Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 AL096711.1 Gene 0 0.00 0.00 0.05 0.06 0.00 0.05 0.04 0.04 0.00 0.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.12 0.00 0.00 0.03 0.00 0.00 2 368268 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3 446168 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 E1_Ab KnownBoundary 0 3.33 51.37 16.97 16.38 15.11 69.16 20.45 41.90 41.03 55.26 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 130.25 36.61 175.32 5.62 5.14 3.50 6 ER1b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.17 0.00 0.12 0.00 0.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 Ix Intron 0 0.47 1.34 4.63 2.46 1.47 2.42 5.25 2.55 2.43 5.09 0.21 3.14 0.00 4.91 2.22 3.27 2.18 5.57 7.02 0.70 14.08 3.67 4.85 9 Ix_SR2 SilentIntronRegion 0 1.27 0.39 2.35 1.83 1.32 3.30 2.24 1.92 2.31 4.45 0.00 0.00 0.00 3.57 1.37 0.89 2.72 3.37 6.56 0.04 14.40 2.83 3.52 10 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 0.00 2.31 4.80 2.62 0.58 0.00 17.68 3.32 2.77 8.28 0.00 3.98 0.00 4.83 0.16 2.89 0.71 7.29 11.97 2.13 20.91 0.79 1.83 11 Ix_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.00 1.84 6.19 2.93 1.64 2.24 5.43 2.89 2.45 5.01 0.39 5.23 0.00 5.85 3.10 5.02 2.02 6.83 6.59 0.92 12.69 4.68 6.32 12 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.30 0.00 0.00 0.38 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.47 0.00 0.00 13 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 Ix_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.53 1.46 2.15 3.44 0.67 0.92 5.41 1.45 1.92 3.07 2.24 6.22 3.10 3.82 0.97 4.44 0.99 3.55 12.46 3.99 10.25 4.02 5.14 15 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.04 0.00 0.00 16 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 Ix_SR5 SilentIntronRegion 0 4.55 43.32 16.33 32.02 20.06 32.13 53.85 27.11 21.11 21.84 0.06 2.56 0.43 1.00 0.55 1.30 2.99 23.96 12.48 30.67 1.13 1.02 1.28 18 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.93 0.00 0.00 0.85 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.16 0.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 Ix Intron 0 2.79 18.21 25.19 19.60 18.46 7.96 78.76 7.79 7.77 16.49 0.60 10.98 0.48 13.95 3.84 16.59 32.75 29.52 19.26 31.75 17.42 13.24 14.80 23 Ix_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.86 0.40 6.06 8.00 0.30 4.75 8.37 1.17 2.71 8.30 0.00 0.00 0.00 6.75 3.64 4.14 8.28 13.90 13.86 11.45 12.38 2.29 5.75 24 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 2.90 19.25 26.33 20.29 19.52 8.16 82.91 8.18 8.08 16.99 0.63 11.63 0.51 14.38 3.86 17.32 34.20 30.46 19.60 32.95 17.74 13.89 15.34 25 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 E6_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 2.81 3.76 4.24 0.00 0.00 1.81 1.77 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.67 4.80 0.00 0.00 2.82 0.00 27 ER6b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 28 E6b_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29 ER7a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 30 E7a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 31 ER8a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00