Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 AC022731.4 Gene 0 4.94 2.40 1.45 2.29 3.38 2.62 4.09 1.10 1.04 1.36 1.30 7.50 9.02 4.09 5.19 4.32 3.35 0.82 2.89 3.33 1.00 1.29 2.22 2 499227 Transcript 0 4.65 0.70 0.25 0.56 3.15 0.90 0.80 0.87 0.56 0.33 1.76 3.83 3.06 1.87 2.26 1.56 1.48 0.14 1.22 0.62 0.52 0.50 0.53 3 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.51 2.55 0.00 0.76 2.83 0.00 0.91 0.81 1.18 0.66 0.00 0.00 0.00 1.75 1.24 0.58 4 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 I1_AR1 ActiveIntronRegion 0 6.26 1.89 3.28 3.60 4.63 6.62 4.42 5.39 8.18 2.41 4.12 7.88 22.07 10.37 7.72 11.71 4.91 1.31 1.64 1.91 1.74 1.87 2.13 6 I1_SR2 SilentIntronRegion 0 4.07 2.04 1.27 2.19 3.93 6.35 2.83 1.61 5.15 2.83 2.83 13.07 12.56 5.87 7.85 7.20 4.48 1.66 1.19 2.73 2.10 2.56 3.66 7 Ix Intron 0 12.07 8.05 4.05 4.50 7.20 3.20 3.67 3.88 5.39 3.25 3.06 12.06 21.41 8.26 8.04 5.41 4.97 1.24 2.27 2.36 1.92 2.47 3.72 8 Ix_AR1 ActiveIntronRegion 0 15.05 7.84 4.79 4.47 7.50 3.99 4.41 3.72 3.81 1.58 4.86 12.93 23.37 10.51 7.88 8.20 7.11 1.96 2.54 2.12 3.42 3.69 4.40 9 ER2a ExonRegion 0 7.36 1.26 0.00 1.26 1.89 0.00 0.00 0.38 0.02 0.00 0.68 7.60 2.40 1.41 3.75 1.85 0.00 0.00 3.96 0.00 0.00 0.00 0.00 10 E2_Da NovelBoundary 0 3.41 0.00 1.63 0.00 0.00 0.00 2.03 0.00 0.00 2.47 2.53 25.21 19.80 4.53 0.00 12.56 4.77 3.94 0.00 0.00 0.00 2.82 0.00 11 E2a_E3a KnownJunction 0 10.74 0.00 0.00 0.00 12.14 0.00 0.00 2.01 0.00 0.00 4.74 0.00 0.00 3.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 E3_Aa NovelBoundary 0 3.78 0.00 0.00 0.00 0.00 2.90 0.00 0.00 3.30 0.00 2.11 7.35 0.00 0.00 10.51 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 ER3a ExonRegion 0 9.54 0.86 0.00 0.00 4.43 3.48 0.84 2.07 0.39 0.72 5.07 8.59 9.13 3.27 5.71 3.13 6.26 0.00 1.34 0.45 0.93 0.88 0.62 14 E3_Da NovelBoundary 0 12.15 0.00 1.83 4.13 0.00 2.21 2.25 0.00 2.89 0.00 5.26 5.85 7.79 0.00 0.00 4.36 0.00 0.00 4.42 2.88 0.00 0.00 0.00 15 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 Ix Intron 0 14.08 1.40 0.56 5.75 5.11 1.12 4.15 1.77 1.27 1.57 0.74 10.73 11.96 2.62 4.55 4.09 4.29 0.35 2.68 0.81 0.67 0.16 2.02 17 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 14.12 1.40 0.56 5.77 5.13 1.13 4.16 1.78 1.27 1.57 0.74 10.76 12.00 2.63 4.57 4.10 4.30 0.35 2.69 0.82 0.68 0.16 2.03 18 E4_Aa NovelBoundary 0 9.93 6.51 8.93 0.00 0.00 8.18 0.00 1.73 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 12.99 4.39 2.57 0.00 5.62 3.15 0.00 0.00 19 ER4a ExonRegion 0 4.93 2.75 1.72 2.68 3.62 2.84 4.79 1.09 0.99 1.56 1.07 7.79 9.92 4.48 5.54 4.74 3.44 0.97 3.22 3.91 0.97 1.36 2.53