Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 AC004840.3 Gene 0 0.54 0.91 1.40 1.04 1.54 0.24 0.42 0.33 0.83 0.88 0.12 0.74 0.74 0.42 1.31 0.76 0.85 1.36 0.61 1.91 0.14 0.53 0.94 2 412984 Transcript 0 0.20 0.38 0.21 0.30 0.00 0.00 0.37 0.00 0.31 0.00 0.00 0.33 1.01 0.13 0.20 0.07 0.00 0.00 0.09 0.28 0.00 0.19 0.55 3 443103 Transcript 0 0.47 0.73 1.70 1.12 2.56 0.42 0.00 0.62 0.48 1.27 0.23 0.85 0.00 0.62 0.73 0.35 1.18 2.09 0.76 2.71 0.00 0.50 0.35 4 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 E1_Da NovelBoundary 0 23.26 18.68 96.03 41.09 3.90 8.01 12.81 20.33 15.31 28.98 36.06 0.00 13.15 17.72 21.51 24.87 23.09 41.25 39.15 25.38 19.65 10.35 6.83 6 E1a_E2b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 I1_AR3 ActiveIntronRegion 0 2.85 1.47 3.38 4.09 23.71 0.44 5.30 0.48 1.24 2.18 0.73 0.00 0.00 1.29 3.70 0.82 6.72 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.05 8 ER2a ExonRegion 0 0.47 0.73 1.70 1.12 2.56 0.42 0.00 0.62 0.48 1.27 0.23 0.85 0.00 0.62 0.73 0.35 1.18 2.09 0.76 2.71 0.00 0.50 0.35 9 E2_Ab KnownBoundary 0 2.89 0.00 3.61 2.06 0.00 0.00 0.00 0.00 1.27 1.29 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.59 0.00 3.13 0.00 0.00 0.00 10 ER2b ExonRegion 0 0.39 1.66 1.63 1.16 0.00 0.06 0.70 0.00 1.38 0.74 0.00 0.00 0.00 0.00 3.34 0.90 1.35 1.49 0.00 1.16 0.90 0.85 2.40 11 E2a_E3a KnownJunction 0 3.48 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.90 0.00 0.00 1.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 ER3a ExonRegion 0 1.32 0.00 1.31 0.78 2.44 0.00 0.85 0.00 1.94 1.09 0.00 0.77 1.42 0.00 3.68 5.47 0.00 0.00 2.05 1.18 0.00 0.00 0.00 13 E3_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 2.63 2.06 0.00 0.00 0.00 0.00 3.21 0.00 0.00 6.15 6.82 0.00 8.90 3.67 0.00 0.00 4.24 3.26 0.00 0.00 0.00 14 ER3b ExonRegion 0 0.99 1.90 1.03 1.50 0.00 0.00 1.86 0.00 1.56 0.00 0.00 1.63 4.52 0.63 0.98 0.33 0.00 0.00 0.44 1.39 0.00 0.97 2.75 15 E3_Db NovelBoundary 0 3.78 0.00 1.83 1.66 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 0.00 0.00 4.45 0.00 14.31 2.03 0.00 2.94 2.78 0.00 0.00 16 E3b_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.52 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00