Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 C6orf114 Gene 0 0.35 0.61 0.37 0.07 0.00 4.65 0.13 0.09 0.06 0.00 0.84 0.00 1.17 0.70 0.20 0.50 0.44 0.00 0.11 0.14 0.00 0.00 0.00 2 379278 Transcript 0 0.86 0.93 0.96 0.20 0.00 8.04 0.28 0.25 0.18 0.00 1.82 0.00 2.14 1.19 0.60 0.97 1.30 0.00 0.31 0.42 0.00 0.00 0.00 3 ER1a ExonRegion 0 2.50 2.40 1.53 0.60 0.00 21.65 0.80 0.76 0.54 0.00 5.18 0.00 5.86 3.20 1.81 2.70 3.89 0.00 0.94 1.25 0.00 0.00 0.00 4 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 1.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 Ix Intron 0 3.77 5.71 2.07 2.88 1.93 2.42 4.83 1.47 3.48 1.93 5.69 5.67 20.22 4.52 6.22 9.88 1.99 2.70 1.33 6.25 0.35 0.14 0.83 6 Ix_SR3 SilentIntronRegion 0 4.81 5.70 1.86 2.64 1.41 2.11 4.10 1.31 2.87 1.96 6.34 7.15 24.85 5.04 6.16 8.40 2.14 2.36 2.01 7.06 0.43 0.09 0.86 7 Ix_AR3 ActiveIntronRegion 0 4.80 5.19 4.09 4.52 2.45 2.86 6.92 1.82 5.22 1.03 5.98 4.11 22.13 4.78 7.91 14.15 3.08 4.20 0.00 9.18 1.00 0.71 0.18 8 Ix_AR2 ActiveIntronRegion 0 5.91 5.73 2.82 3.20 4.42 3.01 12.70 0.00 5.37 0.81 3.64 4.50 45.72 4.09 9.16 9.40 2.54 0.54 0.00 8.82 0.00 0.00 0.00 9 Ix_SR2 SilentIntronRegion 0 2.80 5.92 2.35 2.94 2.21 2.59 5.01 1.69 3.57 1.84 4.84 4.11 17.17 3.72 6.71 10.24 1.51 2.66 1.17 5.09 0.17 0.16 0.81 10 E2_Aa NovelBoundary 0 3.41 9.93 3.67 3.73 0.00 2.16 17.31 0.00 4.66 1.42 4.95 12.60 13.64 10.01 0.00 11.54 0.00 0.00 0.00 2.56 2.84 0.00 0.00 11 ER2a ExonRegion 0 0.08 0.38 0.22 0.00 0.00 2.48 0.05 0.00 0.00 0.00 0.28 0.00 0.57 0.38 0.00 0.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00