Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 GTF2IRD2P Gene 0 0.37 2.45 0.43 0.48 0.43 0.64 0.94 0.24 0.61 0.43 0.06 0.28 0.19 0.32 0.50 0.61 0.05 0.76 0.40 0.81 0.49 0.40 0.28 2 449689 Transcript 0 0.42 0.65 0.58 0.52 0.49 0.28 0.55 0.17 0.55 0.18 0.00 0.00 0.00 0.00 0.09 0.33 0.00 0.29 0.41 0.65 0.51 0.15 0.00 3 425256 Transcript 0 0.18 0.82 0.03 0.37 0.03 0.29 0.74 0.29 0.29 0.36 0.01 0.03 0.02 0.03 0.04 0.05 0.00 0.34 0.02 0.20 0.18 0.03 0.02 4 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.77 0.00 0.00 0.00 5 E1_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 1.53 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12.21 5.55 0.00 0.00 0.00 0.00 3.65 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 E1a_E2b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 3.82 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 E2_Ab NovelBoundary 0 0.00 21.25 27.02 44.58 27.33 18.91 2.08 26.49 10.50 8.22 2.11 0.00 6.17 5.06 5.93 8.03 4.77 6.72 23.25 5.37 3.03 3.06 0.00 8 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9 ER2b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.89 0.00 0.00 0.02 0.03 0.05 0.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 0.84 0.49 0.00 0.00 10 E2a_E3b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.97 0.00 0.00 11 E2b_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 ER2c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 2.73 0.00 0.00 1.32 1.73 1.24 2.29 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.85 0.00 2.13 0.00 0.00 0.00 13 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 2.73 0.00 0.00 1.32 1.73 1.24 2.29 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.85 0.00 2.13 1.10 0.00 0.00 14 ER3b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.51 0.00 0.46 0.33 0.66 1.42 0.86 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.23 0.00 0.01 0.29 0.00 0.00 15 E3a_E4b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 E3b_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 ER3c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.83 0.00 0.00 1.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 E4_Aa NovelBoundary 0 30.60 12.50 8.66 21.94 16.64 9.99 7.86 13.97 15.83 13.91 0.00 12.60 14.45 12.01 14.09 35.29 0.00 25.08 17.88 14.76 0.00 2.82 15.54 19 E4a_E5b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.83 0.00 0.00 1.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 E4_Db NovelBoundary 0 24.82 11.84 29.09 51.74 3.90 2.56 1.81 16.88 25.09 25.12 2.68 0.00 0.00 16.36 14.96 20.59 8.04 31.63 42.82 29.47 10.32 8.45 8.54 22 E4b_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 2.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 ER4b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.07 0.00 0.00 0.18 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 ER4c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 E5_Aa NovelBoundary 0 60.23 78.87 8.22 10.65 47.88 26.97 31.97 16.47 14.90 6.39 2.47 0.00 0.00 7.77 0.00 18.54 0.00 8.91 4.80 2.75 0.00 6.06 0.00 26 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27 ER5b ExonRegion 0 0.00 0.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.08 0.00 0.00 28 E5_Da NovelBoundary 0 10.74 53.87 26.70 40.39 24.53 12.89 1.94 31.96 12.33 13.40 0.00 13.65 20.45 0.00 15.20 0.00 0.00 20.23 4.24 15.08 11.80 8.45 15.11 29 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 30 E5b_E6b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 31 ER5c ExonRegion 0 0.00 2.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 32 E6_Aa NovelBoundary 0 91.72 69.07 31.96 39.46 66.04 34.13 30.60 28.34 24.48 6.88 7.95 0.00 0.00 2.47 8.90 4.02 4.21 47.09 39.53 33.75 8.34 3.06 12.38 33 ER6a ExonRegion 0 1.23 1.19 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.72 0.00 2.16 0.00 1.60 6.24 1.56 0.00 34 ER6b ExonRegion 0 2.12 3.88 0.00 0.73 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.94 0.00 3.70 0.00 4.26 8.51 2.04 0.00 35 E6a_E7b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 36 E6_Db NovelBoundary 0 30.45 45.78 47.72 30.80 67.06 34.58 37.54 29.08 18.00 11.36 26.80 0.00 0.00 7.42 11.62 38.11 8.60 31.13 22.02 20.13 19.95 13.66 19.46 37 E6b_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 38 ER6c ExonRegion 0 1.06 2.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.94 0.00 1.85 0.00 4.26 2.20 0.00 0.00 39 ER7a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.68 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.49 0.00 0.00 0.00 2.13 0.00 0.00 0.00 40 ER7b ExonRegion 0 0.00 1.16 1.11 3.35 0.00 0.00 0.00 1.57 0.00 2.20 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.22 1.40 0.00 0.00 41 E7a_E8b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 42 E7b_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 43 ER7c ExonRegion 0 0.00 2.03 1.23 2.45 0.54 0.00 0.00 1.73 0.00 0.92 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.13 0.88 0.00 0.00 44 E8_Aa NovelBoundary 0 9.56 26.11 1.83 7.46 7.47 0.00 7.73 5.71 3.82 1.18 0.00 0.00 6.82 0.00 0.00 0.00 0.00 4.15 0.00 6.39 2.84 6.18 0.00 45 ER8a ExonRegion 0 0.00 4.58 0.15 0.85 2.68 0.00 0.00 0.22 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.15 0.00 0.80 0.00 0.00 0.00 46 ER8b ExonRegion 0 0.00 3.22 0.00 0.00 2.04 0.00 0.39 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.55 0.00 0.00 0.04 0.00 0.00 47 E8_Da NovelBoundary 0 3.33 20.06 18.33 10.42 75.55 2.56 10.47 5.87 9.72 6.21 0.00 0.00 0.00 2.30 0.00 0.00 0.00 3.86 3.76 11.51 0.00 0.00 3.76 48 E8a_E9a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 49 E8b_E9b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 50 ER8c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.32 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 51 E9_Aa NovelBoundary 0 3.78 5.46 11.97 6.36 20.12 5.05 20.71 8.21 5.41 8.68 0.00 0.00 7.95 0.00 0.00 3.25 0.00 4.52 0.00 0.00 0.00 0.00 3.16 52 ER9a ExonRegion 0 0.00 2.03 3.68 0.00 0.00 0.00 0.26 0.00 2.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.37 0.00 4.41 0.00 0.00 53 ER9b ExonRegion 0 0.00 7.54 3.68 0.00 3.95 0.00 1.65 0.00 3.38 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.52 0.00 0.00 0.00 4.61 2.91 3.09 0.00 0.00 54 E9a_E10b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 55 E9_Db NovelBoundary 0 15.04 23.02 26.76 23.31 31.07 0.00 12.28 24.89 6.83 5.61 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.59 0.00 8.75 0.00 28.83 0.00 0.00 3.93 56 E9b_E10a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 57 ER9c ExonRegion 0 0.00 8.13 3.68 0.00 5.35 0.00 1.32 0.00 2.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.90 0.00 0.00 0.00 3.19 2.13 0.00 0.00 0.00 58 E10_Aa NovelBoundary 0 5.78 17.30 1.51 30.20 38.79 5.00 15.59 11.62 7.87 3.01 0.00 0.00 6.82 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.24 3.26 0.00 2.69 3.50 59 ER10a ExonRegion 0 0.00 0.00 3.68 0.00 2.68 0.00 0.66 0.00 3.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.19 2.13 0.00 0.00 0.00 60 ER10b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.80 0.25 1.48 0.00 0.00 61 E10_Da NovelBoundary 0 0.00 27.30 16.03 21.78 59.25 16.75 33.48 10.47 12.82 8.97 0.00 0.00 6.01 2.41 8.90 4.36 0.00 5.47 3.95 5.05 0.00 7.47 0.00 62 E10a_E11a KnownJunction 0 10.59 0.00 5.50 4.53 0.00 4.94 12.14 0.00 2.78 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.06 0.00 63 E10b_E11b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 64 ER10c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 65 E11_Aa NovelBoundary 0 6.89 15.72 26.49 29.40 78.10 9.54 17.71 10.88 4.72 11.98 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.58 0.00 5.43 0.00 2.51 7.26 66 ER11a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.10 0.00 0.00 67 ER11b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.33 0.00 0.00 68 E11a_E12a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 69 E11_Db NovelBoundary 0 9.48 14.87 13.42 19.08 19.61 0.00 0.00 7.31 11.81 13.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.59 0.00 8.00 0.00 0.00 0.00 2.51 0.00 70 E11b_E12b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 71 ER11c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 72 ER12a ExonRegion 0 0.00 1.12 0.00 0.00 0.00 1.94 1.06 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 73 E12_Ab KnownBoundary 0 3.41 6.31 9.85 17.01 3.82 2.61 10.11 16.63 7.64 15.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.58 17.66 4.71 9.08 0.00 2.69 0.00 74 ER12b ExonRegion 0 0.00 0.04 0.00 0.00 0.00 0.16 0.44 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 75 E12a_E13b KnownJunction 0 2.74 8.16 0.00 6.09 0.00 2.38 9.67 4.93 3.30 5.96 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.10 0.00 2.75 0.00 0.00 0.00 76 E12_Db NovelBoundary 0 2.82 8.88 27.17 22.24 16.04 5.68 1.72 19.92 18.92 10.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.67 0.00 44.77 29.74 8.44 2.53 0.00 0.00 77 E12b_E13a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 78 ER12c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 79 E13_Aa NovelBoundary 0 21.34 9.80 21.17 15.42 21.39 5.79 8.35 17.54 9.40 5.83 2.63 0.00 6.82 0.00 0.00 0.00 0.00 15.67 12.42 8.88 0.00 2.76 4.35 80 ER13a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 81 E13_Da NovelBoundary 0 31.41 69.40 82.08 124.03 176.23 95.00 98.22 76.40 67.94 70.97 5.16 5.40 7.79 16.89 5.19 31.62 4.39 63.01 63.53 60.02 20.26 14.08 32.18 82 E13a_E14a NovelJunction 0 0.00 38.94 3.34 17.35 4.07 42.02 37.19 2.26 14.93 7.20 0.00 0.00 8.12 0.00 0.00 4.27 0.00 14.01 9.41 3.20 0.00 0.00 4.27 83 ER13b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.73 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 84 ER13c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 85 ER14a ExonRegion 0 0.54 3.37 0.51 0.52 0.48 0.89 1.35 0.26 0.65 0.52 0.10 0.45 0.30 0.51 0.74 0.83 0.08 0.96 0.41 0.92 0.22 0.58 0.45