Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 AC073871.1 Gene 0 0.62 0.97 1.04 0.65 0.12 2.08 0.66 0.18 4.47 0.00 1.76 0.73 0.38 0.15 0.48 0.67 0.45 1.54 3.62 1.55 1.85 1.28 0.53 2 458645 Transcript 0 0.00 1.64 1.13 0.00 0.00 2.09 1.55 0.00 0.88 0.00 3.26 0.00 0.00 0.62 0.00 0.00 1.01 0.00 2.35 0.00 2.24 0.00 0.00 3 418309 Transcript 0 0.00 3.03 0.83 0.00 0.00 1.45 0.00 1.07 2.55 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.23 1.92 1.92 4.76 2.12 0.00 0.00 0.00 0.00 4 435354 Transcript 0 2.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.18 1.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.36 0.00 0.00 0.26 0.00 0.00 0.55 0.00 0.00 5 447933 Transcript 0 0.00 0.00 1.83 4.93 8.57 2.90 0.00 0.00 4.20 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.07 6.05 0.00 0.00 6 440711 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 425712 Transcript 0 0.00 1.14 0.00 0.37 0.00 1.28 1.07 0.00 3.60 0.00 1.37 1.80 1.55 0.00 0.86 1.27 0.00 0.00 3.99 2.02 1.18 1.67 1.30 8 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 1.23 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9 ER1b ExonRegion 0 0.00 1.24 2.45 0.00 0.00 1.94 1.03 0.00 0.89 0.00 2.26 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.46 0.00 0.00 0.98 0.00 0.00 10 E1_Da NovelBoundary 0 3.63 9.21 5.03 1.73 12.31 38.56 8.44 0.00 4.20 7.58 7.63 0.00 0.00 9.77 0.00 0.00 8.60 27.73 46.31 9.20 18.84 2.51 3.84 11 E1a_E2a KnownJunction 0 3.78 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 E1a_E3a KnownJunction 0 0.00 6.05 1.66 0.00 0.00 2.90 0.00 2.14 5.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.45 3.85 3.83 9.49 4.24 0.00 0.00 0.00 0.00 13 E1a_E4a KnownJunction 0 0.00 6.58 3.31 0.00 0.00 8.18 6.18 0.00 3.53 0.00 13.06 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 4.02 0.00 9.41 0.00 8.96 0.00 0.00 14 ER1c ExonRegion 0 1.65 6.10 2.45 0.00 0.00 7.27 3.87 1.34 3.93 0.00 9.23 0.00 0.00 0.78 4.84 1.54 2.69 5.95 2.83 0.00 5.71 0.00 0.00 15 E2_Aa NovelBoundary 0 11.26 39.93 21.29 17.18 27.67 75.58 9.67 22.14 82.46 18.86 29.32 11.85 6.82 61.28 56.86 65.37 31.88 136.46 75.30 39.18 62.52 13.29 28.34 16 ER2a ExonRegion 0 0.33 0.00 0.00 0.00 0.00 0.37 0.23 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.27 0.00 0.00 0.52 0.00 0.00 1.10 0.00 0.00 17 E2_Da NovelBoundary 0 30.38 253.24 12.45 29.57 109.00 183.93 56.13 8.05 77.23 19.02 7.37 52.07 35.87 40.14 45.99 22.64 17.58 28.93 56.85 27.04 8.77 14.02 14.08 18 I2 Intron 0 5.13 20.45 5.97 12.41 25.09 51.92 15.70 4.57 16.79 4.86 3.21 11.90 9.61 6.84 4.04 2.01 4.74 7.92 12.83 13.96 0.99 2.76 2.15 19 I2_SR1 SilentIntronRegion 0 4.51 15.35 6.09 11.03 23.46 55.62 16.22 5.00 15.86 3.85 2.72 8.67 9.98 7.47 4.00 2.65 5.19 9.08 13.92 15.19 1.12 2.71 2.13 20 I2_AR1 ActiveIntronRegion 0 6.84 32.93 6.18 16.35 30.60 48.28 15.85 4.03 20.13 7.41 4.51 19.75 9.61 6.06 4.43 0.80 4.17 6.12 11.53 12.49 0.80 3.08 2.36 21 ER3a ExonRegion 0 0.00 2.03 0.00 0.00 0.00 1.83 0.00 1.73 4.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.07 2.97 3.30 5.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 ER3b ExonRegion 0 0.00 0.05 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 0.68 2.20 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.55 0.77 0.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 ER4a ExonRegion 0 0.00 1.48 0.80 0.39 0.75 1.03 0.50 0.68 3.35 0.00 3.61 0.00 0.00 0.60 0.54 0.79 2.41 1.94 1.29 0.19 3.77 0.00 0.00 25 E4_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27 E4a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 1.83 4.93 8.57 2.90 0.00 0.00 4.20 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.07 6.05 0.00 0.00 28 ER4b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.78 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.18 2.58 0.00 0.00 0.00 0.00 30 E5_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 31 E5a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 32 ER5b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 33 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.40 0.00 0.65 0.00 0.00 1.25 1.36 0.00 0.72 0.00 0.00 0.00 5.60 2.25 3.10 0.00 1.03 34 E6a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 35 ER7a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.18 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 36 ER8a ExonRegion 0 2.55 3.19 4.40 2.83 0.28 7.51 1.83 0.28 17.98 0.00 5.70 2.68 1.04 0.42 1.01 2.19 0.72 4.62 13.61 6.26 4.77 5.62 1.94 37 E8_Da KnownBoundary 0 0.00 5.26 2.87 3.90 0.00 0.00 8.48 0.00 19.97 0.00 4.11 18.91 0.00 0.00 0.00 3.93 0.00 2.20 3.48 12.72 2.41 5.02 0.00 38 ER8b ExonRegion 0 0.00 3.42 0.00 1.12 0.00 3.85 1.80 0.00 10.15 0.00 4.10 4.16 3.28 0.00 1.86 3.80 0.00 0.00 6.37 3.83 0.44 5.00 2.88