Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 C6orf58 Gene 0 0.49 1.42 0.61 0.88 1.87 2.26 1.46 1.46 2.15 0.97 0.39 0.74 1.19 12.81 5.79 0.10 5.39 0.43 0.53 1.77 0.22 0.42 0.20 2 498112 Transcript 0 0.39 1.53 0.89 1.02 2.23 1.41 1.20 1.51 1.52 0.98 0.14 0.24 0.21 2.13 0.28 0.16 0.36 0.15 0.41 1.14 0.36 0.89 0.16 3 329722 Transcript 0 0.50 0.86 0.33 0.51 1.14 3.27 0.98 1.62 2.59 0.86 0.33 1.47 0.88 19.05 8.38 0.00 6.78 0.43 0.26 2.17 0.00 0.76 0.07 4 IG23 Intergenic 0 1.76 5.48 5.49 11.16 4.99 23.76 14.96 20.83 24.61 25.51 0.40 0.37 0.40 1.60 0.64 0.00 3.08 95.68 53.48 88.88 9.82 1.08 2.74 5 IG23_AR1 ActiveIntergenicRegion 0 2.20 6.87 6.89 13.58 5.75 27.10 18.48 26.13 30.80 31.34 0.37 0.00 0.50 1.73 0.27 0.00 3.41 119.24 66.54 110.87 11.17 1.12 3.44 6 ER1a ExonRegion 0 1.85 3.56 2.39 4.33 1.17 4.00 5.19 0.00 2.91 1.53 0.00 1.89 1.68 1.67 0.89 1.30 2.88 1.20 1.39 2.78 2.86 2.72 1.28 7 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.71 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 ER2a ExonRegion 0 1.24 0.26 0.10 0.69 6.67 3.46 0.00 1.69 0.40 1.31 1.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.87 1.25 0.00 0.19 0.00 9 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 2.76 0.00 2.06 3.48 2.33 0.00 4.72 1.22 1.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.39 0.00 10 E3_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 6.09 0.00 16.07 0.00 0.00 0.00 1.61 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.77 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 ER3a ExonRegion 0 0.00 1.63 1.23 1.09 4.76 1.47 0.00 2.32 0.84 2.29 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.06 0.00 1.79 0.00 12 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 1.48 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.24 1.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.26 0.00 0.00 0.00 13 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.91 0.31 0.00 1.80 0.00 4.44 1.27 0.68 0.36 0.00 0.00 0.00 5.83 1.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.73 0.00 0.00 0.00 14 E4a_E6a KnownJunction 0 0.00 3.16 1.60 0.00 0.00 0.00 0.00 2.09 1.16 0.00 0.00 0.00 0.00 9.54 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.44 0.67 0.00 0.00 0.00 0.52 0.00 0.00 0.00 0.00 16 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 ER6a ExonRegion 0 0.00 1.57 0.00 0.00 0.00 0.00 1.44 1.57 0.00 0.00 0.97 0.00 0.00 10.41 8.04 0.00 3.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 ER6b ExonRegion 0 0.46 0.00 0.00 1.07 0.00 1.89 1.55 0.00 0.67 0.37 1.19 0.00 0.00 32.51 8.17 0.00 8.53 0.00 0.00 1.77 0.00 1.47 0.00 19 E6b_E7a KnownJunction 0 3.33 0.00 0.00 1.86 0.00 4.43 0.00 0.00 1.77 1.40 0.00 0.00 0.00 21.54 5.19 0.00 3.83 0.00 0.00 0.00 0.00 6.25 0.00 20 ER7a ExonRegion 0 0.42 1.68 0.00 0.18 2.21 5.40 1.82 0.64 4.39 0.73 1.07 0.00 3.19 31.48 6.35 0.00 7.51 0.70 0.00 2.79 0.00 0.63 0.81 21 E7a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.52 2.69 2.98 0.00 0.00 0.00 50.44 5.19 0.00 0.00 2.07 0.00 2.56 0.00 0.00 0.00 22 ER8a ExonRegion 0 0.00 0.04 0.00 0.00 0.85 2.49 1.35 2.14 4.12 1.09 0.98 0.00 3.99 27.53 8.36 0.00 13.73 0.59 1.61 4.15 0.00 0.00 0.00 23 E8a_E9a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 4.24 4.37 0.00 3.94 2.78 0.00 0.00 0.00 0.00 12.01 4.45 0.00 18.05 0.00 0.00 8.12 0.00 0.00 0.00 24 E9_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 3.16 7.98 2.38 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 0.00 12.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 ER9a ExonRegion 0 0.90 3.12 0.87 2.17 4.21 2.94 2.18 4.46 3.91 0.70 0.41 2.14 1.79 21.36 13.15 0.00 13.55 1.38 0.68 3.32 0.00 0.00 0.00 26 E9_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 7.56 0.00 0.00 2.55 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13.89 0.00 0.00 4.49 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27 E9a_E10a KnownJunction 0 0.00 2.83 1.48 0.00 0.00 12.49 3.36 3.57 5.93 0.00 0.00 12.60 0.00 2.12 31.28 0.00 4.77 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 28 ER10a ExonRegion 0 0.39 1.80 1.27 0.38 0.99 1.97 0.56 1.59 2.22 2.22 0.00 1.45 0.72 10.10 9.33 0.00 4.57 0.00 0.00 1.18 0.00 0.00 0.00