Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 T Gene 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.03 0.00 542.54 59.67 302.68 1.12 0.00 15.71 1.03 0.14 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2 461348 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 61.36 21.33 36.39 0.00 0.00 3.14 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3 366871 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 34.22 6.30 25.81 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 296946 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5 366876 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.16 0.00 46.64 14.86 48.79 0.42 0.00 2.18 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 IG20_AR2 ActiveIntergenicRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 270.24 114.19 407.95 0.61 0.00 12.16 0.89 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 IG20_SR2 SilentIntergenicRegion 0 0.71 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 320.00 116.41 471.27 3.28 0.00 24.46 1.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 IG20_AR1 ActiveIntergenicRegion 0 0.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.18 0.00 498.15 114.52 478.94 2.06 0.00 35.33 1.61 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9 IG20_SR1 SilentIntergenicRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.08 0.00 154.80 25.90 71.54 0.98 0.00 9.53 0.84 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 120.20 42.65 72.78 0.00 0.00 6.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 ER1b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 259.29 34.15 136.65 0.00 0.00 15.78 0.53 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 E1a_E2b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 E1a_E2c KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.53 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 48.05 1.68 14.24 0.63 0.00 2.81 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 E2_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 39.38 0.00 12.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 ER2b ExonRegion 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 124.77 3.31 9.63 0.00 0.00 1.69 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 E2_Ac KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 145.77 6.30 6.82 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 ER2c ExonRegion 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 416.56 16.94 89.65 0.00 0.00 8.15 1.59 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 E2_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 56.86 0.00 19.80 0.00 0.00 12.99 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 463.64 24.31 112.98 0.00 0.00 15.72 4.58 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 627.72 30.76 166.01 0.90 0.00 20.88 3.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 796.94 50.72 295.11 4.83 0.00 33.32 4.77 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 E3a_E5a NovelJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.42 7.65 26.95 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 945.10 83.35 453.86 1.95 0.00 31.04 1.10 0.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 936.87 82.38 576.42 0.00 0.00 31.62 4.77 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 I4 Intron 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 98.47 34.64 111.99 0.30 0.00 3.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27 I4_SR1 SilentIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 98.69 34.72 112.26 0.30 0.00 3.95 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 28 E5_Aa NovelBoundary 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 44.12 29.86 241.87 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1261.68 157.99 700.97 1.94 0.00 27.53 1.46 2.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 30 E5b_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1337.60 145.10 683.23 7.00 0.00 32.98 0.00 1.62 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 31 ER5b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1405.22 147.20 684.74 4.87 0.00 32.69 0.00 3.70 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 32 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1112.79 102.86 532.02 4.45 0.00 23.01 0.00 2.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 33 E6_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 67.65 42.16 52.59 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 34 E6a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 672.06 72.62 300.47 0.00 0.00 11.62 0.00 1.62 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 35 E6a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 34.22 6.30 25.81 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 36 ER7a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1151.27 136.28 779.89 2.17 0.00 32.33 0.97 0.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 37 E7a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1003.78 178.86 1088.89 2.47 0.00 30.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 38 I7 Intron 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.11 0.00 50.98 15.62 62.66 0.00 0.00 1.56 0.39 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 39 I7_SR1 SilentIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.11 0.00 51.10 15.65 62.80 0.00 0.00 1.56 0.39 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 40 E8_Aa NovelBoundary 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.39 0.00 48.80 24.76 132.13 0.00 0.00 3.59 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41 ER8a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1053.30 128.29 926.61 3.72 0.00 49.20 0.00 0.92 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 42 E8a_E9a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 682.96 73.82 666.68 0.00 0.00 32.13 0.00 1.74 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 43 I8 Intron 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 61.88 12.26 61.52 0.22 0.00 3.14 0.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 44 I8_SR1 SilentIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 63.02 11.27 60.72 0.24 0.00 3.14 0.11 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 45 I8_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 52.34 21.28 69.49 0.00 0.00 3.14 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 46 ER9a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 587.64 74.81 358.25 1.42 0.00 13.05 1.19 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 47 E9_Da KnownBoundary 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 137.25 25.96 94.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 48 ER9b ExonRegion 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.32 0.00 45.23 28.03 83.34 0.20 0.00 1.56 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00