Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 TRPV6 Gene 0 0.22 0.39 0.65 0.93 0.18 2.33 0.12 0.20 1.73 0.21 0.02 0.08 0.00 0.02 0.00 0.03 0.00 0.22 0.61 0.62 0.30 0.07 0.08 2 359396 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.28 0.00 0.18 0.00 0.00 0.00 3 436401 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 311470 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5 487077 Transcript 0 0.01 0.14 0.61 0.56 0.07 2.55 0.02 0.09 2.04 0.04 0.01 0.05 0.00 0.02 0.00 0.00 0.00 0.61 0.33 0.75 0.02 0.01 0.61 6 431833 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 1.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 489123 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8 474388 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9 463646 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10 485138 Transcript 0 0.00 0.00 0.50 0.21 0.32 1.74 0.09 0.00 0.56 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.03 0.41 0.00 0.00 0.00 11 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 ER1b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 E1_Ac KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 E1_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 E1a_E4b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 ER1c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 ER1d ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.20 0.00 0.46 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.70 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 E1_Db KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.25 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 ER1e ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 E1c_E1e KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 ER1f ExonRegion 0 0.03 0.28 0.23 0.35 0.15 0.89 0.04 0.18 1.27 0.08 0.03 0.11 0.00 0.03 0.00 0.00 0.00 0.19 0.66 0.62 0.03 0.03 0.00 22 E1_Ae KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.69 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.87 0.00 3.00 0.00 0.00 0.00 23 ER1g ExonRegion 0 0.00 1.86 0.00 0.52 0.00 0.70 0.00 0.00 4.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.51 0.00 0.68 0.00 0.00 0.00 24 E1_Af KnownBoundary 0 0.00 2.57 0.00 1.60 0.00 2.73 0.00 0.00 6.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 ER1h ExonRegion 0 0.00 0.68 1.84 1.36 0.00 1.83 0.00 0.00 7.72 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 E1_Dd KnownBoundary 0 0.00 0.00 3.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.86 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.58 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27 E1d_E1h KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 1.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 28 E1d_E1i KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.26 0.00 0.00 0.00 29 ER1i ExonRegion 0 0.00 0.00 2.45 1.68 0.00 0.63 0.00 0.00 7.65 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 2.05 0.00 0.00 0.00 30 ER1j ExonRegion 0 0.00 0.00 1.00 0.76 0.00 4.20 0.00 0.00 2.81 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.04 0.00 0.88 0.00 0.00 1.22 31 E1_Ah KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 1.47 0.00 19.87 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 32 ER1k ExonRegion 0 0.00 0.00 2.45 0.66 0.00 7.00 0.00 0.00 2.99 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.99 1.93 0.00 0.00 0.00 33 E1_Ai KnownBoundary 0 0.00 0.00 3.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.44 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.80 3.26 0.00 0.00 0.00 34 ER1l ExonRegion 0 0.00 0.00 1.27 0.77 0.00 1.53 0.00 0.00 3.28 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.52 2.44 0.00 0.87 1.20 35 E1_De KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.74 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.56 0.00 0.00 0.00 36 E1e_E1j KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 37 ER1m ExonRegion 0 0.00 0.00 0.75 0.84 0.00 1.25 0.00 0.19 1.43 0.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.93 0.00 0.29 0.01 38 E1_Aj KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.55 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 39 ER1n ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.09 0.00 1.55 2.76 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.25 0.00 0.00 0.00 40 E1_Df KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.59 1.53 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.39 0.00 0.00 0.00 41 ER1o ExonRegion 0 0.54 0.00 0.00 0.00 0.00 0.21 0.00 0.00 1.18 0.89 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.72 0.00 0.00 0.00 42 E1g_E2a KnownJunction 0 3.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 43 ER2a ExonRegion 0 2.12 0.00 2.10 0.00 0.00 3.54 0.00 0.00 1.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 44 ER2b ExonRegion 0 1.59 0.00 3.06 0.00 0.00 3.67 0.00 1.73 1.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 45 ER2c ExonRegion 0 1.80 0.00 4.41 0.00 0.00 5.07 0.00 1.73 1.42 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 46 E2b_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.36 1.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 47 ER2d ExonRegion 0 0.00 0.00 2.45 0.00 0.00 4.69 0.00 0.00 1.24 0.89 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 48 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.17 1.36 0.00 8.21 0.00 0.00 1.52 1.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.07 0.00 0.00 0.00 0.00 49 E3_Ab KnownBoundary 0 3.78 0.00 0.00 2.06 0.00 9.60 0.00 1.77 3.18 2.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.04 0.00 0.00 0.00 0.00 50 ER3b ExonRegion 0 0.00 0.00 2.40 1.15 0.00 1.03 0.00 0.00 2.79 0.49 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.04 1.76 0.00 0.00 0.00 0.00 51 E3_Ac KnownBoundary 0 0.00 0.00 2.66 1.96 0.00 0.00 0.00 0.00 1.62 1.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.24 0.00 2.81 0.00 0.00 0.00 52 ER3c ExonRegion 0 0.00 0.00 3.68 2.16 0.00 4.58 0.00 0.00 2.95 1.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.13 3.19 0.00 0.00 0.00 0.00 53 E3_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 1.83 1.93 0.00 8.46 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 54 E3a_E3d KnownJunction 0 0.00 0.00 3.31 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.24 1.48 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.05 0.00 0.00 0.00 0.00 55 ER3d ExonRegion 0 0.00 0.00 0.81 0.21 0.00 2.62 0.10 0.00 0.38 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 56 E3_Db KnownBoundary 0 0.00 0.00 1.15 0.00 0.00 0.00 2.25 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 57 ER3e ExonRegion 0 0.00 0.00 0.41 0.43 0.65 1.34 0.18 0.00 0.01 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.06 0.82 0.00 0.00 0.00 58 E3_Ad KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.26 0.00 0.00 0.00 59 ER3f ExonRegion 0 0.36 0.00 1.12 0.80 0.00 0.87 0.46 0.00 0.85 0.18 0.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.06 4.01 1.05 0.00 0.00 0.00 60 E3c_E4a KnownJunction 0 3.78 0.00 0.00 1.60 0.00 7.95 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.80 5.94 0.00 0.00 0.00 61 ER4a ExonRegion 0 0.35 0.00 2.57 1.40 0.00 2.79 0.00 0.00 0.86 0.00 0.57 1.11 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.84 1.61 0.70 0.00 0.00 0.00 62 E4_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 7.27 1.27 0.00 0.00 0.00 0.00 3.04 0.00 2.32 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 63 ER4b ExonRegion 0 0.00 0.00 4.15 2.53 0.00 0.00 0.00 0.00 0.95 0.00 0.00 0.15 0.00 0.00 0.00 2.55 0.00 0.10 0.00 0.63 0.00 0.00 0.00 64 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 1.15 3.33 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.07 0.00 0.00 0.00 65 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.00 2.82 2.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.98 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.07 0.00 1.55 0.00 0.83 0.00 0.00 0.00 66 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 7.16 7.72 0.00 0.00 0.00 0.00 1.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 67 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.00 2.90 3.38 0.00 6.07 0.00 0.00 2.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.27 0.00 0.02 0.00 0.00 1.46 0.00 0.00 68 E6_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 69 E6a_E6b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.25 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 70 ER6b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.58 0.00 0.00 2.15 0.00 0.00 1.11 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 71 E6_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 1.83 0.00 0.00 5.45 0.00 0.00 1.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 72 ER6c ExonRegion 0 0.00 0.00 2.70 0.66 0.00 2.43 0.00 0.00 2.70 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.77 0.00 0.83 0.98 0.00 0.00 0.00 0.00 73 E6b_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 2.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.66 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 74 ER7a ExonRegion 0 0.00 0.00 4.33 1.36 0.00 0.20 0.00 0.00 3.18 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.29 0.00 0.00 75 E7_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 6.24 1.76 0.00 0.00 0.00 0.00 3.91 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 76 E7_Db KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.15 0.00 0.00 77 E7b_E7b KnownJunction 0 0.00 0.00 1.66 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 78 ER7b ExonRegion 0 0.00 0.00 4.46 1.36 0.00 1.83 0.00 0.55 2.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.40 0.00 0.00 79 ER7c ExonRegion 0 1.20 0.91 1.51 3.45 0.76 5.75 0.75 0.33 5.13 0.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.46 0.59 0.83 80 E7_Ab KnownBoundary 0 0.00 6.45 1.63 3.00 0.00 2.16 0.00 0.00 3.39 1.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 81 ER7d ExonRegion 0 0.81 1.87 1.98 2.83 1.84 7.64 1.01 0.49 4.93 1.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.52 0.00 0.40 4.17 0.00 0.00 82 E7c_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 1.70 4.33 2.73 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.94 0.00 0.00 0.00 83 ER8a ExonRegion 0 0.71 0.97 0.69 0.71 0.50 14.14 0.00 0.00 0.88 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.05 0.00 0.00 84 E8a_E9a KnownJunction 0 3.41 0.00 1.39 0.00 0.00 2.61 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 85 ER9a ExonRegion 0 1.76 2.07 1.26 5.64 0.18 13.06 0.61 0.70 4.66 1.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.19 1.29 1.07 2.39 0.28 0.40 86 E9_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 1.39 3.80 0.00 16.87 1.72 2.55 17.42 1.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.57 4.42 3.26 0.00 0.00 0.00 87 ER9b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.11 0.00 4.43 0.44 0.00 2.26 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.13 0.00 0.00 0.00 88 ER9c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.13 0.00 0.00 0.00 89 ER9d ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.71 0.00 0.00 0.00