Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 AC109482.1 Gene 0 0.32 0.51 1.05 0.41 0.07 0.23 0.27 0.13 0.28 0.26 1.55 0.00 2.25 0.00 0.00 0.00 6.21 1.11 1.04 1.07 0.11 1.04 0.29 2 498912 Transcript 0 0.12 0.18 0.37 0.14 0.02 0.09 0.14 0.04 0.10 0.10 0.53 0.00 0.76 0.00 0.00 0.00 2.27 0.44 1.03 0.40 0.05 0.51 0.15 3 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.13 1.70 0.00 0.00 0.86 0.00 6 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14.40 0.00 0.00 0.00 0.00 7 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.02 1.99 0.00 0.00 0.75 0.00 8 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9 E4_Aa NovelBoundary 0 28.30 78.28 57.63 24.34 12.22 15.67 8.70 6.82 7.78 16.57 50.64 0.00 6.82 0.00 10.75 3.16 71.81 11.86 18.17 25.69 11.61 53.64 32.10 10 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 1.24 0.04 11 E4_Da NovelBoundary 0 13.93 53.67 50.00 38.06 12.22 2.21 8.74 11.87 12.47 7.68 38.80 0.00 13.31 0.00 0.00 0.00 129.59 15.25 0.00 12.14 13.71 27.80 23.73 12 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.64 0.68 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.83 1.87 2.23 0.74 0.77 2.98 3.06 14 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 Ix_SR2 SilentIntronRegion 0 0.40 1.30 3.54 2.76 1.99 0.69 0.00 0.00 0.00 0.01 7.82 0.00 13.34 0.00 1.53 0.00 15.07 3.99 1.20 4.94 0.41 2.31 0.55 16 Ix_AR6 ActiveIntronRegion 0 0.00 2.97 1.70 0.37 1.47 0.00 0.24 0.94 0.34 0.61 15.81 0.00 10.41 0.49 0.75 1.09 11.98 6.17 2.31 4.85 1.61 0.81 0.54 17 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 0.00 1.72 1.97 1.18 0.00 1.49 2.46 0.00 0.08 1.22 6.60 0.00 8.26 0.00 0.00 0.02 16.59 2.51 0.00 1.70 0.00 1.55 0.78 18 E6_Aa NovelBoundary 0 6.37 2.43 1.18 4.13 0.00 0.00 0.00 2.46 1.77 1.02 9.63 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 36.19 1.87 0.00 2.43 0.00 0.00 0.00 19 ER6a ExonRegion 0 1.01 1.89 1.28 1.89 0.62 2.14 0.92 0.60 0.43 1.17 5.40 0.00 0.90 0.00 0.00 0.00 14.59 2.33 2.23 2.48 0.00 1.94 0.00 20 E6_Da NovelBoundary 0 3.78 0.00 0.00 2.76 0.00 0.00 6.76 0.00 0.00 0.00 14.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13.56 1.74 0.00 0.00 0.00 3.12 0.00 21 E6a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 ER7a ExonRegion 0 0.78 0.39 3.13 1.16 0.00 0.00 0.00 0.49 0.00 0.33 6.25 0.00 10.13 0.00 0.00 0.00 14.42 3.34 0.00 3.24 0.42 0.79 0.56 23 E7_Da NovelBoundary 0 0.00 3.09 5.94 0.00 0.00 0.00 1.63 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 14.28 0.00 0.00 0.00 18.79 3.69 0.00 11.95 0.00 3.12 0.00 24 E7a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 ER8a ExonRegion 0 1.14 0.55 2.94 0.55 0.00 0.00 0.36 0.00 0.99 0.00 1.04 0.00 5.41 0.00 0.00 0.00 7.09 0.00 0.00 3.42 0.00 1.12 0.00 26 E8a_E9a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27 ER9a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.98 0.00 0.00 0.01 0.00 2.47 0.00 28 E9a_E10a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29 ER10a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.11 0.00 30 E10a_E11a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 31 ER11a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 32 E11a_E12a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 33 ER12a ExonRegion 0 0.00 0.86 0.77 0.00 0.00 0.00 0.58 0.00 0.39 0.00 0.00 0.00 1.79 0.00 0.00 0.00 4.22 0.58 0.67 0.00 0.00 0.00 0.00 34 E12a_E13a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 35 ER13a ExonRegion 0 0.00 0.82 1.10 0.00 0.00 0.00 0.25 0.00 0.74 0.34 0.00 0.00 0.78 0.00 0.00 0.00 6.63 0.56 2.57 0.00 0.00 0.42 0.00