Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 RP11-403H13.1 Gene 0 1.95 0.56 0.34 1.12 1.23 0.17 1.47 1.43 0.85 0.47 0.18 4.86 3.21 1.27 0.83 2.19 2.44 0.17 0.29 0.59 0.00 0.00 0.54 2 445708 Transcript 0 0.84 0.35 0.24 0.77 0.48 0.55 0.79 0.56 0.75 0.18 0.17 2.21 1.59 0.57 0.48 1.27 1.27 0.06 0.28 0.20 0.00 0.00 0.25 3 ER1a ExonRegion 0 0.00 1.25 1.12 3.71 0.00 0.00 2.44 0.00 0.00 0.00 1.19 2.19 2.37 0.82 1.26 1.83 4.06 0.00 1.96 0.00 0.00 0.00 0.00 4 E1_Da NovelBoundary 0 13.11 6.12 4.35 0.00 0.00 0.00 0.00 1.68 0.00 0.00 5.16 0.00 6.98 0.00 4.45 4.36 0.00 0.00 0.00 5.94 3.15 0.00 0.00 5 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 Ix_AR1 ActiveIntronRegion 0 10.88 2.88 1.19 3.04 8.32 0.00 5.47 1.70 0.69 0.64 0.00 1.08 9.79 0.76 2.68 4.48 4.89 0.00 2.47 1.29 0.00 0.00 1.38 7 Ix_AR2 ActiveIntronRegion 0 1.04 0.00 0.00 0.60 1.77 0.31 3.17 0.22 0.98 0.51 0.00 10.75 17.89 0.19 3.02 2.51 2.34 0.10 0.00 1.37 0.00 0.00 0.00 8 Ix_SR5 SilentIntronRegion 0 12.21 1.61 4.77 3.42 3.38 0.72 3.22 7.98 6.49 3.47 0.61 7.33 12.07 0.53 2.75 4.93 3.78 1.81 0.50 2.22 1.85 0.33 0.70 9 Ix_AR5 ActiveIntronRegion 0 4.45 2.77 0.45 0.74 3.14 0.00 1.34 1.87 1.15 1.92 0.00 5.98 16.83 0.00 3.45 4.38 2.18 2.21 1.67 2.60 0.23 0.00 0.77 10 Ix_SR6 SilentIntronRegion 0 20.25 2.35 2.74 3.67 7.26 0.61 4.89 5.95 3.76 3.04 0.77 6.37 11.86 0.68 4.54 7.44 6.48 1.78 2.45 3.03 1.00 0.10 1.96 11 Ix_AR6 ActiveIntronRegion 0 11.65 3.52 0.55 0.73 2.72 0.87 5.93 2.88 1.75 1.36 0.69 11.67 12.72 0.32 0.49 1.06 6.61 0.55 1.59 5.51 0.00 0.00 0.35 12 Ix_AR7 ActiveIntronRegion 0 2.07 0.50 1.64 4.42 3.42 1.12 5.31 3.62 1.63 2.71 0.24 4.28 18.42 0.00 2.82 3.94 4.52 0.38 1.17 1.43 0.00 0.51 0.00 13 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.04 0.09 0.99 0.00 0.00 0.49 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.05 2.48 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.67 0.00 0.00 2.49 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 ER3a ExonRegion 0 4.96 1.19 0.54 1.19 1.54 0.19 1.95 2.26 1.45 0.50 0.00 10.15 7.82 1.90 2.03 2.61 2.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.72 16 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 ER4a ExonRegion 0 0.92 0.00 0.00 0.44 1.74 0.00 1.14 1.68 0.80 0.74 0.00 3.15 0.92 1.29 0.00 1.94 2.75 0.40 0.00 1.39 0.00 0.00 0.00