00 0.00 0.00 4.11 0.00 2.58 0.00 0.00 0.00 7.79 32.90 4.45 0.00 13.46 0.00 0.00 2.94 0.00 0.00 0.00 46 E14_Aa NovelBoundary 0 0.00 8.88 5.56 29.70 11.04 11.81 16.91 37.38 8.22 25.38 0.00 6.30 0.00 5.06 0.00 0.00 0.00 3.44 8.47 38.93 0.00 0.00 0.00 47 ER14a ExonRegion 0 3.66 7.82 7.52 19.19 4.50 6.25 17.86 17.25 2.81 2.99 0.00 10.71 0.04 2.20 0.03 0.00 0.09 1.71 0.00 16.23 0.00 0.00 0.00 48 E14_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 49 ER14b ExonRegion 0 0.48 2.61 8.14 8.90 0.73 0.92 5.20 4.96 2.51 2.77 0.00 4.14 1.07 9.10 0.54 0.00 4.15 0.00 0.00 6.78 0.00 0.00 0.00 50 E14a_E15a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 51 E14a_E16a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 52 ER15a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.34 0.00 0.68 0.00 0.00 2.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 53 ER15b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 54 ER16a ExonRegion 0 1.03 0.01 2.85 0.38 0.00 0.00 1.13 1.54 0.00 0.00 0.00 0.42 0.00 2.13 1.27 0.00 1.05 0.00 0.00 0.97 0.00 0.00 0.00 55 E16a_E17a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 56 ER17a ExonRegion 0 0.82 5.42 0.00 0.00 0.00 0.00 1.49 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 57 E17_Da KnownBoundary 0 7.48 29.80 13.10 5.99 12.99 41.68 8.97 2.55 5.06 0.00 0.00 5.85 0.00 0.00 0.00 0.00 8.98 0.00 0.00 18.92 0.00 0.00 0.00 58 ER17b ExonRegion 0 0.87 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.54 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 59 E17b_E18a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 60 ER18a ExonRegion 0 0.14 1.67 2.18 1.72 0.58 1.51 1.52 3.35 2.23 2.59 0.08 0.57 0.08 0.19 0.31 0.39 0.29 0.74 0.55 3.23 0.00 0.00 0.13