Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 AC103705.1 Gene 0 3.24 6.61 6.24 10.96 4.16 1.08 25.29 7.77 4.03 4.91 2.78 22.62 35.12 6.21 8.70 20.93 20.68 18.94 6.30 24.71 11.16 1.13 12.11 2 328323 Transcript 0 3.24 6.61 6.24 10.96 4.16 1.08 25.29 7.77 4.03 4.91 2.78 22.62 35.12 6.21 8.70 20.93 20.68 18.94 6.30 24.71 11.16 1.13 12.11 3 IG3 Intergenic 0 5.86 8.22 8.75 14.56 5.98 2.04 17.60 9.36 6.12 4.76 4.33 20.93 27.74 8.72 27.65 38.69 23.80 22.00 10.64 18.59 8.78 1.85 9.98 4 IG3_AR1 ActiveIntergenicRegion 0 7.06 25.95 4.84 14.12 0.00 6.46 15.32 6.42 1.38 3.25 7.23 35.15 14.07 11.37 57.20 67.37 10.53 6.60 4.93 4.96 4.25 2.38 3.08 5 IG3_SR1 SilentIntergenicRegion 0 12.03 17.44 23.28 32.46 8.22 3.96 26.08 19.01 10.51 8.79 3.95 25.50 38.65 9.10 43.52 53.13 28.74 16.08 14.46 16.88 5.41 2.29 10.63 6 IG3_AR2 ActiveIntergenicRegion 0 11.87 11.64 24.03 43.77 9.74 0.72 23.12 16.17 10.71 5.11 2.75 21.62 34.54 10.21 37.10 42.39 21.07 17.13 6.18 15.41 4.90 0.33 11.07 7 IG3_AR3 ActiveIntergenicRegion 0 2.12 19.21 29.00 32.71 5.35 1.83 38.98 12.10 14.82 6.88 1.50 41.85 32.83 9.93 14.51 35.34 18.34 11.09 15.93 8.51 8.08 0.00 9.79 8 IG3_SR2 SilentIntergenicRegion 0 8.58 11.46 17.95 23.69 7.37 3.17 23.22 11.83 6.96 8.10 4.35 25.52 39.09 9.07 36.14 49.15 26.84 15.73 10.39 15.98 4.66 1.95 11.61 9 IG3_AR4 ActiveIntergenicRegion 0 10.66 11.46 15.28 23.88 7.79 3.26 28.92 15.86 8.56 9.84 5.90 31.84 47.98 12.60 51.60 72.84 42.30 29.91 19.85 21.88 11.76 2.28 16.38 10 IG3_SR3 SilentIntergenicRegion 0 6.22 13.15 9.52 20.55 7.80 2.07 24.99 7.37 5.63 5.41 4.64 29.66 41.58 9.41 35.56 45.37 26.88 14.80 10.19 16.13 6.93 1.84 9.77 11 IG3_AR5 ActiveIntergenicRegion 0 13.22 15.66 10.35 22.43 10.11 1.60 23.85 14.22 4.55 7.95 3.09 47.37 50.91 9.12 33.55 25.05 16.31 5.87 7.87 14.23 1.60 1.21 7.25 12 IG3_SR4 SilentIntergenicRegion 0 5.95 11.84 9.05 19.70 9.36 1.00 22.85 7.90 5.66 4.85 3.55 29.85 47.72 8.42 36.65 35.78 20.53 11.96 6.83 18.01 4.82 1.79 10.33 13 IG3_AR6 ActiveIntergenicRegion 0 4.48 11.29 9.50 16.42 6.71 0.65 24.07 7.15 3.12 7.73 1.53 25.00 27.12 11.71 29.00 45.01 28.76 11.41 7.59 13.75 5.44 1.10 11.38 14 IG3_SR5 SilentIntergenicRegion 0 7.42 8.37 7.93 18.73 6.12 0.98 17.26 14.14 5.47 7.43 5.01 20.87 27.89 10.33 43.60 54.60 37.24 26.88 15.30 17.84 10.41 1.43 14.78 15 IG3_AR8 ActiveIntergenicRegion 0 9.40 12.55 11.02 17.83 9.31 2.44 31.63 16.35 6.44 7.78 5.96 36.23 51.02 9.06 42.11 56.80 32.14 14.22 14.46 15.85 8.22 1.94 13.78 16 IG3_SR6 SilentIntergenicRegion 0 4.89 6.28 7.22 12.81 5.81 1.61 17.62 8.38 5.40 4.38 2.53 23.04 25.11 7.16 28.79 36.12 23.69 12.85 9.47 14.36 6.33 1.24 9.81 17 IG3_AR9 ActiveIntergenicRegion 0 3.95 4.64 6.73 11.90 2.59 0.00 13.27 6.08 3.11 4.57 6.75 10.69 10.28 6.73 21.81 38.98 19.88 15.32 5.53 12.50 9.35 0.01 11.94 18 IG3_SR7 SilentIntergenicRegion 0 4.12 3.90 5.58 15.34 3.13 0.53 11.65 5.52 6.03 3.54 1.50 15.36 5.74 7.32 27.67 26.07 24.04 9.65 7.56 12.67 11.64 1.82 5.54 19 IG3_AR11 ActiveIntergenicRegion 0 2.59 5.59 5.73 7.52 2.68 0.62 13.72 4.89 4.45 1.75 2.13 14.53 9.35 6.32 18.72 24.97 21.03 6.23 7.79 12.74 8.71 1.05 5.71 20 IG3_SR8 SilentIntergenicRegion 0 8.20 8.01 5.14 7.64 2.81 0.96 14.63 0.00 4.98 1.53 4.20 17.94 18.28 9.69 33.26 34.19 26.34 8.99 15.37 6.23 6.11 0.00 16.26 21 IG3_AR12 ActiveIntergenicRegion 0 8.30 4.07 7.06 12.50 2.01 0.81 9.36 4.95 3.45 3.41 1.28 21.54 31.41 4.37 31.11 33.91 21.41 16.33 4.58 9.54 7.54 1.15 10.89 22 IG3_SR10 SilentIntergenicRegion 0 2.52 4.79 7.31 10.82 2.68 1.11 11.36 4.91 3.95 3.17 2.63 11.23 14.57 7.68 29.15 24.75 24.41 11.33 5.32 12.13 10.01 1.31 4.27 23 IG3_AR13 ActiveIntergenicRegion 0 4.45 5.40 10.84 15.72 4.93 1.69 17.98 12.01 9.57 6.69 14.12 27.39 32.07 22.76 37.38 50.47 34.68 28.67 8.62 24.39 10.99 2.38 10.53 24 IG3_SR11 SilentIntergenicRegion 0 2.94 2.61 4.28 7.49 3.53 0.66 10.44 3.76 3.28 2.41 1.58 15.78 17.39 4.44 17.23 24.25 16.51 11.41 4.90 7.49 5.05 0.55 5.17 25 IG3_AR14 ActiveIntergenicRegion 0 1.56 1.31 1.93 2.73 0.57 0.15 6.95 0.94 1.60 1.72 2.37 5.71 6.71 3.74 7.74 16.59 10.55 13.49 3.71 11.03 6.65 0.92 4.49 26 IG3_SR12 SilentIntergenicRegion 0 2.56 3.13 2.91 5.47 2.60 0.57 9.28 2.99 2.74 1.61 1.17 18.02 13.09 3.36 12.98 17.42 12.64 7.89 4.27 8.65 4.56 0.68 5.40 27 IG3_AR15 ActiveIntergenicRegion 0 15.97 32.61 42.44 58.15 22.12 16.65 35.43 44.86 29.98 19.94 69.97 90.92 67.45 114.05 111.76 147.05 110.58 102.71 42.81 79.38 55.54 21.57 37.05 28 IG3_SR13 SilentIntergenicRegion 0 14.03 16.67 14.88 28.49 14.89 5.55 25.57 16.77 11.11 7.56 10.68 24.14 38.93 14.41 45.85 76.34 34.75 54.80 18.83 32.43 14.89 4.91 16.63 29 IG3_AR16 ActiveIntergenicRegion 0 5.91 10.57 8.57 17.22 7.48 1.98 29.14 15.40 11.58 11.17 7.66 34.13 65.52 12.98 34.30 64.91 34.66 45.20 15.39 34.23 14.72 2.92 13.81 30 IG3_SR14 SilentIntergenicRegion 0 3.40 6.78 6.71 11.05 6.13 1.15 17.68 8.86 6.64 4.33 4.45 16.44 28.63 8.78 27.67 41.77 24.81 30.62 11.89 25.61 12.29 1.90 11.55 31 IG3_AR17 ActiveIntergenicRegion 0 7.63 4.19 7.19 14.20 10.32 1.65 25.25 17.03 9.34 4.36 4.94 20.73 32.84 12.17 32.30 48.04 24.84 39.99 17.61 30.59 12.60 2.52 13.19 32 IG3_SR15 SilentIntergenicRegion 0 7.66 10.21 12.40 11.70 5.80 1.70 19.30 13.66 7.11 4.80 3.61 21.44 32.61 7.78 32.57 36.29 23.03 31.26 12.98 31.24 13.09 1.52 10.04 33 IG3_AR18 ActiveIntergenicRegion 0 1.77 5.15 4.70 8.59 2.22 1.01 17.50 8.65 7.80 4.86 3.47 18.27 27.54 7.84 14.48 42.14 32.22 43.18 14.57 32.94 14.92 2.16 9.56 34 IG3_AR19 ActiveIntergenicRegion 0 2.29 7.73 14.03 11.24 3.22 1.25 14.70 9.87 10.18 5.97 5.64 25.19 50.54 8.77 23.40 48.33 34.58 46.14 21.95 30.27 17.83 3.30 10.75 35 IG3_AR20 ActiveIntergenicRegion 0 1.83 9.99 13.56 19.66 10.17 0.37 49.93 21.43 19.57 10.02 9.02 66.00 143.72 22.05 50.48 102.64 67.04 60.48 20.39 53.43 25.86 10.56 26.10 36 IG3_SR16 SilentIntergenicRegion 0 3.17 2.71 8.17 14.08 9.37 1.83 31.55 10.66 11.12 2.29 0.97 52.68 58.63 17.59 18.86 27.24 25.31 19.71 1.59 29.79 9.55 2.08 2.94 37 IG3_AR21 ActiveIntergenicRegion 0 5.86 3.39 5.96 11.31 9.28 1.83 22.15 10.14 9.10 1.41 1.93 37.95 65.50 12.29 17.50 34.97 20.69 10.29 2.76 33.48 12.19 1.11 1.66 38 IG3_SR17 SilentIntergenicRegion 0 3.63 7.51 4.41 9.12 3.70 1.65 13.37 7.01 5.14 3.12 2.77 15.53 27.61 6.08 18.74 25.27 19.44 21.80 9.44 18.87 10.34 1.59 7.93 39 IG3_AR22 ActiveIntergenicRegion 0 2.41 4.62 5.34 14.18 4.35 0.89 15.70 13.39 9.57 4.16 2.51 17.21 37.42 7.18 15.86 34.27 16.62 31.32 20.69 24.54 13.96 1.69 9.06 40 IG3_SR18 SilentIntergenicRegion 0 4.69 6.20 0.48 3.66 3.51 0.65 11.14 7.00 2.02 2.12 1.56 20.78 17.91 3.63 10.66 28.44 12.63 15.94 15.13 18.04 9.37 0.00 6.97 41 IG3_AR23 ActiveIntergenicRegion 0 1.15 3.54 1.68 4.30 2.52 0.00 6.01 10.00 3.88 1.87 1.02 8.84 36.31 6.31 10.78 36.77 14.90 24.81 12.97 18.69 8.03 0.00 19.89 42 IG3_AR24 ActiveIntergenicRegion 0 6.04 7.25 2.60 7.97 3.82 0.65 18.19 7.81 6.89 6.40 2.41 18.77 30.90 7.89 13.82 28.62 32.37 26.53 9.66 20.49 9.82 0.74 8.90 43 IG3_SR19 SilentIntergenicRegion 0 2.86 3.96 3.06 7.05 3.66 1.18 15.01 5.44 3.40 3.66 2.05 15.77 17.24 5.41 15.90 31.45 18.17 18.61 8.04 15.16 7.09 0.79 11.00 44 IG3_AR25 ActiveIntergenicRegion 0 5.73 6.88 5.99 10.98 4.24 0.85 17.02 9.22 6.69 3.96 6.93 19.58 35.73 10.57 34.25 41.29 29.44 38.32 20.01 18.20 16.72 0.73 13.84 45 IG3_SR20 SilentIntergenicRegion 0 1.09 4.99 2.79 5.88 2.66 0.42 11.42 5.07 3.36 3.34 1.56 8.20 14.04 4.15 15.90 22.03 14.76 20.90 7.46 15.92 6.87 0.62 6.40 46 IG3_AR26 ActiveIntergenicRegion 0 3.73 7.86 7.93 13.78 7.17 3.62 24.65 6.61 7.27 4.94 10.23 27.45 42.31 24.58 26.07 40.65 34.59 30.53 15.41 30.05 11.72 3.82 14.83 47 IG3_SR21 SilentIntergenicRegion 0 1.23 4.05 1.89 7.39 2.41 2.68 14.85 5.73 3.62 4.06 2.20 18.53 33.54 9.54 12.82 16.02 20.86 17.60 9.77 23.10 10.31 0.36 10.50 48 IG3_AR27 ActiveIntergenicRegion 0 1.38 2.99 5.91 6.72 3.17 1.90 18.03 2.14 1.68 2.66 2.90 23.47 20.84 12.01 22.00 28.38 22.29 12.90 13.96 22.19 8.19 2.38 16.30 49 IG3_SR22 SilentIntergenicRegion 0 2.23 3.45 3.77 4.92 2.96 0.04 13.50 7.25 2.62 3.35 2.47 20.16 22.52 8.56 15.89 24.17 24.44 22.14 12.72 24.42 9.73 0.70 13.57 50 IG3_AR28 ActiveIntergenicRegion 0 2.12 10.17 1.06 8.00 2.68 3.67 11.30 7.72 2.80 2.52 3.09 11.55 29.08 7.69 14.31 23.18 16.72 17.98 6.58 22.55 17.19 2.08 12.53 51 IG3_AR29 ActiveIntergenicRegion 0 2.12 5.89 0.00 6.10 3.52 3.67 15.96 10.10 1.56 3.08 3.87 22.10 33.82 9.23 17.71 14.86 17.37 17.89 7.54 24.86 13.57 3.95 19.17 52 IG3_AR30 ActiveIntergenicRegion 0 3.06 6.99 3.90 6.67 2.55 1.93 19.70 9.85 3.42 3.22 6.09 13.77 45.77 9.51 13.12 27.21 23.89 27.48 11.58 25.52 15.19 0.88 12.59 53 IG3_SR23 SilentIntergenicRegion 0 2.50 3.92 2.78 5.93 1.69 1.38 19.15 4.62 2.88 2.78 1.77 15.20 30.37 5.73 6.35 18.87 20.06 12.07 7.04 23.38 8.17 0.88 8.66 54 ER1a ExonRegion 0 3.24 6.61 6.24 10.96 4.16 1.08 25.29 7.77 4.03 4.91 2.78 22.62 35.12 6.21 8.70 20.93 20.68 18.94 6.30 24.71 11.16 1.13 12.11 55 IG4 Intergenic 0 3.78 10.15 9.93 18.57 6.26 2.00 15.54 9.73 4.17 3.41 1.70 9.16 18.63 4.10 14.68 19.90 14.51 14.15 6.36 16.05 6.77 0.54 8.72 56 IG4_SR1 SilentIntergenicRegion 0 2.97 2.61 3.90 8.20 1.88 0.64 5.45 4.93 3.20 2.42 2.07 13.29 24.43 4.39 13.57 19.11 15.52 22.05 13.11 17.35 7.21 0.49 8.59 57 IG4_AR1 ActiveIntergenicRegion 0 1.14 3.07 3.67 8.48 0.87 1.29 9.21 7.13 3.35 5.56 1.76 3.13 10.69 4.45 11.28 8.77 14.99 5.78 3.35 14.93 4.26 0.28 7.84 58 IG4_SR2 SilentIntergenicRegion 0 4.17 11.62 10.49 19.20 7.44 2.29 16.34 10.85 4.55 3.66 1.88 9.69 21.06 4.23 15.86 21.56 15.12 14.30 6.07 17.27 7.30 0.67 9.54 59 IG4_AR2 ActiveIntergenicRegion 0 4.62 9.36 15.54 30.44 4.58 1.39 18.57 8.23 2.43 1.62 0.47 7.50 4.55 3.27 11.50 15.86 11.89 16.37 5.26 9.46 4.16 0.00 5.57 60 IG4_SR3 SilentIntergenicRegion 0 0.76 8.73 7.80 15.54 4.31 1.64 21.27 5.95 4.23 2.14 0.69 5.33 8.59 2.77 8.40 16.90 8.71 6.36 6.27 9.82 5.92 0.00 3.68