Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 AC005027.2 Gene 0 1.75 2.51 0.41 0.57 1.59 0.66 1.82 0.49 0.71 0.19 0.24 1.76 1.80 0.94 2.77 1.54 1.37 5.60 2.22 4.23 1.00 2.69 3.04 2 415848 Transcript 0 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.03 0.00 4.38 1.95 3 422822 Transcript 0 0.00 0.12 0.00 0.00 0.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.63 1.30 4.38 0.00 0.24 0.34 4 420821 Transcript 0 0.00 4.08 0.00 0.00 0.16 0.00 0.00 0.00 0.43 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 2.74 0.19 1.25 0.00 0.30 0.00 5 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21.88 9.74 6 E1_Ac KnownBoundary 0 0.00 2.43 3.08 0.00 0.00 0.00 0.00 2.51 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.81 0.00 2.49 0.00 94.30 47.21 7 ER1b ExonRegion 0 0.00 0.18 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.31 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.02 0.29 2.51 0.00 43.56 21.36 8 ER1c ExonRegion 0 0.00 1.47 0.67 0.00 0.00 0.67 0.00 2.81 0.67 0.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17.09 4.48 7.57 0.00 59.07 27.81 9 E1_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.25 3.94 0.00 1.56 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.61 0.00 2.75 2.72 75.38 39.78 10 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.84 3.48 0.00 0.00 0.00 0.00 11 Ix Intron 0 0.17 0.00 0.66 0.02 0.19 0.16 0.23 0.34 0.32 0.27 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 0.00 0.38 2.55 0.08 0.60 1.74 48.68 34.83 12 Ix_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.58 0.00 0.00 0.25 0.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.18 0.00 0.00 0.00 1.39 0.44 1.46 1.45 81.32 33.47 13 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 0.10 0.00 0.48 0.00 0.00 0.13 0.27 0.38 0.15 0.57 0.00 0.00 0.00 0.03 0.00 0.00 0.16 3.46 0.16 0.52 1.78 52.49 39.46 14 Ix_AR2 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.24 1.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.39 0.00 0.00 2.20 55.21 39.64 15 Ix_SR2 SilentIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.24 1.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.39 0.00 0.00 8.26 49.48 40.75 16 Ix_AR3 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.24 0.64 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.57 6.36 0.00 0.00 8.81 52.09 48.94 17 Ix_SR3 SilentIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.03 4.31 0.00 0.00 8.81 43.29 42.74 18 Ix_AR4 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.62 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.60 3.70 0.00 0.00 8.81 34.90 39.64 19 Ix_AR5 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.90 1.85 0.00 0.00 0.63 28.28 28.53 20 Ix_AR6 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.15 0.77 0.00 0.00 3.31 26.04 24.47 21 Ix_AR7 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 1.33 0.00 0.49 0.00 0.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.88 4.96 0.00 0.00 4.56 57.10 43.80 22 Ix_AR8 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 2.04 0.00 1.00 0.00 0.25 0.96 0.00 0.32 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.87 1.69 0.00 0.00 1.04 69.13 33.63 23 Ix_SR4 SilentIntronRegion 0 0.11 0.00 0.53 0.06 0.00 0.00 0.22 0.56 0.80 0.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.12 0.00 0.58 1.23 53.95 28.51 24 Ix_AR9 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.80 0.17 0.00 0.00 0.22 0.43 0.00 0.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.34 0.99 0.00 1.78 2.95 47.25 32.38 25 Ix_SR5 SilentIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.30 0.00 0.00 0.00 0.00 14.35 22.51 26 Ix_AR10 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.27 3.03 0.00 0.83 0.08 33.43 21.60 27 Ix_SR6 SilentIntronRegion 0 0.49 0.00 0.71 0.00 0.52 0.43 0.15 0.20 0.57 0.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.29 1.62 0.00 0.49 1.27 26.20 32.63 28 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.86 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.51 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23.34 4.49 9.18 0.00 1.23 0.00 29 E2_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.40 0.00 5.05 0.00 0.00 0.00 30 E2a_E2b KnownJunction 0 0.00 5.66 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.19 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 31 E2_Db KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 32 E2b_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 33 ER2b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.85 0.00 4.26 0.00 0.00 0.00 34 ER2c ExonRegion 0 0.00 0.12 0.00 0.00 0.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.63 1.30 4.38 0.00 0.24 0.34 35 E2_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.56 0.00 5.56 0.00 0.00 0.00 36 ER2d ExonRegion 0 8.49 10.99 1.96 2.84 7.61 3.16 8.89 2.04 3.01 0.88 1.17 8.72 8.89 4.63 13.71 7.63 6.75 14.12 8.46 13.65 4.94 4.23 10.82 37 E2_Dc KnownBoundary 0 0.00 3.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.12 0.00 38 ER2e ExonRegion 0 0.00 2.51 0.00 0.00 0.31 0.00 0.00 0.00 0.86 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.04 1.29 0.37 2.51 0.00 0.59 0.00 39 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.06 0.00 0.00 0.00 40 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41 ER4a ExonRegion 0 0.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.09 0.00 0.00 0.00