Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 C8orf46 Gene 0 1.16 0.57 0.72 2.24 0.96 3.19 0.83 0.69 2.48 1.21 0.00 1.23 0.14 0.80 0.42 0.53 0.06 0.48 0.46 1.03 1.15 0.26 0.79 2 482608 Transcript 0 0.47 0.00 0.00 0.23 0.00 0.76 1.05 0.28 0.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.84 0.00 0.33 0.00 0.30 0.71 0.61 1.47 0.23 0.52 3 498712 Transcript 0 0.61 0.86 0.00 0.57 0.00 0.00 3.48 0.00 2.97 1.55 0.00 0.00 0.00 0.16 0.29 0.00 0.00 0.26 0.46 0.00 0.00 0.00 2.42 4 470796 Transcript 0 0.00 0.68 0.00 0.23 0.00 0.00 0.66 1.21 1.02 0.38 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.92 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.49 5 490228 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6 305454 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.33 0.00 0.00 0.00 0.73 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 445469 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8 450307 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9 460144 Transcript 0 0.00 0.01 0.00 0.34 0.00 0.00 0.45 0.01 0.32 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 0.00 0.02 10 454839 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.48 1.33 0.06 0.00 0.00 0.31 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 484919 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.73 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.62 0.00 0.00 12 480005 Transcript 0 0.00 0.00 0.46 0.51 0.34 0.23 0.00 0.33 0.93 0.22 0.00 2.71 0.00 0.21 0.00 0.75 0.00 0.00 0.00 0.00 0.56 0.00 0.37 13 485639 Transcript 0 0.00 0.41 0.00 0.00 0.00 1.54 0.26 0.00 0.85 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.58 0.00 0.00 0.00 0.00 0.43 0.44 0.00 0.59 14 488582 Transcript 0 0.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.39 0.09 0.00 0.13 0.36 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.08 0.00 0.00 0.00 15 ER1a ExonRegion 0 2.35 0.00 0.00 1.13 0.00 2.03 4.40 1.33 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.61 0.00 1.65 0.00 1.51 3.53 2.36 2.44 1.11 1.63 16 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.78 0.85 0.05 0.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.36 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.69 1.77 0.03 0.95 18 E2a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.15 0.00 0.00 19 ER3a ExonRegion 0 1.21 1.73 0.00 1.13 0.00 0.00 0.74 0.00 2.85 0.68 0.00 0.00 0.00 0.33 0.59 0.00 0.00 0.53 0.91 0.00 0.00 0.00 0.48 20 E3a_E4b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.23 0.00 3.10 2.42 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.35 21 ER4a ExonRegion 0 0.00 1.36 0.00 0.45 0.00 0.00 1.32 0.00 0.82 0.76 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.98 22 ER4b ExonRegion 0 1.17 0.82 2.25 1.41 4.16 3.13 2.20 1.26 2.85 2.12 0.00 0.00 0.00 0.00 1.14 0.00 0.00 1.02 0.00 1.62 2.42 0.00 0.67 23 E4_Ac KnownBoundary 0 0.00 3.03 3.76 3.83 3.65 0.00 0.00 1.68 7.00 1.56 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.88 2.29 0.00 0.00 24 ER4c ExonRegion 0 0.00 0.47 2.80 1.36 0.49 4.55 0.04 1.81 4.12 0.50 0.00 0.00 0.00 0.97 0.00 0.69 0.00 0.00 0.00 2.91 3.60 0.00 0.00 25 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.73 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 E4a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.42 1.22 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.85 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27 ER5a ExonRegion 0 2.20 0.00 1.25 1.41 0.00 1.27 1.36 0.76 1.92 1.19 0.00 0.00 0.00 0.00 0.71 1.03 0.00 0.96 0.00 1.49 0.00 1.45 0.00 28 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.33 0.00 0.00 0.00 0.73 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29 E6_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.71 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 30 ER6b ExonRegion 0 0.00 0.34 0.00 0.00 0.39 0.92 0.07 0.00 1.11 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.07 0.00 0.00 0.00 0.00 1.96 31 E6_Ac KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 32 E6_Ad KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 33 E6_Ae KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.51 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.85 0.00 0.00 3.03 0.00 0.00 34 ER6c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.32 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.70 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 35 ER6d ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.45 1.32 0.00 0.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.10 0.00 0.00 1.84 0.00 0.00 36 ER6e ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.44 0.19 0.00 1.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.39 0.00 0.00 4.22 0.00 0.00 37 E6_Af KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.69 0.00 0.00 1.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.06 0.00 0.00 2.59 0.00 0.00 38 E6_Ag KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.73 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.78 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 39 ER6f ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.34 0.00 0.00 1.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.62 0.00 0.00 0.92 0.00 0.00 40 ER6g ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.77 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 1.49 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.23 0.00 0.00 0.36 0.00 0.00 41 E6a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.95 0.00 0.00 6.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.35 0.00 0.00 42 ER7a ExonRegion 0 0.23 0.00 0.00 0.00 0.00 1.17 0.28 0.00 0.39 1.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.23 0.00 0.00 0.00 43 E7a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 44 ER8a ExonRegion 0 0.00 1.82 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.88 4.17 0.02 0.00 1.47 0.00 0.00 0.00 1.96 0.00 3.30 0.00 0.00 3.31 0.00 2.10 45 E8a_E9a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 46 E8a_E10a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 47 E8a_E10b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.42 2.55 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.76 0.00 0.00 2.72 0.00 3.67 48 ER8b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 49 E9_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 14.07 21.98 0.00 0.00 4.50 9.94 12.15 3.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 50 ER9a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.45 3.98 0.18 0.00 0.00 0.92 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 51 E9a_E10b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 52 ER10a ExonRegion 0 0.00 0.01 0.00 0.67 0.00 0.00 0.89 0.01 0.64 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 0.00 0.04 53 E10_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 2.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.59 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 54 ER10b ExonRegion 0 2.53 1.12 0.00 0.00 0.00 0.00 1.24 0.87 3.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.00 0.00 1.17 0.88 0.00 1.89 55 E10_Da KnownBoundary 0 7.11 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.69 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 56 ER10c ExonRegion 0 1.90 0.00 0.00 0.95 0.00 3.70 0.00 0.43 0.89 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.25 0.00 0.39 57 E10b_E11a KnownJunction 0 3.19 0.00 0.00 2.06 0.00 8.92 0.00 1.89 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.97 0.00 3.33 58 E10b_E12a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 59 ER11a ExonRegion 0 1.33 0.00 0.00 0.75 0.00 3.90 0.00 2.93 2.23 0.65 0.00 0.00 0.00 1.70 0.00 2.44 0.00 0.00 0.00 0.00 2.42 0.00 4.22 60 E11_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.03 0.00 0.00 61 E11a_E12a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.55 4.54 0.00 0.00 0.00 0.00 4.77 0.00 0.00 0.00 1.70 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 62 E11_Db KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 63 ER11b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 64 ER11c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.73 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.62 0.00 0.00 65 ER12a ExonRegion 0 0.37 0.00 0.00 1.04 0.00 1.43 0.00 0.81 3.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.65 0.00 1.94 66 E12_Da KnownBoundary 0 3.11 0.00 0.00 1.83 0.00 0.00 0.00 0.00 4.22 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.59 67 E12a_E14a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 68 E12_Db KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 69 E12b_E13a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.56 0.00 0.00 1.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 70 E12b_E14a KnownJunction 0 6.74 0.00 0.00 1.70 0.00 8.69 0.00 0.00 5.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.15 0.00 0.00 71 ER12b ExonRegion 0 4.09 0.00 0.00 2.00 0.00 5.44 0.04 0.00 4.69 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.06 0.00 1.08 72 ER12c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.46 0.51 0.34 0.23 0.00 0.33 0.93 0.22 0.00 2.71 0.00 0.21 0.00 0.75 0.00 0.00 0.00 0.00 0.56 0.00 0.37 73 ER13a ExonRegion 0 0.00 0.82 0.00 0.00 0.00 0.53 0.52 0.00 0.20 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.17 0.00 0.00 0.00 0.00 0.85 0.88 0.00 1.18 74 ER14a ExonRegion 0 1.78 0.00 0.84 1.43 0.07 5.50 0.00 0.00 5.30 0.09 0.00 0.00 0.00 1.80 0.00 2.74 0.00 0.00 0.00 0.00 2.67 0.00 0.39 75 E14_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 1.66 1.63 0.00 5.34 0.00 0.00 4.80 0.00 0.00 0.00 0.00 4.89 0.00 4.02 0.00 0.00 0.00 0.00 3.15 0.00 0.00 76 ER14b ExonRegion 0 1.92 0.92 1.28 4.41 1.79 5.43 1.20 1.12 3.93 2.12 0.00 2.14 0.30 1.53 0.74 0.78 0.13 0.27 0.82 1.80 1.59 0.45 0.92 77 ER14c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00