Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 ZNF311 Gene 0 4.25 0.29 1.11 0.95 2.62 1.00 0.53 0.79 0.74 0.69 1.30 14.85 0.12 0.02 0.75 1.00 0.11 0.37 0.00 9.09 5.70 2.58 3.21 2 483450 Transcript 0 1.73 0.00 0.42 0.30 2.91 0.09 0.92 0.50 0.16 0.00 0.08 3.57 0.00 0.00 0.75 0.93 0.00 0.00 0.00 3.89 2.29 0.89 1.18 3 377179 Transcript 0 0.61 0.00 0.11 0.38 1.73 0.00 0.53 1.43 0.00 0.61 2.11 7.25 0.66 0.11 0.17 0.00 0.00 0.00 0.00 4.39 2.07 1.48 1.29 4 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 1.22 13.33 0.16 1.18 0.15 0.00 0.00 0.00 0.61 0.00 0.00 1.83 0.31 0.00 0.00 0.00 5.64 6.46 2.12 2.16 5 E1_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 1.90 17.32 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.70 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.25 0.00 3.50 6 ER1b ExonRegion 0 2.57 0.00 0.50 0.96 4.49 0.71 0.50 2.75 0.74 0.35 0.78 23.37 0.00 0.00 0.41 2.01 0.00 0.00 0.00 8.30 5.37 2.92 1.29 7 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 3.14 0.00 1.63 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.26 0.00 0.00 0.00 8 E1a_E2b KnownJunction 0 0.00 0.00 1.71 0.00 0.00 0.00 0.00 2.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.36 0.00 0.00 0.00 2.43 2.90 0.00 0.00 9 ER2a ExonRegion 0 2.43 0.00 0.46 0.25 3.76 0.00 0.50 1.37 0.00 0.80 1.28 21.65 2.63 0.45 0.70 0.02 0.00 0.00 0.00 5.49 2.42 0.67 2.00 10 E2_Ab KnownBoundary 0 3.63 0.00 1.57 1.90 0.00 0.00 0.00 2.55 0.00 1.56 0.00 39.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.27 0.00 0.00 0.00 11 ER2b ExonRegion 0 2.08 0.00 0.71 0.56 2.29 0.00 0.04 2.29 0.79 1.20 4.14 21.83 0.00 0.00 2.19 0.67 0.00 0.00 0.00 12.71 7.30 5.08 1.68 12 E2_Da KnownBoundary 0 3.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25.21 0.00 0.00 4.45 0.00 0.00 0.00 0.00 7.93 5.50 3.12 4.10 13 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.35 0.00 0.00 7.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.07 5.87 5.27 0.00 14 ER2c ExonRegion 0 2.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.76 0.00 0.00 0.00 0.00 8.39 0.00 0.00 1.09 0.00 0.00 0.00 0.00 6.69 1.24 0.95 2.08 15 E2b_E3a KnownJunction 0 3.78 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 ER3a ExonRegion 0 1.86 0.00 1.57 1.26 0.00 0.00 0.79 1.64 0.21 1.05 2.48 18.37 0.00 0.00 1.24 0.00 0.00 0.00 0.00 14.30 5.64 1.58 0.00 17 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 3.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.30 0.00 0.00 18.31 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.26 2.97 2.88 0.00 18 ER4a ExonRegion 0 1.17 0.00 1.24 0.00 4.48 0.00 0.66 1.18 0.83 1.32 1.13 12.71 0.00 0.00 0.57 0.00 0.00 0.00 0.00 8.60 5.56 4.87 3.51 19 E4_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 1.80 0.00 0.00 0.00 0.00 1.81 0.00 0.00 0.00 12.15 0.00 0.00 4.45 0.00 0.00 0.00 0.00 14.70 5.50 7.84 3.84 20 E4a_E4b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 1.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.64 0.00 7.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.75 0.00 0.00 3.16 21 ER4b ExonRegion 0 2.78 0.00 0.38 0.30 1.19 0.27 0.64 0.07 0.80 0.00 0.39 8.84 0.00 0.00 0.82 0.00 0.00 0.00 0.00 4.68 0.83 1.36 1.64 22 E4_Ab KnownBoundary 0 9.56 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.90 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.99 0.00 0.00 0.00 23 ER4c ExonRegion 0 4.79 0.00 0.74 0.00 0.76 0.74 1.51 0.00 0.80 1.11 2.02 15.15 0.00 0.00 0.69 0.00 0.00 0.00 0.00 8.44 3.57 0.36 1.65 24 E4b_E5a KnownJunction 0 3.56 0.00 0.00 1.63 8.32 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11.85 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18.09 0.00 3.06 3.76 25 ER5a ExonRegion 0 1.63 0.00 0.00 0.18 2.45 0.00 0.00 0.00 0.21 0.54 0.94 19.83 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.40 3.19 1.65 3.86 26 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 1.50 4.16 0.00 0.00 0.00 1.42 1.56 0.00 12.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.26 0.00 0.00 0.00 27 ER6a ExonRegion 0 5.63 0.52 1.55 1.31 2.45 1.56 0.41 0.58 0.87 0.79 1.37 14.04 0.00 0.00 0.68 1.43 0.19 0.65 0.00 10.20 7.24 2.95 4.24