Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 RP11-390F4.4 Gene 0 1.85 2.37 9.74 4.53 0.26 0.00 0.00 0.00 0.18 0.50 21.74 5.16 13.21 4.40 24.89 1.73 3.20 0.53 8.65 3.51 0.43 1.21 0.28 2 413145 Transcript 0 1.18 1.44 10.88 3.60 0.13 0.00 0.00 0.00 0.09 0.25 25.14 2.76 8.24 3.02 28.76 2.83 3.67 1.34 7.23 4.40 0.34 0.65 0.23 3 IG17_AR2 ActiveIntergenicRegion 0 7.14 0.96 1.25 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.44 0.00 3.31 0.00 20.08 5.83 1.10 1.27 1.87 0.96 1.60 0.00 0.00 4 ER1a ExonRegion 0 3.32 3.19 5.87 2.88 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17.57 1.40 4.55 4.71 25.02 2.49 4.80 0.99 5.71 3.31 1.70 0.00 1.15 5 E1_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 1.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.68 13.95 28.73 4.83 39.31 16.66 4.11 2.11 0.00 2.81 0.00 0.00 0.00 6 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 9.55 2.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 32.53 0.00 6.01 0.00 55.26 8.72 4.30 4.89 11.48 11.63 0.00 0.00 0.00 7 I1 Intron 0 1.54 0.82 2.98 0.49 0.51 0.02 0.09 0.00 0.20 0.05 4.51 2.66 11.97 3.13 15.82 3.37 2.89 0.58 2.54 3.42 0.15 0.17 0.99 8 I1_SR1 SilentIntronRegion 0 1.54 0.82 2.98 0.49 0.51 0.02 0.09 0.00 0.20 0.05 4.51 2.66 11.98 3.13 15.82 3.37 2.90 0.58 2.54 3.42 0.15 0.17 0.99 9 Ix Intron 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 I1 Intron 0 1.28 1.02 2.17 1.02 0.11 0.00 0.03 0.05 0.00 0.18 3.92 2.13 12.01 3.65 14.16 3.23 3.45 0.58 1.66 2.71 0.09 0.13 1.35 12 I1_SR1 SilentIntronRegion 0 1.28 1.02 2.18 1.02 0.11 0.00 0.03 0.05 0.00 0.18 3.92 2.14 12.02 3.65 14.17 3.23 3.45 0.58 1.67 2.71 0.09 0.13 1.35 13 E2_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 6.83 3.33 0.00 0.00 2.25 0.00 1.42 1.13 7.69 0.00 48.54 4.59 20.52 0.00 4.30 0.00 0.00 6.39 0.00 0.00 0.00 14 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.56 11.78 5.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23.62 3.16 4.26 1.72 21.85 1.51 0.95 0.82 7.54 2.96 0.02 1.72 0.00 15 E2_Da NovelBoundary 0 30.89 84.33 62.74 64.69 73.34 137.65 99.50 93.03 124.91 151.77 146.56 52.52 33.60 28.37 42.77 92.28 121.46 152.42 129.32 228.38 74.69 163.25 103.20 16 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 16.88 2.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29.32 0.00 0.00 2.12 14.22 0.00 4.11 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 I2 Intron 0 0.71 2.73 5.51 0.68 0.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.78 2.65 6.48 3.14 17.98 1.99 1.11 0.00 1.07 6.42 0.00 0.00 0.99 18 I2_SR1 SilentIntronRegion 0 0.71 2.75 5.55 0.69 0.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.83 2.67 6.52 3.16 18.10 2.01 1.11 0.00 1.08 6.47 0.00 0.00 0.99 19 E3_Aa NovelBoundary 0 3.78 0.00 8.31 2.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.50 4.63 0.00 13.64 7.06 20.89 16.75 0.00 0.00 4.52 5.88 0.00 0.00 0.00 20 ER3a ExonRegion 0 2.56 3.44 10.33 5.11 0.65 0.00 0.00 0.00 0.44 1.24 22.65 9.23 26.41 6.56 27.47 1.45 4.19 0.00 11.43 4.11 0.00 1.51 0.00 21 IG18 Intergenic 0 1.13 0.62 5.10 2.10 0.10 0.00 0.41 0.00 0.14 0.85 3.92 3.50 9.26 3.31 14.43 2.16 2.53 0.63 4.14 4.23 0.08 0.00 0.67 22 IG18_SR1 SilentIntergenicRegion 0 1.13 0.62 5.10 2.10 0.10 0.00 0.41 0.00 0.14 0.85 3.92 3.50 9.26 3.31 14.44 2.16 2.53 0.63 4.15 4.24 0.08 0.00 0.67