Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 GLRA1 Gene 0 0.44 4.49 5.32 0.72 1.26 7.72 3.94 10.23 1.14 2.82 0.23 0.86 0.45 0.16 0.18 0.17 0.29 3.86 1.41 8.52 0.06 0.18 0.26 2 455880 Transcript 0 0.00 1.87 0.00 0.00 0.00 2.38 0.00 1.19 0.47 0.55 0.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.04 0.00 0.71 0.00 3 274576 Transcript 0 0.00 1.43 0.00 0.00 0.00 1.82 0.26 0.63 0.00 1.08 1.49 0.59 0.11 0.00 0.00 0.00 1.55 0.00 0.00 3.50 0.00 0.00 0.00 4 IG24_AR2 ActiveIntergenicRegion 0 0.00 0.00 3.68 0.00 3.82 6.81 9.08 15.56 0.00 3.44 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13.46 0.00 4.26 0.00 0.00 0.00 5 ER1a ExonRegion 0 0.00 7.96 5.50 1.26 2.38 11.90 5.61 15.67 0.59 1.25 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.90 1.40 6.79 0.00 0.00 0.00 6 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 5.92 4.61 1.63 0.00 4.83 0.00 21.81 1.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.49 0.00 8.44 0.00 0.00 0.00 7 ER2a ExonRegion 0 0.00 3.73 4.07 1.39 0.98 2.64 3.63 15.33 1.40 1.99 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.48 0.00 9.72 0.00 0.00 0.00 8 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 3.35 11.00 0.00 0.00 0.00 6.14 15.16 2.34 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.91 0.00 11.63 0.00 0.00 0.00 9 ER3a ExonRegion 0 1.59 6.13 9.05 0.06 0.00 8.39 6.68 13.52 2.23 3.51 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.34 0.00 8.95 0.00 0.00 0.00 10 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 3.35 12.24 0.00 0.00 11.24 4.15 10.76 2.75 5.86 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.87 0.00 9.33 0.00 0.00 0.00 11 ER4a ExonRegion 0 0.86 4.02 9.26 0.46 0.61 7.13 4.01 8.20 1.64 4.22 0.00 0.81 0.88 0.00 0.00 0.00 0.00 3.69 1.25 6.63 0.00 0.00 0.00 12 E4a_E5a KnownJunction 0 3.11 0.00 13.01 0.00 0.00 16.64 5.61 7.39 2.63 4.92 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.55 4.24 3.26 0.00 0.00 0.00 13 ER5a ExonRegion 0 0.28 4.29 9.36 0.00 0.55 8.20 4.27 7.18 0.43 1.58 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.74 2.49 13.48 0.00 0.00 0.00 14 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 3.35 10.67 0.00 3.74 27.60 5.87 4.85 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.40 0.00 6.39 0.00 0.00 0.00 15 ER6a ExonRegion 0 0.78 4.21 7.95 0.00 1.65 6.47 5.14 11.45 0.37 2.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.76 0.00 0.00 6.15 2.12 6.94 0.00 0.77 0.00 16 E6a_E7a KnownJunction 0 0.00 9.34 7.01 0.00 3.99 0.00 3.49 15.28 1.79 3.49 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.30 12.42 18.47 0.00 0.00 0.00 17 ER7a ExonRegion 0 1.00 2.85 5.16 1.97 2.15 9.57 4.25 12.76 1.95 4.72 0.00 0.85 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.94 3.17 10.02 0.04 0.00 0.00 18 E7a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 3.19 0.00 3.48 11.98 5.87 3.82 0.00 3.57 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.20 0.00 3.26 0.00 0.00 0.00 19 ER8a ExonRegion 0 0.00 4.99 5.64 0.65 2.42 5.71 2.21 7.03 1.28 3.73 0.03 0.00 0.00 0.56 0.00 1.03 0.00 0.68 0.00 5.69 0.70 0.00 1.02 20 E8_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 1.74 0.00 0.00 7.33 6.27 10.76 3.21 1.67 0.00 18.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.03 0.00 19.11 0.00 0.00 0.00 21 E8a_E9a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.68 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.81 0.00 0.00 0.00 22 E8a_E9b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.21 0.00 0.00 0.00 1.42 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 ER9a ExonRegion 0 0.00 3.74 0.00 0.00 0.00 4.77 0.00 0.69 0.94 1.10 0.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.28 0.00 1.42 0.00 24 ER9b ExonRegion 0 0.37 2.20 0.96 0.00 0.00 7.01 2.44 5.15 1.21 3.13 0.66 3.63 1.99 0.67 0.72 0.52 1.04 4.20 1.68 11.69 0.00 0.61 1.03 25 E9_Da KnownBoundary 0 0.00 2.63 0.00 0.00 0.00 0.00 2.21 2.26 0.00 1.67 0.00 11.55 0.00 0.00 0.00 0.00 4.30 0.00 0.00 5.94 0.00 0.00 0.00 26 ER9c ExonRegion 0 0.00 2.87 0.00 0.00 0.00 1.42 0.52 1.26 0.00 0.73 2.99 1.18 0.21 0.00 0.00 0.00 3.10 0.00 0.00 7.00 0.00 0.00 0.00 27 IG23 Intergenic 0 1.56 5.10 2.50 2.12 3.04 18.40 7.05 7.59 1.42 3.59 0.85 5.17 2.98 1.49 0.52 1.10 2.00 2.66 2.33 10.05 0.48 0.65 1.07 28 IG23_SR3 SilentIntergenicRegion 0 1.43 6.22 2.89 2.53 4.37 15.77 7.21 9.67 1.47 3.18 1.48 5.03 3.41 2.02 0.90 1.58 1.86 2.56 2.67 11.47 0.80 1.31 1.64 29 IG23_AR3 ActiveIntergenicRegion 0 0.46 7.47 3.68 1.75 5.14 23.69 7.68 7.98 1.71 6.02 0.46 2.45 4.33 2.24 0.00 1.51 1.68 3.66 0.55 16.99 0.00 0.74 2.60 30 IG23_SR2 SilentIntergenicRegion 0 0.26 3.98 1.29 1.11 2.78 17.07 8.48 6.95 2.14 3.94 0.86 6.14 3.36 2.29 0.00 0.52 2.84 1.85 1.09 8.12 0.00 1.04 0.51 31 IG23_AR1 ActiveIntergenicRegion 0 0.49 3.62 2.25 2.04 3.68 20.15 7.14 9.75 1.29 4.51 0.32 1.99 1.68 1.44 0.34 1.30 1.90 3.84 1.57 8.53 0.18 0.17 0.24 32 IG23_SR1 SilentIntergenicRegion 0 2.25 7.57 3.84 2.98 4.44 30.60 8.84 10.73 1.53 5.04 0.89 5.85 2.68 1.37 0.59 1.20 2.93 3.21 2.21 12.68 0.51 0.72 1.25