Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 ETV7 Gene 0 6.52 0.09 0.43 0.96 3.46 3.71 3.08 5.10 5.07 0.74 1.46 1.61 0.60 6.88 0.53 11.77 0.36 0.08 0.00 0.00 2.56 0.67 1.45 2 373738 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.18 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3 339796 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.06 0.00 0.00 0.00 1.99 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.35 0.00 2.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 373737 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 340181 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6 ER1a ExonRegion 0 0.36 0.00 0.00 0.00 0.45 0.43 0.69 0.00 0.31 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.17 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.18 0.00 0.00 7 E1_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10.29 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 ER1b ExonRegion 0 4.34 0.00 0.00 0.00 1.10 3.26 1.04 1.45 1.74 0.00 1.20 0.00 0.00 3.29 0.00 11.25 0.00 0.00 0.00 0.00 2.96 0.43 2.00 9 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.90 0.00 10.84 2.89 0.00 0.00 0.00 0.00 2.35 0.00 25.04 0.00 0.00 0.00 0.00 3.15 0.00 4.18 10 ER2a ExonRegion 0 1.99 0.00 0.00 2.28 1.00 3.55 0.99 5.11 5.67 0.00 3.50 5.32 0.00 5.67 0.43 17.31 0.00 0.00 0.00 0.00 2.90 0.78 1.88 11 E2a_E3a KnownJunction 0 3.78 0.00 0.00 1.80 0.00 2.16 0.00 7.31 6.08 0.00 4.37 0.00 0.00 11.65 4.45 28.28 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 E2a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.18 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 ER3a ExonRegion 0 3.18 0.00 0.56 1.26 1.65 4.08 1.12 6.04 4.84 1.56 2.38 1.13 0.00 5.78 0.91 12.39 0.00 0.00 0.00 0.00 3.47 1.29 1.07 14 E3a_E4a KnownJunction 0 12.30 0.00 0.00 0.00 0.00 6.64 1.99 2.55 2.95 0.00 4.69 0.00 0.00 7.06 0.00 31.87 0.00 0.00 0.00 0.00 2.90 0.00 3.41 15 ER4a ExonRegion 0 8.84 0.00 0.00 3.90 3.42 8.34 1.82 6.04 5.84 2.10 3.27 1.44 0.00 15.33 0.83 24.89 0.94 0.00 0.00 0.00 5.04 1.44 2.17 16 E4a_E5a KnownJunction 0 3.78 0.00 0.00 2.73 0.00 0.00 0.00 2.55 4.75 0.00 0.00 0.00 0.00 12.48 0.00 12.13 9.16 0.00 0.00 0.00 5.50 2.82 0.00 17 E4a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 ER5a ExonRegion 0 8.81 0.00 0.81 1.91 1.14 6.78 3.44 6.06 10.31 1.13 1.51 1.57 0.00 15.35 0.45 18.58 1.67 0.00 0.00 0.00 3.42 0.60 1.95 19 E5a_E6a KnownJunction 0 16.37 0.00 0.00 0.00 0.00 7.44 0.00 4.60 15.36 0.00 2.68 0.00 0.00 12.24 0.00 4.10 0.00 0.00 0.00 0.00 2.84 0.00 0.00 20 ER6a ExonRegion 0 11.06 0.64 1.95 3.62 11.38 9.73 8.24 15.19 16.06 0.61 2.83 3.33 2.75 16.34 1.58 18.85 1.18 0.00 0.00 0.00 8.78 0.07 4.19 21 E6a_E7a KnownJunction 0 13.48 2.43 0.00 0.00 0.00 5.00 0.00 23.33 14.55 0.00 2.47 6.30 0.00 16.72 0.00 47.51 0.00 0.00 0.00 0.00 11.55 0.00 0.00 22 ER7a ExonRegion 0 14.21 0.12 0.92 1.50 5.03 1.91 7.22 15.76 12.89 0.64 1.84 7.89 4.32 16.29 0.00 27.69 1.67 0.00 0.00 0.00 5.37 0.95 0.81 23 E7a_E8a KnownJunction 0 30.89 0.00 0.00 2.06 7.64 2.67 0.00 13.97 13.72 1.37 2.68 0.00 0.00 16.42 0.00 23.50 0.00 0.00 0.00 0.00 2.53 0.00 4.35 24 E7a_E9a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.55 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.94 0.00 4.19 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 ER8a ExonRegion 0 12.65 0.18 0.66 0.27 7.75 4.17 5.93 7.12 5.48 1.42 1.65 1.92 1.04 7.44 0.89 13.63 0.00 0.33 0.00 0.00 1.82 1.31 1.96 26 ER8b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27 I8_AR1 ActiveIntronRegion 0 2.12 0.00 3.23 6.94 73.46 0.00 37.19 0.00 0.90 2.29 0.00 1.57 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 28 I8_SR2 SilentIntronRegion 0 2.12 0.00 1.23 7.27 64.22 0.00 40.38 0.00 1.24 2.29 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29 I8_AR2 ActiveIntronRegion 0 1.41 0.00 0.41 6.81 38.61 0.00 26.92 0.25 1.24 3.44 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 30 ER9a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.12 0.00 0.00 0.00 1.43 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.77 0.00 1.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00