Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 PCDHAC2 Gene 0 0.78 7.23 2.56 4.48 2.30 5.56 3.24 3.01 5.39 4.14 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 38.83 4.68 39.89 1.99 1.06 2.06 2 289269 Transcript 0 0.50 3.01 5.20 4.47 1.79 4.20 2.41 4.78 6.25 2.55 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 35.32 6.55 39.85 1.93 0.43 1.60 3 409165 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 2.09 0.00 0.00 2.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.32 0.81 3.40 0.00 0.00 0.00 4 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.66 0.70 0.88 0.29 2.98 1.15 0.56 2.70 2.48 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16.04 2.02 18.39 1.29 0.00 0.95 5 E1_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 5.03 1.80 0.00 0.00 0.00 0.00 1.68 2.95 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20.89 8.09 12.02 3.09 0.00 3.76 6 ER1b ExonRegion 0 1.52 15.70 5.32 9.65 5.02 11.50 6.93 6.43 11.27 8.89 0.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 82.88 9.97 85.20 4.25 2.39 4.42 7 E1_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11.90 4.14 5.75 0.00 0.00 0.00 8 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 8.95 19.28 15.08 6.62 12.72 8.74 18.36 17.71 5.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 109.27 32.10 138.51 6.30 0.00 4.35 9 ER1c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 2.09 0.00 0.00 2.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.32 0.81 3.40 0.00 0.00 0.00 10 ER2a ExonRegion 0 2.65 6.62 12.67 7.51 1.22 6.84 5.30 11.98 16.41 5.89 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 83.49 11.50 76.49 5.94 1.80 4.03 11 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 ER3a ExonRegion 0 0.67 4.16 3.69 7.76 4.27 6.35 1.59 2.47 6.76 4.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 37.27 0.00 44.68 0.00 1.19 1.81 13 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 Ix Intron 0 1.62 11.26 2.70 10.48 5.09 5.17 10.15 5.39 6.87 4.33 0.01 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22.10 8.24 27.59 0.17 0.05 0.19 15 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 1.60 7.87 1.86 8.36 3.96 3.97 9.89 4.37 4.75 2.81 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17.98 7.19 27.36 0.33 0.00 0.27 16 Ix_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.00 11.24 2.48 12.10 5.03 3.69 12.14 9.12 6.58 1.63 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13.93 8.80 42.02 4.38 0.00 0.00 17 Ix_SR2 SilentIntronRegion 0 0.84 7.35 1.55 7.22 3.30 3.77 9.46 3.70 5.07 3.50 0.00 0.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20.50 8.42 27.26 0.03 0.05 0.06 18 Ix_AR2 ActiveIntronRegion 0 2.20 14.36 1.92 12.77 6.40 8.68 7.68 5.20 10.62 7.26 0.00 0.34 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29.43 7.74 31.21 0.00 0.00 1.12 19 Ix_SR3 SilentIntronRegion 0 3.49 25.19 6.86 21.06 10.85 9.75 12.59 10.94 13.69 8.16 0.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 31.06 9.44 27.70 0.19 0.15 0.21 20 ER4a ExonRegion 0 0.20 0.69 0.10 0.05 0.10 0.51 0.09 0.12 0.19 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.16 0.24 0.86 0.00 0.00 0.05