Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 RP3-402H5.1 Gene 0 0.30 8.99 0.75 0.11 0.34 0.30 0.09 0.09 1.25 0.12 1.94 0.00 0.07 0.10 0.00 0.00 0.00 3.57 1.20 33.35 15.96 1.60 4.78 2 339488 Transcript 0 0.13 3.72 0.11 0.06 0.08 0.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.64 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.12 0.27 12.96 4.57 1.07 0.72 3 244795 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4 IG41_AR6 ActiveIntergenicRegion 0 0.26 4.24 0.23 8.88 4.65 0.00 0.16 3.21 1.37 2.05 3.75 1.93 3.46 1.28 1.48 2.95 1.64 30.07 2.33 9.01 5.88 1.50 7.59 5 IG41_SR5 SilentIntergenicRegion 0 1.41 3.68 1.14 11.25 5.88 0.41 1.05 1.71 0.86 1.36 1.65 2.10 0.88 0.31 1.23 3.35 0.91 23.10 1.79 5.81 2.94 2.33 6.13 6 IG41_AR5 ActiveIntergenicRegion 0 0.35 0.84 0.58 4.89 2.90 0.43 0.90 0.46 1.00 1.28 2.52 0.38 4.02 0.58 0.71 3.79 0.84 18.04 1.10 3.61 4.98 0.97 5.67 7 IG41_SR4 SilentIntergenicRegion 0 0.46 3.09 0.55 9.01 4.22 0.78 0.79 0.70 1.33 1.82 3.49 1.75 2.82 0.46 0.71 2.29 1.16 22.96 0.97 5.94 2.14 2.53 6.23 8 IG41_SR3 SilentIntergenicRegion 0 0.90 4.37 0.52 9.22 3.98 0.70 1.17 1.37 1.09 2.04 2.19 1.94 2.17 0.87 1.65 2.02 1.63 19.22 0.56 6.81 3.89 1.07 4.29 9 IG41_AR2 ActiveIntergenicRegion 0 0.84 17.21 0.00 2.43 0.71 1.22 0.70 0.34 0.73 0.45 1.54 0.00 0.51 0.15 0.00 0.00 0.00 1.47 2.12 9.80 0.29 0.87 1.22 10 IG41_AR1 ActiveIntergenicRegion 0 1.07 10.26 0.00 0.86 2.49 0.78 0.34 1.37 0.62 1.16 1.51 0.00 1.31 0.00 0.17 0.50 0.56 16.67 1.29 16.50 11.42 3.01 8.56 11 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.61 0.00 1.18 0.00 0.00 0.00 12 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 Ix_AR10 ActiveIntronRegion 0 0.87 47.40 0.25 1.39 11.37 1.01 1.45 1.06 2.78 0.23 2.38 0.00 0.00 0.00 1.12 0.00 0.00 11.58 4.80 14.00 4.23 2.29 4.03 14 Ix_SR7 SilentIntronRegion 0 1.21 43.46 0.00 0.89 6.43 0.00 0.76 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.37 0.00 0.00 3.16 0.00 9.13 0.72 0.00 1.68 15 ER2a ExonRegion 0 0.00 1.51 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.36 0.00 3.86 0.99 0.26 0.31 16 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 Ix_SR2 SilentIntronRegion 0 0.79 50.10 0.39 1.21 2.10 0.22 0.20 0.21 0.57 0.32 0.23 0.05 0.05 0.02 0.01 0.00 0.00 1.12 0.51 7.12 0.73 0.48 1.72 18 ER3a ExonRegion 0 0.00 7.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.98 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.55 1.62 40.59 17.11 2.92 2.39 19 E3_Ab KnownBoundary 0 0.00 12.63 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.55 9.60 62.89 32.74 0.00 12.72 20 ER3b ExonRegion 0 0.42 13.26 1.28 0.14 0.53 0.49 0.18 0.17 2.33 0.23 3.25 0.00 0.13 0.18 0.00 0.00 0.00 5.57 2.12 52.01 26.58 2.12 8.35 21 E3_Da KnownBoundary 0 0.00 18.62 3.93 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.74 0.00 4.95 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.40 0.00 30.10 14.83 3.12 0.00 22 ER3c ExonRegion 0 0.79 13.24 0.66 0.38 0.50 0.34 0.00 0.00 0.00 0.00 0.85 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.20 0.00 32.12 9.31 3.25 1.63 23 IG40 Intergenic 0 0.25 33.82 0.12 0.20 0.97 0.75 0.02 0.02 0.85 0.12 0.38 0.03 0.01 0.00 0.01 0.01 0.02 0.92 0.21 25.56 1.24 0.40 0.60 24 IG40_SR11 SilentIntergenicRegion 0 0.02 5.87 0.12 0.06 0.48 0.25 0.01 0.05 0.53 0.18 0.76 0.19 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.77 0.14 34.25 3.04 0.69 1.22 25 IG40_AR10 ActiveIntergenicRegion 0 0.00 5.33 0.00 0.00 0.24 0.33 0.00 0.00 0.17 0.00 0.52 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.49 0.00 32.28 0.04 0.00 0.53 26 IG40_SR10 SilentIntergenicRegion 0 0.12 16.17 0.00 0.10 0.49 0.35 0.07 0.04 0.96 0.09 0.39 0.00 0.00 0.02 0.00 0.00 0.08 1.52 0.16 38.06 1.36 0.42 0.61 27 IG40_AR9 ActiveIntergenicRegion 0 0.74 43.44 0.00 0.91 0.48 0.82 0.00 0.00 1.27 0.91 0.52 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.23 0.57 44.14 1.38 1.27 1.51 28 IG40_SR9 SilentIntergenicRegion 0 0.00 26.99 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.19 0.00 1.14 1.47 29 IG40_AR8 ActiveIntergenicRegion 0 0.00 29.28 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.11 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17.34 0.00 0.00 0.00 30 IG40_SR8 SilentIntergenicRegion 0 0.11 50.83 0.07 0.27 0.71 1.49 0.00 0.00 1.19 0.13 0.84 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.68 0.00 48.83 2.21 0.59 0.78 31 IG40_AR7 ActiveIntergenicRegion 0 2.12 25.27 0.00 0.00 0.00 1.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20.36 2.20 0.00 0.00 32 IG40_SR7 SilentIntergenicRegion 0 0.00 48.97 0.00 0.95 0.00 1.97 0.00 0.00 0.31 0.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.42 0.00 38.82 2.22 0.11 0.00 33 IG40_AR6 ActiveIntergenicRegion 0 0.00 58.97 0.00 0.00 0.00 1.83 0.00 0.00 1.62 0.71 1.93 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.70 2.94 51.23 1.02 2.08 0.00 34 IG40_SR6 SilentIntergenicRegion 0 0.00 75.64 0.00 0.36 2.85 0.72 0.00 0.00 2.07 1.15 1.47 0.00 3.26 0.00 0.00 0.00 0.00 2.73 2.70 68.96 4.07 1.22 0.00 35 IG40_AR5 ActiveIntergenicRegion 0 0.22 103.31 0.19 1.02 3.52 3.05 0.00 0.00 2.14 0.12 0.75 0.00 0.33 0.00 0.00 0.00 0.00 1.67 0.98 54.53 1.83 0.73 0.96 36 IG40_SR5 SilentIntergenicRegion 0 1.61 206.27 1.07 1.11 6.59 4.25 0.08 0.05 4.32 0.35 0.66 0.00 0.00 0.00 0.00 0.12 0.00 3.20 0.92 64.05 3.00 1.30 1.12 37 IG40_AR4 ActiveIntergenicRegion 0 4.96 372.88 2.32 1.88 11.46 5.84 0.00 0.00 3.41 0.00 1.20 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.59 4.71 93.01 2.98 1.33 6.91 38 IG40_SR4 SilentIntergenicRegion 0 1.32 98.39 0.16 0.16 2.27 1.38 0.00 0.00 1.00 0.27 0.51 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.34 0.51 16.93 0.35 0.25 1.07