Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 AC018648.4 Gene 0 0.34 2.18 1.57 1.31 5.17 3.74 1.85 2.63 1.28 3.67 1.25 0.77 1.33 0.57 0.44 0.64 0.00 2.12 3.08 2.86 0.35 1.68 1.26 2 426647 Transcript 0 2.96 0.00 1.50 0.51 3.37 3.27 3.07 2.26 1.53 1.39 3.46 3.95 3.78 4.86 1.65 5.66 7.60 0.00 1.29 4.46 5.11 9.88 8.08 3 439061 Transcript 0 1.16 2.10 2.75 1.22 4.10 8.97 5.77 4.98 10.39 4.01 5.88 2.40 0.00 2.04 1.98 2.65 16.21 4.76 2.98 4.80 11.22 19.43 9.42 4 ER1a ExonRegion 0 0.17 5.08 4.65 0.67 9.00 8.99 1.82 8.76 2.79 4.50 1.27 0.00 0.00 1.24 0.00 0.00 0.00 0.00 8.90 2.29 0.00 3.82 1.47 5 E1a_E2a KnownJunction 0 2.89 0.00 6.21 1.90 4.33 2.16 4.50 13.84 0.00 2.50 2.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18.26 0.00 0.00 3.12 0.00 6 ER2a ExonRegion 0 1.26 1.44 2.47 0.49 15.09 9.35 3.05 9.84 6.36 7.53 2.31 2.53 2.74 0.00 0.00 0.00 0.00 2.67 8.10 7.15 0.06 3.62 2.08 7 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 6.31 0.00 0.00 2.07 3.90 4.29 0.00 0.00 0.38 0.00 0.00 0.00 0.00 0.85 9.17 0.21 2.16 6.13 2.82 9 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 1.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.49 2.11 0.46 0.00 4.69 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.78 0.51 0.00 0.00 0.35 12 ER5a ExonRegion 0 0.00 1.19 1.06 0.86 3.46 4.68 0.00 2.19 0.69 3.54 1.34 1.52 4.46 0.00 0.00 0.02 0.00 1.96 0.98 0.80 0.00 0.92 0.00 13 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 ER6a ExonRegion 0 0.63 5.20 3.59 4.06 9.46 6.52 5.87 1.53 0.55 7.91 3.58 2.11 0.00 0.00 2.36 2.63 0.00 2.62 4.72 4.42 0.00 0.62 2.61 15 E6a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 ER7a ExonRegion 0 1.07 4.11 0.00 2.05 1.40 0.00 1.93 0.00 0.65 1.70 0.92 0.00 1.95 1.80 0.11 0.00 0.00 10.17 0.00 3.88 0.72 1.05 2.97 17 E7a_E8a KnownJunction 0 8.89 0.00 2.39 0.00 3.65 4.32 8.74 3.33 4.60 0.00 10.37 11.85 6.66 11.54 4.94 14.01 22.81 0.00 3.86 2.62 15.32 25.11 24.24 18 E7_Db NovelBoundary 0 3.33 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.67 4.76 6.13 3.25 2.47 5.40 6.33 10.24 4.45 0.00 12.90 4.64 22.02 5.88 6.12 8.39 0.00 19 E7b_E8b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 ER7b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.79 0.00 1.01 0.00 0.21 0.00 0.00 0.46 0.00 0.00 0.00 2.38 0.00 5.32 1.42 0.00 0.00 21 E8_Ab NovelBoundary 0 12.59 2.83 8.99 4.40 14.43 41.45 42.57 17.83 21.64 7.20 34.01 42.16 47.07 53.33 27.07 39.56 76.11 5.14 8.66 5.43 27.92 74.77 71.79 22 ER8a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.86 0.16 1.10 0.00 0.47 0.00 0.00 0.74 0.00 0.00 0.00 1.43 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.13 0.00 2.45 0.00 23 ER8b ExonRegion 0 0.00 0.00 1.23 1.36 3.91 1.80 1.15 1.43 0.00 2.62 0.00 0.00 1.08 3.50 0.00 2.06 0.00 0.00 0.00 7.32 0.00 4.37 0.00 24 E8_Da KnownBoundary 0 3.56 0.00 11.12 5.69 4.33 0.00 2.16 2.42 26.36 7.52 12.85 0.00 0.00 2.30 12.11 8.03 4.58 11.65 0.00 5.88 2.97 17.70 0.00 25 E8a_E8c KnownJunction 0 3.48 6.31 8.25 3.66 12.31 26.92 14.53 14.95 30.15 12.03 17.43 7.20 0.00 5.65 5.93 7.95 48.62 11.90 8.94 9.08 32.25 58.29 28.26 26 E8_Ac KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.35 0.00 4.39 0.00 1.48 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27 ER8c ExonRegion 0 0.00 0.00 1.23 1.36 5.35 5.50 0.00 3.46 0.00 3.44 0.00 0.00 4.69 1.62 0.00 2.97 0.00 0.00 0.00 10.64 0.00 2.08 0.00 28 ER8d ExonRegion 0 0.00 0.00 0.24 0.52 3.40 3.39 0.00 3.32 0.00 2.03 0.00 0.00 2.53 0.19 0.00 0.74 0.00 0.00 0.00 2.70 0.00 0.88 0.00 29 E8_Db NovelBoundary 0 0.00 0.00 1.54 0.00 3.65 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.01 0.00 0.00 0.00 30 E8b_E9a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 31 ER9a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.72 0.00 0.00