Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 AL035530.2 Gene 0 1.52 2.52 0.35 2.42 1.02 3.06 0.57 1.11 5.80 2.86 0.18 0.00 0.18 0.05 0.00 0.28 0.32 0.26 0.61 0.00 0.42 0.20 0.28 2 499555 Transcript 0 0.52 0.87 0.12 0.84 0.35 2.10 0.20 0.38 2.41 1.47 0.06 0.00 0.06 0.51 0.00 0.10 0.11 0.09 0.21 0.00 0.15 0.07 0.10 3 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.45 0.00 0.00 0.00 1.54 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 E1_Da NovelBoundary 0 37.49 9.08 9.20 13.02 7.72 2.21 0.00 14.79 37.15 7.95 2.68 0.00 0.00 2.35 0.00 0.00 8.51 1.70 0.00 2.75 0.00 2.45 0.00 5 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.12 0.00 0.00 1.22 1.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 Ix Intron 0 11.13 6.48 1.89 7.82 7.20 9.72 3.51 7.25 22.32 6.44 1.76 4.41 1.67 2.25 1.80 2.71 7.11 0.69 2.77 2.91 0.73 1.12 0.49 7 Ix_AR1 ActiveIntronRegion 0 16.69 12.87 2.33 9.62 6.85 12.25 4.18 6.37 29.99 4.75 2.95 3.40 0.00 2.88 2.23 5.00 9.63 1.05 2.08 4.37 0.91 0.58 0.41 8 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 10.31 5.78 2.66 4.27 6.74 7.48 1.74 5.46 15.40 6.43 1.06 4.90 3.30 1.42 0.56 2.00 4.44 0.79 1.88 2.38 1.21 1.43 0.81 9 Ix_AR2 ActiveIntronRegion 0 9.30 1.92 0.96 9.92 9.52 10.26 4.66 11.25 26.85 8.81 1.57 6.58 1.47 2.08 3.34 1.28 7.04 0.08 2.75 2.73 0.00 1.84 0.48 10 Ix_SR2 SilentIntronRegion 0 4.18 2.40 0.96 9.80 7.52 8.88 5.02 6.73 17.40 6.46 1.70 2.64 3.22 1.91 0.58 2.53 8.73 0.19 3.63 1.13 0.98 0.54 0.00 11 Ix Intron 0 6.70 3.54 1.74 6.43 5.09 8.13 3.36 4.49 16.03 4.06 0.00 2.26 2.10 1.06 0.00 0.94 0.52 1.02 1.51 1.01 0.00 0.99 0.00 12 Ix_AR1 ActiveIntronRegion 0 6.75 3.57 1.75 6.47 5.12 8.17 3.38 4.52 16.13 4.09 0.00 2.27 2.11 1.07 0.00 0.95 0.53 1.03 1.52 1.02 0.00 1.00 0.00 13 Ix_AR1 ActiveIntronRegion 0 2.12 3.56 0.00 6.81 3.34 3.67 0.00 5.19 14.20 10.04 3.87 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.23 0.00 1.86 0.00 0.00 0.00 14 Ix_AR2 ActiveIntronRegion 0 5.99 4.34 0.00 3.53 5.62 16.22 0.90 4.01 10.74 6.65 1.54 3.08 0.00 0.00 3.39 0.00 2.01 1.47 0.00 0.58 0.00 0.00 0.00 15 Ix_AR4 ActiveIntronRegion 0 2.02 1.94 2.18 4.67 6.38 20.34 0.32 2.46 9.56 9.31 0.00 4.43 0.92 1.59 1.18 0.00 0.79 1.31 0.76 1.37 0.53 0.00 0.00 16 ER2a ExonRegion 0 1.57 2.62 0.36 2.51 1.06 3.18 0.59 1.15 6.01 2.95 0.19 0.00 0.19 0.00 0.00 0.29 0.33 0.27 0.63 0.00 0.44 0.21 0.29