Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 RP11-352J4.1 Gene 0 1.19 0.23 0.16 0.23 0.60 0.04 0.60 0.52 1.74 0.54 0.30 0.89 0.53 0.34 0.55 0.13 1.93 0.12 0.22 0.48 2.08 0.47 0.40 2 453496 Transcript 0 1.37 0.00 0.00 0.00 1.61 0.00 0.00 0.00 0.54 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3 325649 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.33 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.61 1.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 E1_Da NovelBoundary 0 22.52 28.55 56.36 47.88 0.00 2.33 12.01 44.69 66.61 49.88 2.16 0.00 0.00 0.00 0.00 12.05 25.06 69.56 0.00 20.39 5.31 0.00 4.10 6 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 ER2a ExonRegion 0 0.56 0.54 0.00 1.61 0.00 0.00 0.35 0.68 1.29 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.89 0.00 0.00 0.00 0.58 0.00 0.00 8 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.39 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9 ER3a ExonRegion 0 0.84 0.81 0.00 0.00 0.84 0.00 0.12 1.03 2.72 0.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.90 0.00 0.00 0.00 0.17 1.50 0.00 10 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 3.57 0.00 1.90 0.00 4.25 1.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.53 0.00 0.00 11 ER4a ExonRegion 0 2.15 0.00 0.44 0.00 0.15 0.00 0.26 1.31 2.69 0.84 0.49 0.00 0.00 0.00 0.52 0.00 1.79 0.00 0.81 0.54 4.06 0.63 2.10 12 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.21 2.74 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.44 0.00 0.00 0.00 5.44 0.00 3.41 13 ER5a ExonRegion 0 1.02 0.00 0.80 0.00 1.21 0.00 0.14 2.15 2.48 2.09 0.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.98 0.00 0.21 1.78 4.43 0.22 2.14 14 E5a_E6a KnownJunction 0 2.89 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.94 0.00 2.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.77 0.00 0.00 0.00 5.75 2.69 4.35 15 ER6a ExonRegion 0 2.28 0.00 0.00 0.45 0.55 0.00 0.22 0.00 1.17 0.76 0.01 0.00 0.00 0.00 0.46 0.00 1.05 0.00 0.60 0.95 1.21 0.81 0.94 16 E6a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.36 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.84 0.00 0.00 17 ER7a ExonRegion 0 1.06 0.00 0.00 0.51 0.67 0.00 0.33 0.49 3.39 1.25 0.97 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.66 0.69 0.00 0.53 4.79 0.52 0.00 18 E7a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.01 2.81 1.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.07 0.00 0.00 19 ER8a ExonRegion 0 1.38 0.00 0.00 0.00 0.87 0.00 1.31 1.04 3.33 0.61 0.63 0.00 0.00 1.31 0.67 0.00 1.08 0.90 0.00 1.19 5.50 0.00 0.00 20 E8a_E9a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.50 0.00 7.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.99 0.00 6.26 7.91 0.00 0.00 21 ER9a ExonRegion 0 0.14 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.70 0.00 2.02 0.01 0.00 1.93 2.10 1.90 0.00 0.00 2.25 0.00 0.00 1.79 3.66 0.00 0.00 22 E9a_E10a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.81 0.00 0.00 0.00 23 ER10a ExonRegion 0 1.55 0.22 0.39 0.00 0.25 0.19 0.42 0.27 0.96 0.54 0.21 0.00 0.41 0.29 1.05 0.63 3.42 0.00 0.00 0.17 1.39 0.00 0.00 24 E10_Da NovelBoundary 0 65.72 42.62 111.32 96.42 26.83 17.26 37.85 145.03 71.87 69.33 11.85 0.00 0.00 2.30 26.33 22.22 17.95 103.76 17.79 13.36 21.37 52.29 76.57 25 E10a_E11a KnownJunction 0 2.74 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 E10b_E11b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27 ER10b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.22 2.18 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 28 E11_Aa NovelBoundary 0 32.67 42.16 143.64 221.35 53.23 53.95 36.48 198.02 203.50 203.94 11.48 7.65 5.68 7.53 38.20 69.55 37.59 333.91 16.94 39.18 30.27 19.29 65.56 29 E11_Ab NovelBoundary 0 6.22 4.87 20.49 15.12 0.00 12.89 11.13 28.42 12.09 13.51 0.00 0.00 5.84 0.00 0.00 7.35 0.00 33.54 8.09 10.74 8.28 4.41 0.00 30 ER11a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 3.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.32 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 31 ER11b ExonRegion 0 0.77 0.74 0.00 0.00 1.93 0.00 2.16 0.00 1.34 0.00 0.35 6.52 2.85 0.90 1.49 0.00 1.20 0.00 0.58 0.00 0.40 1.51 0.00