Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 UNC5CL Gene 0 2.06 0.24 1.69 2.22 2.19 1.16 0.95 1.36 1.54 1.72 0.76 0.37 0.28 1.17 0.68 1.12 0.11 1.04 1.31 0.80 0.38 0.64 0.20 2 244565 Transcript 0 0.09 0.00 0.00 0.02 0.05 0.14 0.03 0.22 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.49 0.04 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3 373164 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4 470102 Transcript 0 0.00 0.00 7.84 5.86 3.90 2.44 0.00 2.38 3.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.43 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 0.00 0.00 0.00 0.99 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 ER2a ExonRegion 0 0.48 0.00 0.63 0.00 0.00 0.00 0.00 0.56 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.24 0.00 0.34 0.00 0.57 0.36 0.00 0.00 0.00 0.00 7 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 ER3a ExonRegion 0 0.36 0.00 0.00 0.49 0.48 1.24 0.45 0.47 0.28 1.18 0.00 0.00 0.00 0.49 0.00 0.00 0.00 0.66 0.86 0.72 0.00 0.39 0.00 9 E3_Da NovelBoundary 0 16.23 0.00 4.73 2.06 24.36 0.00 4.46 4.39 9.72 13.91 2.58 0.00 0.00 9.42 5.19 3.33 0.00 2.20 12.80 6.39 8.59 6.00 8.45 10 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 1.33 2.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.22 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 0.00 2.53 4.80 0.00 0.00 0.00 0.00 11 I3 Intron 0 8.54 1.08 5.24 9.93 12.79 2.92 4.22 12.04 7.24 12.17 10.27 3.27 3.05 4.61 5.98 3.16 1.40 6.54 10.49 5.43 3.28 4.87 3.74 12 I3_SR1 SilentIntronRegion 0 8.58 1.08 5.26 9.97 12.85 2.93 4.24 12.09 7.26 12.22 10.31 3.29 3.06 4.63 6.01 3.17 1.41 6.57 10.54 5.45 3.29 4.89 3.76 13 ER4a ExonRegion 0 4.82 1.94 5.29 9.30 10.44 2.30 4.22 5.17 9.14 9.95 3.03 2.22 0.97 5.78 2.65 2.84 0.00 4.18 4.48 3.64 3.51 3.82 0.94 14 E4_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 4.05 8.26 16.13 0.00 0.00 4.60 16.52 5.72 0.00 0.00 8.12 4.94 12.11 0.00 0.00 7.21 0.00 3.13 0.00 5.51 0.00 15 ER4b ExonRegion 0 5.75 0.00 6.82 9.32 6.78 0.93 1.97 3.27 7.24 4.06 2.95 0.84 0.82 6.95 4.65 0.20 1.63 4.23 2.16 0.66 1.09 3.26 0.00 16 E4_Da NovelBoundary 0 3.78 0.00 1.15 0.00 0.00 7.33 0.00 4.64 1.19 4.27 2.63 0.00 0.00 6.89 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.07 0.00 8.51 0.00 17 E4a_E5a KnownJunction 0 3.56 0.00 10.97 9.69 7.05 0.00 0.00 6.49 1.71 1.07 0.00 6.30 0.00 0.00 4.45 3.25 0.00 2.16 4.05 0.00 0.00 0.00 0.00 18 ER5a ExonRegion 0 9.73 0.04 4.30 6.29 7.53 4.53 3.31 5.00 7.73 5.94 3.90 1.02 0.05 5.45 4.78 4.25 0.16 3.33 7.37 1.06 1.10 3.06 0.00 19 E5a_E6a KnownJunction 0 3.04 0.00 1.24 2.70 0.00 2.73 0.00 0.00 1.30 1.32 0.00 0.00 0.00 4.47 4.45 0.00 0.00 2.57 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 E5a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 7.84 5.86 3.90 2.44 0.00 2.38 3.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 ER6a ExonRegion 0 4.17 2.99 1.35 4.23 4.60 1.43 0.00 4.02 0.98 0.00 1.39 0.00 0.00 2.84 1.19 0.00 0.00 4.32 1.83 0.00 0.00 0.09 2.20 22 E6a_E7a KnownJunction 0 3.78 0.00 1.21 2.80 4.07 2.61 0.00 7.31 3.18 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.90 4.24 0.00 0.00 0.00 0.00 23 E7_Aa NovelBoundary 0 0.00 3.35 13.45 0.00 11.80 2.67 1.81 1.68 6.74 7.76 2.68 0.00 0.00 4.59 0.00 0.00 0.00 2.57 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 ER7a ExonRegion 0 16.11 0.48 11.17 8.33 10.04 4.19 3.20 6.08 3.78 3.47 3.46 1.80 3.85 2.20 1.03 6.74 1.50 1.96 15.11 4.09 2.23 2.25 0.00 25 E7a_E8a KnownJunction 0 19.93 6.31 11.15 8.86 7.98 2.90 1.77 4.27 3.18 3.30 4.63 0.00 0.00 4.59 0.00 10.60 0.00 3.69 3.67 6.14 0.00 0.00 0.00 26 ER8a ExonRegion 0 8.02 1.39 9.17 8.15 10.21 7.14 6.31 4.94 7.02 7.09 4.14 3.19 0.00 3.82 2.21 8.66 0.00 3.47 1.20 4.67 0.99 1.74 0.80 27 E8a_E9a KnownJunction 0 0.00 0.00 8.84 4.26 18.76 5.79 1.90 1.77 5.64 5.88 2.68 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.94 0.00 0.00 4.35 28 ER9a ExonRegion 0 1.78 0.00 2.22 5.73 2.88 2.02 1.60 2.44 1.21 4.51 0.74 0.00 0.88 0.68 0.47 2.72 0.00 1.12 0.00 2.09 0.00 0.48 0.92 29 E9_Da KnownBoundary 0 3.48 0.00 1.09 3.43 0.00 0.00 2.03 0.00 0.00 0.99 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.95 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 30 E9_Db KnownBoundary 0 3.33 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.36 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 31 ER9b ExonRegion 0 2.12 0.00 1.23 2.73 0.00 0.00 1.32 0.00 0.00 1.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.85 0.00 0.00 0.00 0.00 1.47 32 ER9c ExonRegion 0 0.18 0.00 0.00 0.04 0.10 0.28 0.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.08 0.00 0.00 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00