Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 GS1-259H13.1 Gene 0 3.06 0.37 0.53 2.94 1.45 1.06 3.40 2.42 3.20 3.40 1.54 0.26 0.00 0.89 2.35 1.51 0.48 0.93 5.42 0.54 5.74 1.73 1.59 2 431679 Transcript 0 0.27 0.16 0.00 0.45 1.73 1.19 0.16 0.27 0.81 0.25 0.10 0.00 0.00 0.00 0.52 0.46 0.00 0.00 0.79 0.00 1.42 0.29 0.00 3 453227 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 429679 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.23 0.00 0.00 0.30 0.00 0.00 0.00 1.23 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 ER1a ExonRegion 0 0.82 0.48 0.00 0.00 0.00 1.75 0.32 0.00 0.00 0.25 0.30 0.00 0.00 0.00 0.49 1.37 0.00 0.00 0.00 0.00 2.10 0.00 0.00 6 E1_Ab KnownBoundary 0 3.56 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.64 2.63 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.66 0.00 0.00 7 E1_Ac KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.93 8 ER1b ExonRegion 0 2.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.15 1.93 0.00 0.00 0.00 0.00 1.49 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9 ER1c ExonRegion 0 0.32 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.30 0.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.13 0.07 0.00 10 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 E1b_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 E1b_E2b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 ER1d ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.25 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.66 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.16 2.61 14 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.97 0.00 0.00 0.00 0.00 2.20 4.17 2.94 15 ER2b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.95 0.00 0.55 1.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.74 0.00 0.00 0.00 0.00 1.20 2.33 1.49 16 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 ER3a ExonRegion 0 2.87 0.00 0.44 0.00 0.00 0.88 3.13 0.00 1.13 0.00 0.00 0.00 0.00 1.71 0.49 0.72 0.00 0.00 0.77 0.00 0.53 0.00 0.71 18 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 E3a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.70 0.00 0.01 0.91 0.00 0.00 0.00 1.22 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 E4_Da NovelBoundary 0 267.08 182.86 157.89 140.21 189.90 124.42 230.26 210.34 190.07 170.22 42.27 5.25 37.50 4.53 54.39 159.79 94.90 233.55 119.34 196.80 82.84 80.22 234.92 22 ER5a ExonRegion 0 5.10 0.71 0.00 0.70 0.00 0.87 2.83 0.75 1.08 1.72 0.00 0.00 0.00 0.46 1.46 0.00 0.00 0.00 1.11 0.00 2.01 0.00 2.58 23 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 ER6a ExonRegion 0 2.70 0.00 0.59 2.29 1.98 0.98 3.00 4.75 2.51 5.83 0.80 0.16 0.00 0.14 4.48 1.10 0.00 1.34 5.89 0.00 9.41 0.33 3.36 25 E6a_E7a KnownJunction 0 14.15 0.00 1.18 3.00 0.00 5.79 5.74 4.89 11.00 9.03 0.00 0.00 0.00 2.47 10.75 0.00 0.00 2.11 0.00 0.00 20.26 3.12 10.84 26 E7_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 3.31 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12.99 0.00 0.00 0.00 0.00 27 ER7a ExonRegion 0 6.42 0.84 1.54 9.88 4.08 1.57 8.34 7.05 9.72 9.32 5.30 0.92 0.00 1.87 5.98 3.69 1.82 3.05 17.24 2.05 15.44 5.79 2.98 28 E7_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 6.43 0.00 0.00 1.63 2.26 7.64 1.42 0.00 0.00 0.00 0.00 4.45 0.00 0.00 0.00 4.14 0.00 0.00 3.12 0.00 29 ER7b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 1.36 5.19 1.83 0.16 0.81 2.42 0.49 0.00 0.00 0.00 0.00 1.08 0.00 0.00 0.00 2.37 0.00 2.16 0.86 0.00