Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 AC105049.1 Gene 0 3.22 5.30 2.28 1.10 1.74 0.40 0.14 99.33 99.97 3.34 0.21 0.75 0.21 0.00 0.33 0.00 1.25 7.59 0.69 6.93 0.48 0.91 0.96 2 449360 Transcript 0 1.25 2.06 0.88 0.43 0.68 0.15 0.06 39.49 41.01 1.30 0.08 0.29 0.08 0.00 0.13 0.00 0.49 2.94 0.27 3.32 0.19 0.35 0.37 3 IG49_SR2 SilentIntergenicRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.20 3.14 13.92 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.19 0.00 0.00 2.08 0.00 4 IG49_SR1 SilentIntergenicRegion 0 0.55 0.21 0.00 0.11 0.00 0.00 0.03 8.78 20.51 0.40 0.05 0.19 0.10 0.25 0.23 0.00 0.17 1.39 1.00 1.89 0.11 0.05 0.23 5 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.47 6.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.17 0.00 0.00 0.00 6 E1_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 1.12 0.00 0.00 0.00 0.00 14.46 32.52 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.44 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 I1 Intron 0 0.47 0.09 0.00 0.00 0.36 0.00 0.12 7.84 26.87 0.15 0.00 0.32 0.00 0.00 0.09 0.27 0.30 2.59 0.57 1.62 0.20 0.09 0.26 8 I1_SR1 SilentIntronRegion 0 0.47 0.09 0.00 0.00 0.36 0.00 0.12 7.85 26.91 0.15 0.00 0.32 0.00 0.00 0.09 0.27 0.30 2.60 0.57 1.62 0.20 0.09 0.26 9 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.76 1.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 I2 Intron 0 0.91 1.06 0.38 0.11 0.35 0.14 0.15 20.54 38.12 0.70 0.07 0.40 0.00 0.12 0.00 0.17 0.18 2.04 0.89 1.91 0.08 0.39 0.22 11 I2_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.34 0.66 0.16 0.00 0.44 0.00 0.05 12.75 31.92 0.23 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.24 0.00 1.31 0.65 1.61 0.00 0.34 0.48 12 I2_SR2 SilentIntronRegion 0 1.64 0.26 0.43 0.00 0.00 0.00 0.18 15.89 31.45 0.17 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.75 0.77 2.06 0.00 0.00 0.00 13 I2_AR2 ActiveIntronRegion 0 0.13 1.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25.42 33.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.83 0.81 1.92 0.04 0.00 0.00 0.00 14 I2_AR3 ActiveIntronRegion 0 0.77 0.25 0.44 0.24 0.00 0.00 0.00 16.84 31.53 0.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.69 1.00 1.54 2.08 0.27 0.00 0.00 15 I2_SR3 SilentIntronRegion 0 1.18 1.66 0.47 0.15 0.50 0.27 0.25 26.46 45.53 1.26 0.14 0.79 0.00 0.23 0.00 0.22 0.12 2.87 0.83 2.12 0.08 0.62 0.22 16 E3_Aa NovelBoundary 0 2.82 0.00 1.57 0.00 0.00 0.00 0.00 48.71 100.03 2.95 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.60 0.00 3.07 2.53 0.00 0.00 17 ER3a ExonRegion 0 3.75 6.17 2.65 1.28 2.03 0.46 0.17 115.24 115.49 3.89 0.24 0.87 0.24 0.00 0.39 0.00 1.46 8.83 0.81 7.80 0.56 1.05 1.11 18 IG48 Intergenic 0 2.59 2.19 0.20 0.02 0.60 0.00 0.13 16.15 11.29 0.18 0.00 0.15 0.00 0.01 0.00 0.03 0.00 0.24 0.00 0.29 0.02 0.14 0.06 19 IG48_AR2 ActiveIntergenicRegion 0 11.78 16.03 0.33 0.18 2.17 0.00 0.78 59.59 42.48 0.31 0.00 0.32 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.73 0.00 0.77 0.26 20 IG48_SR2 SilentIntergenicRegion 0 3.21 2.13 0.39 0.00 0.72 0.00 0.11 28.11 17.67 0.55 0.00 0.62 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.44 0.00 0.57 0.00 0.21 0.00 21 IG48_AR1 ActiveIntergenicRegion 0 0.88 0.36 0.00 0.00 0.32 0.00 0.00 16.92 10.89 0.20 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.18 0.00 0.49 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00