Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 C6orf176 Gene 0 0.00 0.33 0.00 0.09 0.06 0.00 0.36 0.00 0.93 0.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.13 8.83 2.05 0.20 90.50 83.03 2 455853 Transcript 0 0.00 0.13 0.00 0.05 0.03 0.00 0.35 0.00 0.41 0.20 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.04 2.85 0.50 0.06 51.52 35.62 3 444465 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.27 0.66 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.13 8.04 2.77 0.00 58.39 79.83 4 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.68 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 E1_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.58 0.00 2.43 0.00 0.00 4.10 6 ER1b ExonRegion 0 0.00 0.53 0.00 0.00 0.00 0.00 0.65 0.00 0.72 0.11 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10.43 3.57 0.57 71.25 57.32 7 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 43.11 15.11 8 E1a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13.18 5.31 0.00 67.11 111.31 9 I1 Intron 0 0.04 0.49 0.05 0.11 0.01 0.01 0.22 0.02 0.70 0.29 0.01 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.38 6.03 1.30 0.06 14.89 35.81 10 I1_SR2 SilentIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.71 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.27 0.63 0.00 3.10 19.98 11 I1_AR3 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.14 0.00 1.36 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13.28 1.96 0.00 6.83 15.09 12 I1_SR3 SilentIntronRegion 0 0.02 0.65 0.00 0.00 0.00 0.00 0.36 0.08 1.03 0.22 0.00 0.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.16 7.62 1.33 0.07 7.64 16.95 13 I1_AR4 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.34 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.46 4.28 2.12 0.00 5.83 29.23 14 I1_SR4 SilentIntronRegion 0 0.12 0.43 0.07 0.20 0.00 0.00 0.17 0.00 0.81 0.28 0.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.25 4.72 1.12 0.04 7.08 27.28 15 I1_AR5 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.21 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.43 0.35 0.00 0.44 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.12 8.18 0.83 0.00 4.58 33.67 16 I1_SR5 SilentIntronRegion 0 0.00 0.07 0.00 0.00 0.09 0.19 0.41 0.00 0.13 0.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.28 3.67 0.88 0.07 7.90 22.76 17 I1_AR6 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.19 2.13 1.65 9.12 39.64 18 I1_AR7 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.93 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.56 2.13 0.00 6.25 42.95 19 I1_AR8 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.85 6.37 2.13 0.00 4.51 45.03 20 I1_AR9 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.34 0.00 0.34 0.00 0.30 0.11 0.00 0.80 0.57 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.27 9.27 2.71 0.18 10.57 47.42 21 I1_SR6 SilentIntronRegion 0 0.03 0.60 0.07 0.14 0.01 0.00 0.17 0.01 0.65 0.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.44 5.48 1.41 0.06 17.82 43.43 22 I1_AR10 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.77 0.00 0.49 0.00 0.00 0.89 0.00 0.83 0.83 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.26 10.07 2.15 0.11 52.33 78.11 23 I1_SR7 SilentIntronRegion 0 0.00 0.60 0.26 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.75 1.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.56 2.17 0.00 59.69 143.20 24 I1_AR11 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.01 0.55 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.38 0.62 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.07 1.61 0.00 36.05 82.35 25 I1_SR8 SilentIntronRegion 0 0.00 0.48 0.22 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.66 0.82 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.28 1.42 0.00 34.23 51.65 26 I1_AR12 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.47 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.42 1.86 1.24 0.00 37.44 22.49 27 I1_SR9 SilentIntronRegion 0 0.05 0.36 0.00 0.05 0.00 0.00 0.21 0.00 0.60 0.43 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.40 4.72 1.01 0.00 28.47 52.47 28 E2_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17.15 30.39 29 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.40 0.00 0.16 0.10 0.00 0.36 0.00 1.22 0.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.11 8.55 1.49 0.17 111.44 91.74 30 I2 Intron 0 0.03 0.61 0.00 0.05 0.01 0.04 0.10 0.05 0.37 0.27 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.35 4.84 1.16 0.07 13.68 17.60 31 I2_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.16 0.00 0.30 0.33 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.31 3.53 1.73 0.30 44.47 28.16 32 I2_SR2 SilentIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.49 0.00 0.54 0.64 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.52 10.87 2.02 0.25 51.58 52.26 33 I2_AR2 ActiveIntronRegion 0 0.00 1.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.67 0.64 1.62 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15.29 2.40 0.00 63.33 57.78 34 I2_AR3 ActiveIntronRegion 0 0.00 1.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.62 2.38 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.69 0.00 0.00 54.77 46.99 35 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.75 0.34 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.17 2.66 0.00 54.35 76.07 36 E3_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.62 0.00 0.00 23.02 48.23 37 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 38.39 15.37 38 I3 Intron 0 0.00 0.49 0.00 0.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.38 0.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.49 1.09 0.08 31.25 41.25 39 I3_SR1 SilentIntronRegion 0 0.00 0.49 0.00 0.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.38 0.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.50 1.09 0.08 31.28 41.28 40 E4_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.95 0.00 0.00 20.45 58.64 41 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.34 0.62 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 12.81 3.11 0.00 73.71 116.58 42 IG16 Intergenic 0 0.06 0.35 0.00 0.02 0.01 0.01 0.04 0.03 0.16 0.46 0.00 0.02 0.16 0.00 0.00 0.01 0.02 0.28 4.37 1.34 0.04 7.91 15.91 43 IG16_SR12 SilentIntergenicRegion 0 0.04 0.08 0.00 0.21 0.00 0.00 0.11 0.05 0.49 1.88 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.58 8.63 1.30 0.27 44.71 73.12 44 IG16_AR17 ActiveIntergenicRegion 0 0.00 0.33 0.00 0.00 0.00 0.00 0.42 0.21 0.29 1.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.15 3.34 1.02 0.00 70.42 35.78 45 IG16_SR11 SilentIntergenicRegion 0 0.32 0.41 0.00 0.20 0.00 0.00 0.20 0.26 0.09 0.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.91 1.18 0.00 33.34 19.93 46 IG16_AR16 ActiveIntergenicRegion 0 0.00 1.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.23 0.33 0.92 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.98 13.99 0.57 0.00 42.46 58.36 47 IG16_SR10 SilentIntergenicRegion 0 0.09 0.49 0.02 0.03 0.01 0.01 0.05 0.03 0.24 0.56 0.00 0.08 0.14 0.00 0.00 0.01 0.04 0.43 6.05 1.24 0.03 7.29 23.13 48 IG16_AR15 ActiveIntergenicRegion 0 0.00 1.11 0.00 0.30 0.00 0.00 0.40 0.00 0.34 0.81 0.00 0.00 0.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.56 4.27 0.00 14.51 26.35 49 IG16_SR9 SilentIntergenicRegion 0 0.06 0.25 0.00 0.00 0.00 0.00 0.11 0.03 0.34 0.36 0.00 0.00 0.20 0.05 0.00 0.00 0.03 0.16 3.70 1.88 0.11 6.81 17.10 50 IG16_AR14 ActiveIntergenicRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.33 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.99 0.00 0.00 9.38 14.34 51 IG16_AR13 ActiveIntergenicRegion 0 0.14 1.38 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.54 0.00 0.00 0.00 0.00 2.12 3.57 0.00 8.89 8.07 52 IG16_SR8 SilentIntergenicRegion 0 0.05 0.25 0.00 0.00 0.03 0.01 0.02 0.01 0.12 0.27 0.00 0.02 0.08 0.00 0.01 0.03 0.01 0.21 3.52 1.22 0.03 5.38 12.68 53 IG16_SR7 SilentIntergenicRegion 0 0.00 0.43 0.00 0.00 0.00 0.00 0.12 0.00 0.00 0.20 0.00 0.00 0.81 0.00 0.00 0.00 0.00 0.33 4.43 1.09 0.00 5.03 14.15 54 IG16_SR5 SilentIntergenicRegion 0 0.07 0.33 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.18 0.43 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.39 6.44 2.41 0.00 5.83 11.73 55 IG16_AR8 ActiveIntergenicRegion 0 0.23 1.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.91 8.49 1.25 0.00 10.43 13.23 56 IG16_SR4 SilentIntergenicRegion 0 0.73 0.65 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.71 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 6.26 0.89 0.00 15.65 16.83 57 IG16_AR7 ActiveIntergenicRegion 0 0.00 0.78 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.75 5.45 3.83 0.00 8.14 14.23 58 IG16_SR3 SilentIntergenicRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.34 1.43 0.00 4.85 12.89 59 IG16_AR6 ActiveIntergenicRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.74 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.37 0.55 0.00 6.43 17.20 60 IG16_AR5 ActiveIntergenicRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.37 0.00 0.00 11.22 16.49 61 IG16_AR4 ActiveIntergenicRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.10 0.00 0.00 22.32 14.68 62 IG16_SR2 SilentIntergenicRegion 0 0.00 0.28 0.00 0.00 0.02 0.00 0.00 0.06 0.16 0.66 0.00 0.00 0.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.32 3.44 1.79 0.04 8.68 10.04 63 IG16_AR2 ActiveIntergenicRegion 0 0.00 0.66 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.30 1.17 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.30 4.43 1.45 0.00 9.07 9.02 64 IG16_SR1 SilentIntergenicRegion 0 0.00 0.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.04 0.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.06 4.46 2.43 0.00 8.21 8.61