Order	SeqName	SeqType	IsAE	NBL01_MYCN	NBL05_MYCN	NBL09_MYCN	NBL10_MYCN	NBL02	NBL03	NBL04	NBL06	NBL07	NBL08	NBL11_Rel2	NBL11_Rem1	NBL11_Rel1	NBL12_Rel_Left	NBL12_Rel_Right	NBL13_Rel_Left	NBL13_Rel_Right	NBL14_MYCN_Met	NBL14_MYCN_Pri	NBL15_MYCN_Rel1	SKP01	SKP02	SKP03
1	ABP1	Gene	0	0.76	1.38	2.59	0.96	0.51	1.03	1.34	1.78	2.28	1.33	0.10	0.59	1.38	0.45	5.43	0.34	2.28	2.64	1.18	2.20	0.14	0.40	0.86
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29	E6_Ab	KnownBoundary	0	0.00	3.35	0.00	0.00	4.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	9.66	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
30	E6_Ac	KnownBoundary	0	0.00	0.00	2.90	0.00	0.00	0.00	0.00	2.38	0.00	1.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	8.98	0.00	0.00	5.69	0.00	0.00	0.00
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33	E6a_E7a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
34	E6a_E8a	KnownJunction	0	11.04	0.00	1.80	2.06	0.00	5.79	4.50	5.01	1.74	1.40	0.00	0.00	6.17	0.00	13.35	0.00	4.77	0.00	0.00	0.00	0.00	3.12	4.35
35	E7_Aa	NovelBoundary	0	88.24	77.68	76.43	83.84	44.48	35.55	94.11	103.18	86.60	114.92	23.01	7.20	18.83	7.65	16.94	16.06	74.71	132.53	53.93	63.47	41.70	26.15	56.25
36	ER7a	ExonRegion	0	2.62	5.47	4.92	2.95	1.66	2.28	3.29	1.60	2.67	1.77	0.00	2.11	10.10	3.46	8.24	3.70	0.68	5.34	1.98	3.97	2.29	0.86	3.06
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40	E8_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	1.36	5.63	0.00	2.90	0.00	2.22	3.36	0.00	0.00	0.00	8.28	0.00	0.00	0.00	8.70	1.53	0.00	3.26	0.00	0.00	0.00
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42	E8_Db	KnownBoundary	0	3.78	0.00	1.74	0.00	0.00	5.79	2.25	1.60	1.48	0.00	0.00	0.00	0.00	2.47	4.70	0.00	0.00	4.52	0.00	5.75	0.00	0.00	0.00
43	ER8d	ExonRegion	0	0.66	1.23	2.98	0.00	0.00	1.35	1.83	2.94	2.56	0.42	0.00	0.00	0.00	0.52	7.77	0.00	1.26	2.18	1.93	2.63	0.00	0.00	0.00
44	E8_Dc	KnownBoundary	0	0.00	0.00	5.62	0.00	0.00	0.00	1.68	0.00	2.78	1.61	0.00	0.00	0.00	0.00	6.30	0.00	4.68	2.49	0.00	2.56	0.00	0.00	0.00
45	E8c_E8c	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
46	ER8e	ExonRegion	0	0.92	0.80	5.32	0.00	0.72	1.59	1.44	2.32	4.82	3.55	0.00	0.00	0.00	1.26	8.41	0.00	2.94	4.41	0.69	3.51	0.00	0.00	0.00
47	E8_Ac	KnownBoundary	0	0.00	2.76	8.60	0.00	3.57	0.00	4.20	0.00	4.72	4.62	0.00	0.00	0.00	2.47	5.19	0.00	4.30	2.16	0.00	9.27	0.00	0.00	0.00
48	ER8f	ExonRegion	0	0.00	1.33	4.58	1.13	1.92	2.03	6.59	3.33	4.82	1.83	0.00	1.98	1.22	0.48	8.48	0.00	4.92	6.63	0.00	6.87	0.00	0.00	1.63
49	E8_Ad	KnownBoundary	0	0.00	0.00	3.67	0.00	4.33	0.00	3.27	2.55	0.00	1.18	0.00	0.00	6.82	0.00	9.39	0.00	9.16	5.39	0.00	5.11	0.00	0.00	0.00
50	ER8g	ExonRegion	0	2.06	0.05	5.64	0.00	1.61	0.46	0.33	3.02	2.16	1.52	0.00	0.00	2.11	0.57	7.91	0.00	2.48	5.36	0.00	8.03	0.00	0.00	0.00
51	E8_Ae	KnownBoundary	0	3.26	0.00	5.38	0.00	0.00	0.00	0.00	2.46	3.36	1.67	0.00	0.00	0.00	2.47	0.00	0.00	0.00	4.97	0.00	8.69	0.00	0.00	0.00
52	ER8h	ExonRegion	0	0.24	0.97	2.86	1.44	0.78	4.01	2.44	4.54	3.47	1.94	0.00	0.00	0.00	0.42	16.97	0.00	6.29	2.28	1.52	0.80	0.00	0.00	3.60
53	E8d_E9a	KnownJunction	0	0.00	0.00	3.37	2.06	4.33	2.38	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	19.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.35
54	ER9a	ExonRegion	0	1.95	0.00	3.68	1.06	2.30	2.90	2.33	1.73	0.25	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	17.64	0.00	3.37	0.00	5.48	5.15	0.00	0.00	1.29
55	E9_Da	KnownBoundary	0	6.52	0.00	1.57	0.00	8.15	2.67	2.12	4.19	0.00	1.34	0.00	0.00	0.00	0.00	4.45	0.00	7.29	1.87	7.34	8.69	0.00	0.00	0.00
56	E9a_E10a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
57	ER9b	ExonRegion	0	0.50	0.44	2.93	0.00	2.05	1.06	2.69	1.47	1.16	2.40	0.00	0.00	0.83	0.00	9.63	0.00	4.87	0.60	2.28	4.44	0.00	0.45	1.27
58	E9b_E10a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.77	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
59	E9b_E11a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
60	E9b_E11b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.72	3.74	0.00	1.37	0.00	0.00	0.00	0.00	13.35	0.00	3.74	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
61	E10a_E11b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
62	ER10a	ExonRegion	0	0.00	0.00	1.07	0.00	0.00	0.00	1.32	0.00	0.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.86	0.00	0.00	0.00
63	ER10b	ExonRegion	0	0.00	3.17	3.49	0.00	1.00	0.71	2.90	0.00	2.11	0.67	0.00	6.81	4.30	2.07	3.83	3.36	0.00	0.00	1.24	2.37	0.00	0.78	1.14
64	E10_Db	NovelBoundary	0	3593.08	4047.31	10067.15	10535.32	4095.59	3107.81	4776.82	9601.39	9495.88	8247.53	1595.77	1605.37	1501.52	982.41	2003.84	3946.23	3124.54	14367.95	2963.76	5122.39	2321.78	1475.42	3629.72
65	E10b_E11b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
66	ER11a	ExonRegion	0	0.00	0.00	2.01	0.09	0.05	0.00	0.84	0.06	1.11	0.04	0.00	0.15	0.00	0.03	2.20	0.15	0.06	1.69	0.00	7.04	0.00	0.04	0.00
67	E11_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	1.74	0.00	0.00	0.00	3.97	0.00	1.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.57	0.00	2.36	0.00	0.00	0.00
68	ER11b	ExonRegion	0	1.33	2.01	3.27	1.93	0.03	1.99	2.16	3.01	0.98	2.21	0.00	0.11	3.47	0.00	14.79	0.07	0.98	2.67	0.00	1.31	0.00	0.03	0.00
69	E11_Da	KnownBoundary	0	0.00	3.35	1.51	2.06	0.00	2.90	0.00	2.46	0.00	1.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.75	0.00	0.00	0.00
70	E11a_E11c	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.71	2.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.79	1.67	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
71	E11_Ac	KnownBoundary	0	0.00	0.00	3.16	1.66	0.00	0.00	1.77	2.26	0.00	1.45	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.68	2.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
72	ER11c	ExonRegion	0	0.00	2.03	3.68	1.36	0.00	3.67	1.32	1.73	1.24	3.44	0.00	0.00	14.07	0.00	17.99	0.00	6.60	1.85	0.00	2.13	0.00	0.00	0.00
73	ER11d	ExonRegion	0	0.00	0.75	2.80	0.83	0.00	2.31	1.93	4.28	0.91	3.14	0.00	0.28	5.20	0.00	8.51	0.00	6.31	1.12	0.00	2.45	0.00	1.04	0.00
74	E11b_E12a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.36	0.00	0.00	0.00	2.25	4.68	0.00	1.67	0.00	0.00	0.00	0.00	8.90	0.00	4.02	0.00	0.00	0.00	0.00	3.12	0.00
75	ER12a	ExonRegion	0	1.00	0.00	2.00	0.65	0.00	2.51	2.65	3.91	2.15	1.51	0.00	4.33	0.00	0.00	12.98	0.00	3.30	0.00	0.00	2.46	0.00	2.08	0.00
76	ER12b	ExonRegion	0	1.18	0.40	3.81	2.05	0.53	0.88	0.20	0.82	5.18	1.83	0.76	1.04	0.76	0.26	6.35	0.00	2.67	3.63	0.94	4.77	0.00	0.07	0.58
77	E12_Db	KnownBoundary	0	0.00	0.00	1.42	3.23	0.00	0.00	0.00	0.00	10.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.30	2.28	8.28	7.48	0.00	0.00	0.00
78	ER12c	ExonRegion	0	0.00	2.64	0.30	2.08	1.95	1.34	0.00	0.00	4.41	2.38	1.41	0.00	0.00	0.97	6.05	0.00	3.11	2.90	1.18	2.74	0.00	0.00	0.00
79	E12_Dc	KnownBoundary	0	0.00	0.00	1.57	1.96	0.00	0.00	0.00	0.00	4.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
80	E12_Dd	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.12	1.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
81	ER12d	ExonRegion	0	0.00	4.07	0.00	1.36	0.00	0.00	0.00	0.00	4.94	1.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.85	0.00	3.19	0.00	0.00	1.47
82	ER12e	ExonRegion	0	0.51	1.53	0.44	0.65	0.00	0.00	0.32	0.00	0.83	0.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.56	0.76	1.80	0.00	0.00	1.39
83	IG20_AR3	ActiveIntergenicRegion	0	1.39	16.47	13.68	4.00	4.10	9.59	10.02	3.83	15.49	0.00	0.85	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.20	10.53	35.48	14.74	0.80	1.37	1.93