Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 C6orf123 Gene 0 13.33 4.25 7.81 0.72 5.91 20.79 5.92 4.53 2.54 0.73 1.29 3.25 3.45 2.26 4.51 4.24 2.75 1.51 4.47 5.06 2.51 1.49 4.89 2 340619 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 495520 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.58 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 366822 Transcript 0 11.80 0.42 13.53 0.63 4.91 22.97 4.33 7.23 3.31 0.53 0.00 0.00 0.48 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.88 0.00 0.65 0.61 5 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.29 0.57 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 ER1b ExonRegion 0 4.13 0.00 1.24 0.00 1.15 12.39 0.54 1.13 0.54 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.03 0.58 7 E1_Da NovelBoundary 0 3.48 0.00 0.00 0.00 4.16 30.49 0.00 6.74 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 2.51 0.00 0.00 2.50 0.00 0.00 1.68 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9 ER2a ExonRegion 0 1.53 0.01 3.93 0.00 0.84 27.53 2.01 1.96 2.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.71 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.68 1.28 10 E2a_E3a KnownJunction 0 3.78 0.00 5.14 0.00 8.66 34.87 2.21 1.97 1.53 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.77 11 ER3a ExonRegion 0 14.01 1.05 10.09 0.35 5.72 26.11 3.20 4.28 2.19 0.00 0.02 0.04 0.05 0.00 0.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 0.36 1.44 12 E3_Da KnownBoundary 0 35.34 0.00 14.16 0.00 11.29 40.15 4.15 17.17 6.34 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 E3a_E4a KnownJunction 0 3.48 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 ER3b ExonRegion 0 11.80 0.42 13.53 0.63 4.91 22.97 4.33 7.23 3.31 0.53 0.00 0.00 0.48 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.88 0.00 0.65 0.61 15 I3 Intron 0 5.26 0.30 8.94 0.59 5.47 19.29 3.87 2.82 0.27 0.12 0.00 0.00 0.34 0.00 0.22 0.00 0.00 0.00 0.23 0.00 0.00 0.15 0.21 16 I3_SR1 SilentIntronRegion 0 5.27 0.30 8.95 0.59 5.48 19.32 3.88 2.82 0.27 0.13 0.00 0.00 0.34 0.00 0.22 0.00 0.00 0.00 0.23 0.00 0.00 0.15 0.21 17 E4_Aa NovelBoundary 0 1731.34 1358.84 893.67 1047.05 1606.28 917.14 1484.35 1399.68 1000.83 971.41 520.13 166.40 159.41 165.46 411.40 1024.60 1035.90 1346.28 950.05 1320.98 832.64 641.54 1340.97 18 ER4a ExonRegion 0 18.29 9.02 6.54 1.19 8.58 19.41 9.63 4.54 2.76 1.37 2.89 7.30 7.50 5.07 9.58 9.53 6.18 3.39 10.05 10.92 5.65 2.79 9.89 19 ER4b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.58 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00