Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 RP1-69D17.2 Gene 0 0.25 0.00 1.94 0.36 0.79 0.54 1.41 0.30 0.54 0.50 2.74 2.15 2.10 2.00 2.32 0.53 0.78 0.00 0.00 0.50 2.60 0.00 1.39 2 430296 Transcript 0 0.07 0.00 0.47 0.21 0.09 0.06 0.51 0.18 0.33 0.26 1.25 0.43 0.36 0.85 1.12 0.43 0.19 0.00 0.00 0.36 1.08 0.00 2.11 3 419061 Transcript 0 0.00 0.00 1.68 0.00 2.99 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.95 1.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.29 0.00 1.09 4 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.48 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 E1a_E2b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 E2_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 3.31 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.06 0.00 7 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 1.68 0.00 2.99 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.95 1.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.29 0.00 1.09 8 E2_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 2.96 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12.75 6.49 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.97 0.00 0.00 9 ER2b ExonRegion 0 0.00 0.00 1.47 0.00 1.41 0.15 0.67 0.00 0.00 0.00 1.02 2.99 0.63 0.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.75 0.00 0.00 10 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 ER3a ExonRegion 0 1.12 0.00 5.41 0.00 0.00 3.74 4.19 0.00 0.98 0.00 4.91 5.59 10.02 5.45 3.26 0.00 3.51 0.00 0.00 0.00 4.94 0.00 0.73 12 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 1.83 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.32 0.00 0.00 7.65 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.35 13 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 2.45 0.00 0.00 0.00 0.76 0.00 0.00 1.97 5.59 8.66 4.52 6.50 0.00 0.00 1.41 0.00 0.00 1.44 5.04 0.00 2.83 14 ER4b ExonRegion 0 0.63 0.00 3.08 0.60 0.00 0.54 0.69 0.00 0.55 0.69 5.54 3.83 1.72 3.56 6.17 0.88 1.73 0.00 0.00 1.62 7.53 0.00 1.74 15 E4b_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 I4_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 1.10 0.00 0.00 1.28 0.12 0.00 0.87 4.90 6.12 32.99 1.90 0.00 5.23 2.67 0.00 0.00 0.00 5.51 0.22 2.43 17 E5_Aa NovelBoundary 0 16.74 12.63 163.30 207.47 8.06 2.90 60.81 216.58 228.04 192.63 2.00 7.50 60.22 2.94 6.06 12.05 23.00 165.81 0.00 28.00 5.99 2.76 12.29 18 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.26 0.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.12 0.00 0.00 2.12 19 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.54 20 I5_AR2 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.06 2.14 1.21 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 0.00 3.09 1.48 15.41 0.74 0.00 2.63 2.17 0.00 0.00 0.24 0.00 0.71 0.00 21 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.04 0.00 0.00 0.14 0.00 1.24 0.00 2.66 0.00 0.00 0.88 0.00 2.05 0.00 0.00 0.00 1.47 1.52 0.00 6.55 22 E6_Da NovelBoundary 0 3.56 2.83 1.63 2.06 0.00 0.00 2.25 5.38 0.00 1.18 2.11 0.00 26.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.76 0.00 23 E6a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 ER7a ExonRegion 0 0.00 0.00 1.16 1.28 0.85 0.00 3.73 1.64 1.19 1.63 3.08 0.00 1.23 1.71 3.92 0.95 0.00 0.00 0.00 0.00 0.70 0.00 0.00