Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 C9orf92 Gene 0 2.33 4.68 0.00 0.00 1.34 1.47 6.62 0.52 0.00 0.00 1.16 1.58 2.43 0.38 1.64 1.19 3.30 1.29 1.59 7.86 1.75 1.67 1.75 2 380685 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3 380683 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 357468 Transcript 0 10.62 20.32 0.00 0.00 6.12 6.68 27.70 0.00 0.00 0.00 5.21 7.19 11.06 1.74 7.46 5.39 14.97 5.84 7.25 35.75 6.98 5.69 6.63 5 433347 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 443715 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7 IG22_AR5 ActiveIntergenicRegion 0 4.86 0.22 1.67 0.43 5.00 1.29 50.25 1.85 0.65 0.99 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.42 0.10 9.86 69.62 100.19 39.02 8 IG22_SR5 SilentIntergenicRegion 0 7.93 0.00 1.40 0.61 5.97 2.94 48.28 3.40 1.89 0.33 0.19 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13.84 0.00 8.17 73.65 116.13 50.63 9 IG22_AR4 ActiveIntergenicRegion 0 10.07 0.00 2.14 0.42 6.33 5.06 71.83 4.75 1.46 1.19 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10.72 0.00 9.80 79.02 137.03 41.59 10 IG22_SR4 SilentIntergenicRegion 0 8.24 0.00 0.45 1.36 2.61 1.16 69.26 8.69 1.24 1.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.88 0.00 8.23 65.82 116.13 39.18 11 IG22_AR3 ActiveIntergenicRegion 0 17.19 1.98 3.13 0.76 8.28 4.22 74.99 5.67 2.84 1.11 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12.70 0.00 10.41 80.45 174.63 46.84 12 IG22_SR3 SilentIntergenicRegion 0 16.69 0.60 2.82 1.58 8.89 2.70 68.78 2.99 0.63 0.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10.01 0.00 8.58 67.86 102.12 42.56 13 IG22_AR2 ActiveIntergenicRegion 0 18.10 0.93 3.11 0.67 5.09 1.10 37.52 3.89 0.24 1.46 0.38 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.72 0.00 8.39 58.43 92.49 27.68 14 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 E1a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 E2a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 E3_Aa NovelBoundary 0 708.79 1069.61 1502.93 2437.89 712.05 321.63 1544.10 1952.04 2395.61 1551.95 342.30 276.09 297.87 133.44 129.67 559.25 816.08 1165.67 514.46 1155.11 281.52 272.86 439.88 19 ER3a ExonRegion 0 21.24 40.64 0.00 0.00 12.23 13.36 55.39 0.00 0.00 0.00 10.42 14.38 22.11 3.48 14.92 10.77 29.94 11.68 14.50 71.50 13.97 11.38 13.27 20 E3_Da NovelBoundary 0 40.53 49.14 99.35 129.65 27.84 20.16 52.51 79.60 107.72 47.01 6.74 24.16 27.27 4.77 0.00 11.36 12.90 33.99 20.80 50.56 10.63 11.33 18.78 21 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 ER4a ExonRegion 0 0.00 1.46 0.00 0.00 0.00 0.06 1.12 0.00 0.00 0.00 0.18 0.00 0.00 0.00 0.00 0.09 0.21 0.12 0.00 0.20 0.00 0.00 0.00 23 ER4b ExonRegion 0 0.00 0.66 0.00 0.00 0.00 0.00 0.36 0.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.13 0.28 24 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.55 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.06 0.00 25 E4a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.06 0.86 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.76 1.63 1.93 27 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 28 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.85 1.73 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29 ER6b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.29 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 30 ER6c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 31 ER6d ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 32 ER6e ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00