Order	SeqName	SeqType	IsAE	NBL01_MYCN	NBL05_MYCN	NBL09_MYCN	NBL10_MYCN	NBL02	NBL03	NBL04	NBL06	NBL07	NBL08	NBL11_Rel2	NBL11_Rem1	NBL11_Rel1	NBL12_Rel_Left	NBL12_Rel_Right	NBL13_Rel_Left	NBL13_Rel_Right	NBL14_MYCN_Met	NBL14_MYCN_Pri	NBL15_MYCN_Rel1	SKP01	SKP02	SKP03
1	AC005592.2	Gene	0	0.65	0.54	0.48	0.27	0.83	0.24	0.12	0.45	1.38	0.83	0.00	0.32	0.34	0.12	0.09	0.79	1.02	5.67	0.56	3.10	8.55	5.79	19.82
2	443800	Transcript	0	1.64	0.17	0.19	0.58	1.42	0.29	0.06	0.13	1.18	0.76	0.00	0.53	0.00	0.03	0.00	0.43	0.66	2.51	0.28	3.46	14.11	8.06	22.44
3	425963	Transcript	0	1.19	0.00	1.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.40	0.00	0.00	0.56	0.72	0.00	0.00	0.56	0.00	4.00	0.60	1.60	2.89	7.57	12.37
4	414314	Transcript	0	0.12	0.46	0.21	0.23	0.15	0.21	0.07	0.29	1.16	0.10	0.00	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.37	1.60	0.00	0.96	2.62	0.47	4.98
5	IG33	Intergenic	0	0.55	0.52	0.50	0.43	1.02	0.24	0.33	0.66	1.70	1.14	0.02	1.58	3.03	1.78	0.93	2.99	5.83	17.02	2.93	13.26	9.80	3.63	21.20
6	IG33_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	1.38	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.22	0.93	0.00	0.00	2.53	0.31	2.68	5.79	9.10	9.05	6.25	7.20	31.39	9.54	35.28
7	IG33_SR2	SilentIntergenicRegion	0	0.00	0.28	0.00	0.00	0.24	0.00	0.00	0.23	0.67	0.93	0.00	0.76	0.00	2.89	0.36	2.88	6.52	12.41	3.64	9.98	7.93	1.28	11.71
8	IG33_AR2	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	1.37	0.22	0.00	0.66	0.00	0.16	0.63	0.86	0.63	0.00	1.55	0.58	4.56	0.50	1.12	8.69	23.13	2.81	13.14	10.67	2.08	12.02
9	IG33_SR3	SilentIntergenicRegion	0	0.97	0.90	0.56	0.37	1.25	0.40	0.50	1.01	1.76	1.66	0.03	3.39	4.28	3.79	1.59	5.09	8.64	24.83	5.08	22.47	10.25	4.40	21.99
10	IG33_SR4	SilentIntergenicRegion	0	0.84	1.01	0.46	0.80	1.28	0.45	0.32	1.04	1.49	1.21	0.04	2.23	6.16	2.41	1.07	2.84	8.70	17.78	2.82	19.15	8.40	5.52	19.48
11	IG33_AR4	ActiveIntergenicRegion	0	1.09	1.44	2.50	1.09	1.72	0.60	0.85	4.26	6.84	1.10	0.00	10.85	5.66	9.17	4.58	6.24	13.11	45.18	9.24	40.07	26.36	16.11	55.45
12	IG33_SR5	SilentIntergenicRegion	0	0.41	0.32	0.47	0.42	0.94	0.18	0.29	0.46	1.65	1.00	0.02	0.80	2.40	0.84	0.65	2.35	4.40	14.16	2.10	9.42	9.49	3.02	20.98
13	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.34	0.00	0.00	1.19	1.43	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.15	0.00	0.00	0.00	0.00	3.92	1.50	3.10
14	ER1b	ExonRegion	0	0.00	0.72	0.00	0.00	1.86	0.50	0.00	0.97	0.00	1.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.77	3.08	1.37	8.68	0.00	3.22	8.52	6.05	15.18
15	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.50	1.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.21	6.80	0.00	12.34	5.37	0.00	12.89
16	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.53	0.00	4.27
17	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	0.26	0.22	0.50	0.15	0.67	0.00	0.19	0.61	1.32	1.01	0.00	0.55	1.32	0.52	0.18	1.13	2.13	5.58	0.77	4.89	4.54	1.87	14.01
18	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.34	1.78	0.44	0.59	1.49	0.00	0.58	1.19	2.50	1.36	0.00	0.63	2.09	0.00	0.00	0.71	3.16	7.62	0.25	5.73	4.21	2.06	14.05
19	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	3.74	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.57	0.00	0.00	0.00	0.00	12.12
20	ER2a	ExonRegion	0	1.20	0.00	1.33	0.70	1.52	0.00	0.00	0.00	2.55	3.87	0.00	0.38	0.00	1.43	0.00	3.37	5.50	14.58	3.61	4.18	14.76	21.39	45.62
21	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	4.16	0.00	0.00	0.00	1.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.65	0.00	0.00	2.36	2.29	0.00	11.18
22	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.66	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.79	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.27	0.00	0.00	0.00	10.53	4.35
23	E2a_E4a	KnownJunction	0	3.63	0.00	0.00	2.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.69	17.24	10.41	35.43
24	I2	Intron	0	0.25	0.17	0.45	0.25	0.70	0.05	0.23	0.60	1.70	0.95	0.01	0.27	1.10	0.28	0.15	0.85	1.82	3.61	0.53	2.85	4.62	2.60	16.05
25	I2_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.22	0.00	0.73	0.84	1.66	0.00	0.55	0.35	2.07	1.49	0.00	0.37	0.40	0.14	0.00	0.00	1.52	3.38	0.00	1.99	2.84	1.61	10.78
26	I2_SR2	SilentIntronRegion	0	0.27	0.56	0.66	0.23	0.62	0.03	0.24	0.73	1.58	0.85	0.03	0.18	1.03	0.26	0.28	1.17	1.81	4.31	0.82	2.76	5.13	2.29	17.74
27	I2_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.33	0.32	0.73	0.54	2.78	0.00	0.00	0.40	2.80	1.62	0.00	0.00	2.51	0.00	0.32	1.79	3.87	2.16	0.50	4.80	4.33	2.07	14.93
28	I2_SR3	SilentIntronRegion	0	0.23	0.06	0.40	0.33	0.72	0.07	0.19	0.87	2.31	1.33	0.01	0.50	1.26	0.42	0.22	1.37	2.33	6.15	0.61	3.31	6.63	3.26	22.41
29	I2_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.54	0.00	0.94	0.52	1.19	0.31	0.00	0.44	1.96	1.01	0.00	0.61	1.73	0.92	0.04	0.25	1.03	4.11	1.22	4.45	6.70	3.48	13.41
30	I2_SR4	SilentIntronRegion	0	0.35	0.02	0.52	0.27	0.77	0.10	0.26	0.65	1.64	1.02	0.04	0.19	1.41	0.32	0.18	0.84	2.02	2.89	0.39	3.41	3.42	2.82	15.91
31	I2_AR4	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.12	0.50	1.94	0.00	0.00	1.07	1.66	0.46	0.00	0.00	0.00	0.33	0.50	2.31	2.64	4.50	1.17	2.06	5.22	3.40	23.36
32	I2_SR5	SilentIntronRegion	0	0.22	0.11	0.34	0.16	0.56	0.01	0.25	0.39	1.41	0.75	0.00	0.22	0.94	0.19	0.04	0.44	1.45	2.20	0.38	2.40	3.72	2.30	12.21
33	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.83	0.00	0.00	0.00	0.00	1.77	1.39	0.00	0.00	5.70	0.00	0.00	0.00	0.00	4.30	5.14	0.00	3.13	0.00	0.00	12.12
34	ER3a	ExonRegion	0	2.38	0.00	0.46	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.00	0.00	0.00	1.11	1.45	0.00	0.00	1.11	0.00	3.72	1.19	3.19	5.78	4.61	20.38
35	E3_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	3.23	0.00	1.99	2.55	1.13	2.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.93	2.45	0.00	5.75	0.00	5.27	12.21
36	I3_SR1	SilentIntronRegion	0	0.23	0.17	0.31	0.29	0.64	0.13	0.11	0.48	1.31	0.82	0.00	0.21	0.59	0.05	0.05	0.18	0.94	2.33	0.57	1.38	3.37	1.48	12.03
37	I3_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	1.31	0.36	0.47	0.00	0.00	1.12	1.56	0.85	0.00	0.00	0.68	0.00	0.00	0.00	2.54	6.07	0.00	1.48	9.88	8.41	27.34
38	I3_AR2	ActiveIntronRegion	0	4.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.24	1.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.97	0.00	0.00	3.19	0.00	8.81	8.33	8.81
39	I3_AR3	ActiveIntronRegion	0	4.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.24	1.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.96	0.00	0.00	1.19	0.00	8.36	12.94	10.65
40	I3_SR3	SilentIntronRegion	0	0.65	1.07	1.24	0.31	0.61	0.00	0.00	1.16	2.86	1.60	0.00	0.00	0.58	0.91	0.00	1.33	0.75	1.62	0.24	2.25	5.77	7.84	18.95
41	ER4a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.08	0.87	5.24	0.00	0.00	0.00	2.81	1.10	0.00	2.67	0.00	0.17	0.00	0.00	3.30	5.19	1.42	4.62	21.15	16.62	54.98
42	E4_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	3.14	0.00	0.00	0.00	9.26	4.41	0.00	6.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	11.52	4.80	3.00	21.68	35.58	76.91
43	ER4b	ExonRegion	0	0.77	0.00	0.00	0.00	0.41	0.00	0.00	0.00	3.18	1.15	0.00	0.85	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	4.96	1.45	5.42	23.51	21.56	56.78
44	E4_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	7.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.03	0.00	2.49	0.00	0.00	19.97
45	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.79	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
46	E4a_E6a	KnownJunction	0	3.78	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.67	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.75	20.51	8.57	4.01
47	I4_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.54	0.00	0.57	0.55	0.41	0.00	0.00	0.00	1.10	0.79	0.00	0.55	0.00	0.47	0.00	0.00	0.51	3.84	0.00	1.65	7.56	1.29	12.29
48	Ix	Intron	0	0.34	0.18	0.32	0.21	0.24	0.05	0.14	0.57	0.78	0.35	0.00	0.61	0.45	0.12	0.00	0.17	0.53	2.46	0.28	0.41	3.56	2.20	10.57
49	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.34	0.18	0.32	0.21	0.24	0.05	0.14	0.57	0.78	0.35	0.00	0.61	0.45	0.12	0.00	0.17	0.53	2.46	0.28	0.41	3.56	2.21	10.58
50	Ix	Intron	0	0.05	0.05	1.13	0.37	0.49	0.29	0.18	0.18	1.44	0.16	0.00	0.00	0.27	0.07	0.24	0.27	0.53	2.41	0.15	0.98	2.33	1.39	10.39
51	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.05	0.05	1.13	0.37	0.49	0.29	0.18	0.18	1.44	0.16	0.00	0.00	0.27	0.07	0.24	0.27	0.53	2.41	0.15	0.98	2.33	1.39	10.39
52	E5_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	4.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.26	0.00	0.00	12.21
53	ER5a	ExonRegion	0	0.24	0.91	0.41	0.46	0.30	0.41	0.15	0.58	0.52	0.19	0.00	0.00	0.43	0.00	0.00	0.00	0.74	3.20	0.00	1.91	5.24	0.94	9.95
54	E5_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.83	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.36	1.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.38	4.33	8.88	0.00	5.88	16.39
55	Ix	Intron	0	0.26	0.06	0.43	0.34	0.34	0.20	0.23	0.61	2.17	0.81	0.00	0.19	0.22	0.13	0.06	0.38	0.71	5.53	0.31	4.15	4.47	3.30	16.26
56	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.26	0.06	0.43	0.34	0.34	0.20	0.23	0.61	2.17	0.81	0.00	0.20	0.22	0.13	0.06	0.38	0.71	5.53	0.31	4.15	4.47	3.30	16.27
57	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.86	1.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.02	2.87	10.66	0.00	3.83	8.39	2.88	20.73
58	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.43	0.43	0.95	0.51	0.81	0.21	0.20	0.97	2.10	0.74	0.00	0.09	0.11	0.08	0.08	0.20	0.34	6.61	0.44	3.19	3.86	2.15	11.74
59	ER6a	ExonRegion	0	0.79	0.49	0.89	0.00	0.65	0.00	0.32	0.63	3.11	1.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.36	0.00	4.26	7.75	3.18	14.67