Order	SeqName	SeqType	IsAE	NBL01_MYCN	NBL05_MYCN	NBL09_MYCN	NBL10_MYCN	NBL02	NBL03	NBL04	NBL06	NBL07	NBL08	NBL11_Rel2	NBL11_Rem1	NBL11_Rel1	NBL12_Rel_Left	NBL12_Rel_Right	NBL13_Rel_Left	NBL13_Rel_Right	NBL14_MYCN_Met	NBL14_MYCN_Pri	NBL15_MYCN_Rel1	SKP01	SKP02	SKP03
1	GRM3	Gene	0	0.34	2.59	1.73	6.17	1.40	3.82	1.21	1.99	1.36	0.99	1.23	0.21	0.00	0.85	0.37	0.74	1.69	7.21	0.07	2.30	0.08	0.00	0.20
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3	361669	Transcript	0	0.10	4.37	1.13	3.87	0.96	2.37	0.62	1.03	0.77	0.47	1.08	0.04	0.00	0.39	0.07	2.02	0.39	2.88	0.00	2.16	0.05	0.00	0.00
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10	E1_Ac	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
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12	E1a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	E1a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
14	ER1d	ExonRegion	0	0.00	2.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
15	ER1e	ExonRegion	0	0.00	1.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
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17	E1b_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
18	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
19	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
20	ER3a	ExonRegion	0	0.00	1.35	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.37	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00
21	E3_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
22	E3_Db	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.13	0.00	0.00	0.00
23	ER3b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.13	0.00	0.00	0.00
24	ER3c	ExonRegion	0	0.00	2.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.00	0.00	1.23	0.00	0.00	0.00
25	E3c_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.45	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.89	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
26	I3	Intron	0	1.04	3.39	5.04	30.35	3.45	26.02	3.08	4.51	5.87	2.10	0.00	0.49	0.12	1.58	0.43	0.12	0.31	7.27	0.23	4.80	0.05	0.59	0.37
27	I3_SR1	SilentIntronRegion	0	3.68	5.58	9.69	31.58	3.34	33.48	3.30	3.62	6.57	4.13	0.00	0.72	0.00	0.53	0.00	1.94	0.00	4.00	0.00	4.96	0.00	0.41	0.00
28	I3_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.31	6.54	10.86	57.58	6.85	46.12	4.29	6.93	10.91	2.19	0.00	1.02	0.00	1.35	0.27	0.00	0.00	11.20	0.42	5.95	0.00	1.20	0.45
29	I3_SR2	SilentIntronRegion	0	1.94	3.87	13.03	52.08	5.34	39.20	2.85	7.73	5.85	4.65	0.00	0.54	0.00	3.16	0.31	0.00	0.00	9.61	0.97	8.66	0.00	0.81	0.74
30	I3_AR2	ActiveIntronRegion	0	1.38	3.66	4.91	33.95	4.47	28.08	4.21	5.80	6.34	2.31	0.00	0.52	0.00	1.93	0.15	0.00	0.48	6.52	0.00	3.94	0.00	0.00	0.43
31	I3_SR3	SilentIntronRegion	0	0.32	2.33	2.27	18.98	1.98	18.58	2.51	3.22	4.32	1.63	0.00	0.27	0.23	1.42	0.46	0.09	0.44	5.76	0.18	4.31	0.08	0.55	0.33
32	I3_AR3	ActiveIntronRegion	0	1.06	1.97	2.98	27.01	3.33	12.72	2.31	3.29	4.81	1.42	0.00	0.89	0.00	1.62	2.04	0.36	0.00	13.29	0.00	3.31	0.00	0.52	0.00
33	Ix	Intron	0	0.08	0.80	6.35	20.62	0.74	6.30	1.67	2.24	2.33	1.15	0.31	0.28	0.00	0.98	0.24	0.00	0.39	6.65	0.00	2.69	0.00	0.25	0.46
34	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.08	0.80	6.36	20.65	0.74	6.31	1.68	2.24	2.33	1.15	0.31	0.28	0.00	0.98	0.24	0.00	0.39	6.66	0.00	2.69	0.00	0.25	0.46
35	Ix	Intron	0	0.96	0.00	1.65	12.83	0.00	0.00	2.99	3.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.41	1.31	1.34	0.00	16.58	0.00	2.88	0.99	0.00	0.00
36	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.95	0.00	1.68	13.06	0.00	0.00	3.04	3.55	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.46	1.33	1.37	0.00	16.85	0.00	2.93	1.01	0.00	0.00
37	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	8.40	16.22	0.00	26.41	0.00	9.86	0.00	1.67	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	15.42	0.00	6.26	0.00	0.00	0.00
38	ER4a	ExonRegion	0	0.03	0.72	0.91	1.99	0.00	1.14	0.00	0.00	0.45	1.37	1.92	0.51	0.00	0.55	0.64	0.59	2.63	6.72	0.00	2.22	0.00	0.00	0.35
39	E4_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	4.14	16.78	0.00	7.84	0.00	0.00	1.77	3.79	4.47	0.00	0.00	4.59	4.45	4.10	0.00	40.33	0.00	2.81	0.00	0.00	0.00
40	ER4b	ExonRegion	0	0.80	2.84	4.99	17.72	0.96	8.75	0.48	1.85	2.23	2.36	3.85	0.43	0.00	3.01	1.81	2.97	8.34	32.14	0.39	7.66	0.26	0.00	1.06
41	E4_Db	NovelBoundary	0	3.78	0.00	6.80	41.52	0.00	7.95	2.12	4.19	0.00	1.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.21	18.78	0.00	3.07	0.00	0.00	0.00
42	E4b_E5a	KnownJunction	0	0.00	8.68	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.68	0.00	0.00	0.00
43	E4b_E6a	KnownJunction	0	3.26	2.50	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
44	I4_SR2	SilentIntronRegion	0	0.82	3.60	9.64	36.85	2.80	4.09	2.61	4.23	3.63	1.39	0.53	0.11	0.12	1.29	0.26	0.38	0.58	12.45	0.20	4.38	0.14	0.32	0.00
45	I4_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.51	4.27	7.06	25.68	2.58	8.31	1.30	4.35	5.45	2.36	1.04	0.43	0.94	1.50	0.50	0.36	1.42	7.44	0.00	3.45	0.00	0.55	0.00
46	E5_Aa	NovelBoundary	0	0.00	6.18	3.28	17.31	7.47	15.79	2.16	0.00	2.86	1.45	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
47	ER5a	ExonRegion	0	0.40	5.82	4.54	15.04	3.83	8.06	2.47	2.21	3.07	1.88	2.10	0.17	0.00	1.55	0.28	1.08	1.58	11.53	0.00	2.71	0.21	0.00	0.00
48	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.00	2.96	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.21	0.00	0.00	0.00	0.00	7.01	0.00	0.00	0.00	3.26	0.00	0.00	0.00
49	ER6a	ExonRegion	0	0.46	5.46	0.00	2.40	0.06	5.39	1.17	0.76	1.07	0.50	0.65	0.00	0.00	0.33	0.00	1.21	2.98	6.20	0.91	3.43	0.00	0.00	0.00
50	E6a_E7a	KnownJunction	0	0.00	3.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
51	I6_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.76	1.69	3.04	24.70	0.89	7.34	5.52	5.14	4.60	1.99	0.00	1.61	2.21	0.00	0.34	0.00	1.10	2.30	0.00	2.48	0.00	0.00	0.00
52	I6_SR4	SilentIntronRegion	0	0.35	2.52	2.20	11.91	5.33	19.57	5.78	6.56	6.05	2.86	0.18	0.49	0.76	0.42	0.27	0.17	0.67	3.66	0.00	2.76	0.00	0.50	0.00
53	ER7a	ExonRegion	0	0.77	5.12	0.06	4.73	2.90	4.89	2.38	5.74	1.52	0.62	1.70	0.00	0.00	1.45	0.74	3.23	2.13	2.36	0.00	5.31	0.00	0.00	0.00
54	E7_Da	KnownBoundary	0	0.00	3.09	1.12	15.65	0.00	10.85	6.09	13.55	1.53	0.00	7.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.93	4.60	0.00	5.69	0.00	0.00	0.00
55	ER7b	ExonRegion	0	1.19	2.37	0.80	4.69	3.01	5.88	4.48	10.65	2.84	0.96	1.01	0.80	0.00	0.79	0.46	0.00	0.82	3.30	0.00	3.38	0.00	0.00	0.66
56	ER7c	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.45	0.00	1.43	0.00	1.92	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
57	IG20	Intergenic	0	1.31	2.45	2.01	13.61	4.87	16.35	5.14	7.57	5.44	2.76	0.13	2.59	0.48	1.21	0.26	0.41	0.45	2.37	0.22	2.34	0.26	0.86	0.20
58	IG20_SR2	SilentIntergenicRegion	0	1.37	2.77	2.09	15.58	5.72	18.89	6.06	7.84	6.26	2.87	0.17	3.26	0.52	1.37	0.32	0.51	0.57	2.77	0.28	2.21	0.33	0.90	0.25