Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 PEBP4 Gene 0 2.05 0.58 0.21 0.23 0.15 0.94 0.15 0.59 0.73 0.00 0.44 1.22 0.22 1.50 0.74 0.17 0.56 0.00 0.55 0.00 1.76 1.43 0.84 2 256404 Transcript 0 2.32 0.47 0.29 0.46 0.04 0.78 0.06 0.81 1.07 0.00 0.20 0.61 0.33 0.81 0.88 0.04 0.14 0.00 0.34 0.00 1.32 1.51 0.30 3 ER1a ExonRegion 0 3.74 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 E1a_E2a KnownJunction 0 2.89 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 ER2a ExonRegion 0 2.38 1.51 0.63 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.05 0.00 1.44 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.19 0.00 0.82 1.22 1.09 6 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 1.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.14 0.00 7 ER3a ExonRegion 0 1.70 0.00 0.69 0.31 0.00 1.57 0.00 1.03 0.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.94 0.51 1.18 8 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 1.24 2.00 0.00 5.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.45 0.00 9 I3_SR5 SilentIntronRegion 0 0.32 0.30 0.24 0.00 0.00 0.00 0.20 0.38 0.00 0.13 3.94 0.00 0.58 0.90 0.00 0.22 12.15 0.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 I3_SR6 SilentIntronRegion 0 0.25 0.00 0.87 0.00 0.00 0.00 0.00 0.15 0.00 0.51 5.95 1.50 0.98 1.10 0.00 0.00 18.02 0.50 0.30 0.00 0.12 0.00 0.00 11 I3_AR9 ActiveIntronRegion 0 0.23 0.00 1.74 0.00 0.17 0.00 0.00 0.57 0.00 0.19 4.67 0.00 0.85 0.77 0.00 0.33 16.58 0.47 0.15 0.00 0.27 0.00 0.00 12 ER4a ExonRegion 0 1.39 0.29 0.14 0.65 0.00 0.82 0.00 2.15 1.04 0.00 0.00 1.84 0.00 0.30 1.05 0.00 0.00 0.00 1.45 0.00 2.11 3.18 0.00 13 E4a_E5a KnownJunction 0 3.48 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.46 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.33 0.00 14 I4_AR4 ActiveIntronRegion 0 1.57 0.00 0.00 0.00 0.22 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20.23 2.92 3.77 14.57 8.86 1.07 6.58 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.34 15 I4_SR5 SilentIntronRegion 0 0.44 0.00 0.00 0.06 0.24 0.00 0.12 0.00 0.17 0.00 14.42 12.00 8.76 12.22 3.89 0.63 6.82 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 I4_AR5 ActiveIntronRegion 0 1.48 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10.63 19.92 25.33 7.47 5.80 0.00 9.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 I4_SR6 SilentIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12.73 17.20 14.36 7.32 2.78 0.52 6.73 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 I4_AR6 ActiveIntronRegion 0 1.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12.17 21.72 22.73 7.69 2.58 0.00 7.58 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 I4_SR7 SilentIntronRegion 0 0.15 0.00 0.06 0.04 0.06 0.04 0.03 0.00 0.03 0.00 8.53 3.86 2.17 8.51 3.12 0.57 4.05 0.00 0.00 0.00 0.24 0.09 0.13 20 I4_AR7 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 1.23 0.42 0.00 0.00 0.00 0.00 1.24 0.00 11.60 11.99 4.69 14.99 19.64 0.00 23.11 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 I4_AR8 ActiveIntronRegion 0 0.63 0.00 1.23 1.36 0.00 0.00 0.00 0.00 0.68 0.00 7.92 19.05 4.69 16.24 9.28 0.15 24.43 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 I4_AR9 ActiveIntronRegion 0 2.12 0.00 0.25 1.36 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.13 12.54 3.23 20.78 4.60 5.12 13.89 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 I4_SR8 SilentIntronRegion 0 2.12 0.00 0.00 1.36 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.80 4.33 4.69 16.78 8.70 5.94 8.25 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 I4_AR10 ActiveIntronRegion 0 0.65 0.00 0.00 0.03 0.20 0.13 0.00 0.00 0.00 0.00 17.20 9.76 7.68 26.94 13.76 1.91 12.22 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.22 25 I4_AR11 ActiveIntronRegion 0 2.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.65 2.27 0.00 15.62 5.53 0.00 3.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 I4_SR9 SilentIntronRegion 0 0.13 0.00 0.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.28 0.00 13.28 11.71 13.64 19.77 11.02 2.65 13.90 0.00 0.00 0.00 0.11 0.08 0.00 27 I4_AR12 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.03 12.66 10.82 6.75 8.03 2.29 22.85 0.00 0.00 0.00 0.00 2.08 0.00 28 I4_SR10 SilentIntronRegion 0 0.24 0.00 0.00 0.00 0.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.65 4.91 3.36 15.33 4.72 1.66 10.76 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.33 29 I4_SR11 SilentIntronRegion 0 0.18 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14.61 18.10 16.47 26.17 6.93 1.79 14.43 0.00 0.00 0.00 0.38 0.00 0.25 30 I4_AR14 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.29 0.00 7.67 2.49 3.16 18.63 6.56 0.75 9.95 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.74 31 I4_AR15 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.24 0.00 2.51 4.33 18.76 15.27 14.80 0.00 10.56 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 32 I4_AR16 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.08 0.00 10.39 13.61 6.86 23.60 11.41 0.64 11.32 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 33 I4_SR12 SilentIntronRegion 0 0.29 0.00 0.21 0.00 0.19 0.00 0.03 0.06 0.04 0.02 12.59 10.87 10.57 24.06 7.28 1.79 11.37 0.00 0.04 0.02 0.18 0.07 0.03 34 I4_SR13 SilentIntronRegion 0 0.42 0.00 0.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.27 12.59 10.24 13.26 5.23 0.96 8.50 0.14 0.00 0.00 0.00 0.00 0.29 35 I4_AR18 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.23 0.00 0.00 0.29 0.00 0.00 0.00 0.00 8.16 8.04 9.74 22.12 3.85 3.96 14.70 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 36 I4_AR19 ActiveIntronRegion 0 1.46 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19.46 8.02 7.76 16.98 11.17 0.00 16.48 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 37 ER5a ExonRegion 0 4.42 3.89 0.00 0.59 0.00 0.00 0.00 1.92 3.09 0.00 0.00 0.00 4.28 0.64 2.27 0.00 0.00 0.00 0.42 0.00 2.59 1.99 0.00 38 E5a_E6a KnownJunction 0 7.48 0.00 0.00 1.70 0.00 0.00 0.00 2.18 5.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.37 0.00 0.00 39 ER6a ExonRegion 0 0.80 0.00 0.00 0.67 0.00 0.00 0.59 0.82 1.15 0.00 0.86 4.79 0.00 4.05 2.16 0.00 0.00 0.00 1.37 0.00 3.03 0.93 0.00 40 E6a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.19 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41 ER7a ExonRegion 0 1.89 0.36 0.00 0.00 0.48 1.97 0.24 0.00 0.33 0.00 0.35 1.28 0.00 2.40 0.72 0.53 1.77 0.00 0.02 0.00 2.34 1.86 1.58