Order	SeqName	SeqType	IsAE	NBL01_MYCN	NBL05_MYCN	NBL09_MYCN	NBL10_MYCN	NBL02	NBL03	NBL04	NBL06	NBL07	NBL08	NBL11_Rel2	NBL11_Rem1	NBL11_Rel1	NBL12_Rel_Left	NBL12_Rel_Right	NBL13_Rel_Left	NBL13_Rel_Right	NBL14_MYCN_Met	NBL14_MYCN_Pri	NBL15_MYCN_Rel1	SKP01	SKP02	SKP03
1	AC004538.1	Gene	0	0.36	2.89	0.63	2.15	1.92	2.89	7.23	1.81	1.18	0.69	0.33	4.17	0.06	0.21	0.06	0.37	1.24	1.99	1.04	2.59	0.65	14.65	10.58
2	443459	Transcript	0	0.00	0.00	1.37	0.00	0.00	0.00	1.16	0.00	0.54	0.50	2.27	0.00	0.00	0.39	0.00	0.00	0.00	0.56	0.00	1.25	2.39	8.33	16.35
3	428967	Transcript	0	0.00	0.98	1.38	1.29	0.00	3.72	0.66	0.82	0.75	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.98	2.24	0.00	15.88	24.42
4	441110	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.48	0.00	2.33	3.31
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7	421121	Transcript	0	0.60	5.10	0.59	3.78	4.22	5.12	12.06	3.31	1.64	1.04	0.08	7.96	0.00	0.11	0.00	0.24	0.94	2.55	1.73	2.99	0.00	17.57	7.97
8	ER1a	ExonRegion	0	0.00	3.71	0.00	0.00	0.00	1.64	0.00	0.00	0.00	0.70	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.39	0.00	0.00	1.43	2.81	0.10
9	E1a_E2b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.67	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.40	0.00	0.00	2.78	5.33	0.00
10	ER2a	ExonRegion	0	0.00	2.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.92	0.00	0.00	0.55	1.04	1.47
11	ER2b	ExonRegion	0	1.61	2.22	0.69	0.00	0.00	2.50	1.51	0.98	1.09	1.75	0.74	0.00	1.47	1.13	1.56	0.00	0.00	7.42	1.21	2.43	3.90	10.45	24.81
12	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	3.37	1.76	0.00	0.00	4.42	9.36	0.00	7.90	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	18.65	0.00	12.02	2.59	3.00	0.00
13	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.88	4.35
14	E2a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.90	0.00	0.00	3.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	10.47	19.12
15	E2a_E9a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.68	0.00	0.00
16	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	11.04	15.31
17	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.26	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	17.27	15.79
18	ER4a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.29	0.00	0.00	0.67	0.00	0.00	0.00	0.13	0.71	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.32	0.00	0.00	1.05	8.24	15.49
19	E4_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	2.81	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.02	0.00	0.00	5.68	8.88	15.28
20	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.10
21	ER4b	ExonRegion	0	0.00	0.00	1.37	0.00	0.00	0.00	1.16	0.00	0.54	0.50	2.27	0.00	0.00	0.39	0.00	0.00	0.00	0.56	0.00	1.25	2.39	8.33	16.35
22	E4_Db	NovelBoundary	0	0.00	0.00	2.66	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.79	1.56	0.00	11.70	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.78	5.76	11.69
23	I4_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.88	0.71	0.00	1.21	0.59	0.23	0.83	0.24	0.22	0.63	0.69	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.35	0.00	0.55	0.57	11.52	16.82
24	I4_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.33	0.69	0.00	0.32	0.63	0.29	1.59	0.81	0.29	0.94	1.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.50	0.17	0.35	5.66	10.95
25	ER5a	ExonRegion	0	0.00	0.72	0.89	1.92	0.61	1.64	1.07	1.35	1.46	0.39	0.89	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.88	0.00	20.10	30.08
26	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.00	3.29	4.55	4.03	0.00	10.28	2.25	2.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.20	0.00	37.96	50.19
27	E5a_E8a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
28	ER6a	ExonRegion	0	0.00	0.64	0.97	1.12	0.00	1.72	0.40	1.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.91	2.77	0.00	9.44	24.87
29	E6a_E9a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.63	3.50
30	ER7a	ExonRegion	0	0.60	0.00	0.76	0.99	0.00	0.00	0.33	0.00	0.70	0.00	0.00	1.65	0.00	0.51	0.00	1.13	4.78	0.00	0.00	0.00	0.00	1.59	4.30
31	E7_Ab	KnownBoundary	0	3.33	0.00	0.00	1.70	0.00	0.00	2.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	8.51	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
32	ER7b	ExonRegion	0	1.21	0.93	0.75	0.67	0.00	1.67	1.39	0.00	0.00	0.00	0.88	0.00	0.00	0.61	0.00	3.93	9.31	0.00	0.00	0.97	0.00	1.93	1.55
33	E7a_E9a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
34	ER8a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.43	0.00	6.99	5.83
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36	I8_SR4	SilentIntronRegion	0	0.36	6.42	0.40	1.18	6.88	24.05	4.42	5.36	4.64	1.62	0.06	0.99	0.06	0.00	0.00	0.00	0.08	5.60	2.40	4.60	0.11	1.41	1.15
37	I8_AR4	ActiveIntronRegion	0	22.35	228.42	30.17	58.92	204.16	416.43	193.11	117.53	56.09	52.83	0.13	1.43	0.00	0.15	0.00	0.00	0.18	86.24	65.03	59.32	1.22	31.47	5.13
38	ER9a	ExonRegion	0	0.00	3.25	2.39	0.89	1.61	0.00	4.52	0.00	1.42	0.00	0.92	4.38	0.00	1.50	0.00	2.08	3.63	1.78	0.00	4.10	3.03	21.96	17.66
39	E9b_E10a	KnownJunction	0	0.00	3.29	3.43	1.83	0.00	0.00	2.12	0.00	1.65	0.00	2.16	13.95	0.00	2.24	0.00	0.00	3.93	0.00	0.00	0.00	3.15	20.15	28.43
40	ER9b	ExonRegion	0	0.00	2.03	2.45	2.73	2.68	0.00	3.97	0.00	2.47	0.00	1.93	8.66	0.00	1.62	0.00	0.00	3.30	1.85	0.00	2.13	8.81	18.75	22.51
41	ER10a	ExonRegion	0	0.00	2.20	0.72	3.35	1.22	1.67	11.23	1.17	2.46	0.00	0.17	5.10	0.00	0.10	0.00	1.35	0.53	8.48	1.45	7.35	4.03	19.16	12.90
42	E10_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	4.66	0.00	0.00	7.99	0.00	3.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.55	5.14	0.00	8.69	2.84	15.12	4.01
43	E10a_E11a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
44	ER10b	ExonRegion	0	0.00	3.28	0.37	1.96	0.80	2.39	10.18	2.12	1.25	0.84	0.00	4.79	0.00	0.13	0.00	0.00	1.61	1.68	0.84	4.18	0.48	21.44	5.19
45	E10_Db	KnownBoundary	0	0.00	5.33	0.00	2.86	0.00	0.00	8.61	1.93	0.00	2.58	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.35	4.80	2.75	0.00	8.63	0.00
46	ER10c	ExonRegion	0	0.60	5.10	0.59	3.78	4.22	5.12	12.06	3.31	1.64	1.04	0.08	7.96	0.00	0.11	0.00	0.24	0.94	2.55	1.73	2.99	0.00	17.57	7.97
47	E10_Dc	NovelBoundary	0	0.00	11.64	3.90	6.03	7.47	4.77	44.12	2.55	2.84	1.29	0.00	7.65	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.73	0.00	0.00	0.00	20.33	7.68
48	Ix	Intron	0	1.28	11.14	1.30	4.16	10.55	7.15	17.49	5.59	2.88	1.40	0.12	2.25	0.00	0.12	0.00	0.09	0.75	11.02	9.95	11.01	0.87	10.62	4.94
49	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.12	8.06	1.21	4.29	9.07	7.47	18.51	5.33	3.32	1.24	0.09	2.52	0.00	0.14	0.00	0.13	0.58	12.93	9.68	11.43	0.97	10.59	4.91
50	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.87	21.79	1.13	4.42	15.70	5.56	15.94	6.84	2.13	2.09	0.26	1.67	0.00	0.00	0.00	0.00	1.47	4.32	9.33	10.57	0.30	9.72	2.81
51	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	1.11	8.28	2.50	2.47	9.18	8.75	13.59	4.45	1.28	0.89	0.00	1.57	0.00	0.23	0.00	0.00	0.26	13.12	13.83	8.88	1.53	13.19	10.70
52	Ix	Intron	0	0.25	2.62	0.00	1.43	1.25	0.43	3.10	0.30	0.00	0.00	0.00	3.94	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	2.48	1.87	0.50	0.00	7.82	8.95
53	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.25	2.65	0.00	1.44	1.27	0.43	3.13	0.30	0.00	0.00	0.00	3.98	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	2.50	1.88	0.50	0.00	7.88	9.03
54	Ix	Intron	0	1.55	3.73	0.67	0.00	0.00	0.67	5.34	0.95	0.68	0.00	0.00	1.31	0.00	0.00	0.00	1.09	0.00	4.39	1.17	2.34	0.81	8.41	3.23
55	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.58	3.79	0.68	0.00	0.00	0.68	5.42	0.96	0.69	0.00	0.00	1.33	0.00	0.00	0.00	1.11	0.00	4.45	1.19	2.38	0.82	8.53	3.28
56	Ix	Intron	0	0.92	2.74	0.71	2.30	2.09	3.31	7.17	3.14	1.04	0.86	0.25	2.46	0.00	0.15	0.00	0.06	0.29	2.24	2.63	3.10	0.67	7.48	5.56
57	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.92	2.74	0.72	2.30	2.10	3.31	7.18	3.14	1.04	0.86	0.25	2.47	0.00	0.15	0.00	0.06	0.29	2.24	2.63	3.10	0.67	7.48	5.56
58	Ix	Intron	0	0.64	1.99	0.41	2.76	2.22	4.01	8.89	2.14	1.11	0.39	0.00	5.23	0.00	0.20	0.00	0.00	1.74	2.98	1.44	2.25	0.83	13.05	6.65
59	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.64	2.00	0.41	2.77	2.23	4.02	8.91	2.14	1.11	0.39	0.00	5.24	0.00	0.20	0.00	0.00	1.75	2.99	1.45	2.25	0.83	13.09	6.67
60	ER11a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.84	1.10	3.02	5.99	0.00	0.76	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.31	0.00	0.00	0.00	0.00