Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 TICAM2 Gene 0 0.72 0.59 0.36 0.05 0.84 1.32 0.81 0.74 0.58 0.81 2.43 0.27 0.53 2.27 0.92 3.07 5.06 2.80 0.21 0.95 6.90 3.08 5.58 2 408996 Transcript 0 0.00 0.00 0.52 0.00 0.00 0.78 0.46 0.00 0.00 0.00 2.08 0.00 0.00 0.25 0.11 0.23 1.65 0.00 0.00 0.08 1.86 0.00 1.13 3 282382 Transcript 0 2.95 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.62 0.83 0.00 0.00 0.00 2.30 2.60 2.18 0.00 1.22 0.00 0.00 4.11 4.35 3.47 4 427199 Transcript 0 1.38 2.74 2.93 0.19 2.43 1.98 1.71 7.53 1.28 5.96 12.26 3.18 11.47 12.17 5.57 14.92 44.31 0.00 0.00 0.60 30.50 9.58 4.22 5 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 1.04 0.00 0.00 1.55 0.92 0.00 0.00 0.00 4.16 0.00 0.00 0.50 0.22 0.46 3.30 0.00 0.00 0.16 3.73 0.00 2.26 6 ER1b ExonRegion 0 0.91 1.48 0.81 0.18 3.90 7.81 3.84 1.41 2.35 3.42 9.94 0.00 1.06 6.66 2.33 9.73 12.85 18.65 1.45 5.62 27.61 11.95 33.11 7 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 ER2a ExonRegion 0 0.99 0.84 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.33 0.00 0.00 0.00 0.28 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.43 0.00 9 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 Ix_AR3 ActiveIntronRegion 0 10.08 6.70 6.37 2.25 6.90 5.59 6.86 8.60 8.08 3.96 6.97 27.69 18.44 5.35 5.21 8.34 12.01 0.76 0.00 1.72 2.10 5.55 2.03 11 ER3a ExonRegion 0 0.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.39 0.68 0.00 0.00 0.69 0.27 0.60 1.26 0.69 0.00 0.00 1.52 1.99 1.42 12 E3a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 E3a_E5b KnownJunction 0 3.78 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.67 0.00 0.00 0.00 4.59 5.19 4.36 0.00 2.45 0.00 0.00 8.22 8.70 4.01 14 Ix_AR3 ActiveIntronRegion 0 10.12 21.42 17.49 21.16 23.20 13.85 18.62 14.93 26.07 34.75 7.05 39.62 22.66 6.83 7.75 1.57 10.24 6.17 6.02 17.63 6.84 62.87 25.16 15 Ix_AR2 ActiveIntronRegion 0 8.65 3.76 3.35 4.31 6.12 1.18 1.96 4.39 3.47 2.53 1.95 12.08 2.44 3.13 5.76 4.03 15.77 0.34 2.73 1.95 3.89 0.96 4.21 16 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 14.35 3.99 1.79 1.05 3.94 0.00 0.65 0.00 1.92 1.85 1.12 10.49 0.00 1.11 3.24 1.60 6.54 0.00 6.00 2.09 3.24 3.55 4.88 17 Ix_AR1 ActiveIntronRegion 0 2.16 0.95 0.00 0.95 1.25 0.00 2.48 3.62 0.75 1.43 9.79 0.00 1.81 6.50 9.93 6.82 16.93 0.00 0.23 0.00 8.23 1.49 2.21 18 E4_Aa NovelBoundary 0 9.41 0.00 3.46 2.06 0.00 0.00 1.94 4.72 7.15 1.29 2.68 0.00 0.00 4.83 0.00 7.43 8.79 0.00 4.80 3.26 24.09 5.63 6.74 19 ER4a ExonRegion 0 2.77 2.12 2.84 0.38 1.13 1.57 1.56 3.44 1.32 3.16 7.61 0.95 1.99 11.57 5.95 13.10 27.75 0.00 0.00 1.19 27.45 7.90 5.02 20 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 3.35 3.02 0.00 3.74 2.38 1.85 11.62 1.24 8.76 16.90 5.40 20.94 12.77 5.19 16.75 60.87 0.00 0.00 0.00 33.55 11.27 3.41 21 ER5a ExonRegion 0 0.02 1.23 0.98 0.00 1.73 0.34 0.96 3.79 0.94 1.54 10.31 2.18 2.40 6.55 2.46 9.39 31.21 0.02 0.00 0.00 17.35 11.73 3.75 22 E5_Ab KnownBoundary 0 6.82 0.00 1.83 0.00 3.74 0.00 0.00 5.50 2.81 0.99 27.11 0.00 0.00 7.42 0.00 15.21 36.93 0.00 0.00 0.00 9.08 11.63 6.91 23 ER5b ExonRegion 0 0.47 0.20 0.02 0.00 0.22 0.11 0.19 0.28 0.18 0.02 0.18 0.20 0.25 0.39 0.12 0.68 0.40 0.15 0.00 0.08 0.62 0.55 0.44 24 ER5c ExonRegion 0 4.84 0.00 0.00 0.00 1.91 0.00 0.00 0.25 1.94 0.00 0.00 0.00 0.00 1.39 0.00 1.70 0.00 0.00 0.00 2.13 2.20 0.00 2.94 25 ER5d ExonRegion 0 2.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.94 26 IG26_SR6 SilentIntergenicRegion 0 12.36 3.22 2.44 2.97 5.54 2.01 2.74 3.76 4.26 1.46 3.53 8.21 1.44 4.26 1.25 6.15 6.43 0.67 0.78 0.78 13.41 6.59 5.35 27 IG26_AR6 ActiveIntergenicRegion 0 8.25 3.22 2.44 2.25 4.62 6.60 2.28 5.16 7.39 4.55 3.17 6.08 2.85 3.81 0.89 8.24 9.12 0.57 0.38 1.38 16.33 7.34 7.64 28 IG26_SR5 SilentIntergenicRegion 0 10.74 5.91 7.87 4.82 2.68 9.61 3.48 0.03 10.29 5.78 9.13 3.37 2.61 4.21 1.61 6.66 11.19 0.99 0.00 0.00 22.93 7.87 8.32 29 IG26_AR5 ActiveIntergenicRegion 0 6.18 3.26 2.78 2.34 4.22 6.47 3.09 6.96 5.99 2.66 2.75 4.18 1.19 3.74 2.30 6.14 6.60 1.04 0.20 0.52 15.19 6.31 7.73 30 IG26_AR4 ActiveIntergenicRegion 0 7.79 0.00 2.11 2.36 10.02 1.20 2.53 2.66 4.69 1.56 0.00 2.28 2.53 2.08 1.71 0.00 2.16 1.49 0.00 0.00 7.20 9.48 6.40