Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 LYNX1 Gene 0 6.13 2.09 11.04 6.50 5.89 22.70 4.57 24.94 42.54 6.63 0.00 0.03 0.00 0.07 0.00 0.00 0.00 21.65 8.67 8.96 94.54 24.92 94.35 2 345173 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3 335822 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 398906 Transcript 0 1.21 0.70 3.64 4.81 1.22 10.97 3.18 3.59 7.79 0.39 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.25 2.55 5.79 21.51 1.20 18.29 5 395192 Transcript 0 0.00 0.00 0.86 0.00 0.00 0.43 0.00 0.00 1.74 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.55 0.75 1.51 6.86 1.45 6.20 6 317543 Transcript 0 2.19 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.07 0.63 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 ER1b ExonRegion 0 1.51 0.67 6.62 0.40 0.59 0.20 0.15 2.54 3.61 1.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.17 4.55 2.10 13.00 4.12 22.86 9 E1a_E4a KnownJunction 0 3.78 0.00 0.00 1.47 0.00 0.00 0.00 0.00 1.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.82 0.00 0.00 26.50 0.00 11.27 10 ER2a ExonRegion 0 2.42 1.40 0.96 1.69 2.45 19.05 6.36 3.23 5.06 0.78 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.01 5.10 1.79 16.70 2.40 32.47 11 E2a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 6.33 7.92 0.00 2.90 0.00 3.94 10.53 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.49 0.00 9.78 26.32 0.00 4.10 12 E3_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.05 8.71 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.51 0.00 5.82 5.44 11.82 16.13 13 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 1.72 0.00 0.00 0.87 0.00 0.00 3.48 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.10 1.50 3.01 11.24 2.89 12.40 14 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 15 I3 Intron 0 4.29 0.00 2.46 0.98 0.26 0.53 1.66 1.24 5.32 1.32 0.00 0.59 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.96 2.15 2.05 14.87 6.83 21.52 16 I3_SR1 SilentIntronRegion 0 5.95 0.00 2.73 1.21 0.00 0.74 1.97 1.08 6.72 1.78 0.00 0.73 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.88 2.65 2.85 17.22 8.82 25.47 17 I3_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 2.95 0.65 1.55 0.00 1.46 2.81 2.91 0.21 0.00 0.39 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.45 0.00 14.60 2.89 19.09 18 ER4a ExonRegion 0 4.35 2.18 8.13 6.77 0.19 8.15 1.59 25.33 37.59 5.53 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41.31 16.70 10.72 126.12 28.70 131.63 19 E4a_E5a KnownJunction 0 2.96 6.71 14.81 7.99 10.61 31.46 9.76 62.60 58.97 9.11 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 39.21 22.02 23.39 122.94 25.60 137.26 20 ER5a ExonRegion 0 7.68 4.55 19.94 11.06 8.68 38.98 15.61 50.53 70.01 7.38 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 56.72 9.21 28.56 200.54 33.21 158.58 21 E5a_E6a KnownJunction 0 9.04 0.00 11.15 15.58 3.57 28.22 14.93 52.94 80.24 8.86 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 50.74 8.94 15.60 156.67 29.09 220.49 22 E5a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 ER6a ExonRegion 0 7.79 2.56 13.75 8.34 7.80 29.39 5.61 31.90 53.98 8.51 0.00 0.00 0.00 0.11 0.00 0.00 0.00 26.12 10.26 10.95 118.62 31.98 117.44 24 E7_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11.05 16.81 2.85 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.12 0.00 25 ER7a ExonRegion 0 4.38 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.14 1.25 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 E7a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27 ER8a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.91 1.16 1.30 1.27 0.00 1.93 17.29 1.26 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.30 1.55 0.00 3.06 1.01 1.34 28 E8a_E9a KnownJunction 0 0.00 0.00 3.49 1.47 0.00 5.28 0.00 4.15 33.16 1.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.18 0.00 0.00 29 ER9a ExonRegion 0 0.54 0.00 0.25 0.21 0.34 0.83 0.00 1.44 10.48 1.20 0.00 0.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.13 1.06 0.37 30 ER9b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00